riboPOOL適合任意物種的核糖體RNA去除方案

RNA測序是一種高度準確且靈敏的轉錄組追蹤工具。然而，一些豐度很高的RNA種類卻影響了NGS文庫制備，浪費了寶貴的測序資源。

在提取到的總RNA中，核糖體RNA（rRNA）占95%左右，mRNA占2-3%，還有2-3%是非編碼RNA，如Long non-coding RNA、tRNA、microRNA等。

所以，在RNA測序的過程當中，首先要解決的問題，是如何去除核糖體RNA（rRNA）。

riboPOOL是來自德國的核糖體RNA去除產(chǎn)品，能夠高效去除與研究無關的RNA，讓研究人員更高效地利用測序資源。

riboPOOL核糖體RNA去除方案，適合任意物種，去除效率高且效果穩(wěn)定，廣泛應用于RNA-seq、芯片、ribo-seq（ribosome profiling）等領域，在歐洲*。

riboPOOL由精心設計的生.物.素標記的DNA探針混合物構成，保證RNA完整的前提下，比Ribo-Zero（Illumina）多去除約10%的rRNA。

riboPOOL主要優(yōu)勢

1、任意物種

去除任意物種的rRNA或高豐度mRNA：豐富的成品型目錄可供選擇，目錄持續(xù)更新中；目錄以外的物種的rRNA，或者組織特異性的高豐度mRNA均可定制。

2、去除不依賴poly-A結構

適合非Ploy-A化的RNA（如snoRNA、lncRNA、組蛋白）的研究和原核生物。

3、廣泛的起始量范圍

在100 ng到5 μg的RNA起始量之間都有很好的去除效率。

ribPOOL特殊應用

1、原核通用型riboPOOL與環(huán)境基因組學

原核通用型不僅可以廣泛應用于各種原核生物樣本（細菌、古生菌），還可以處理含有不同微生物的復雜樣本，如環(huán)境基因組樣本（如土壤、污泥）。

2、去除高豐度RNA

除rRNA之外, riboPOOL還可以去除組織特異性mRNA（如人血珠蛋白）或其他測序時出現(xiàn)的不相關的高豐度RNA。

3、可應用于Ribosome profiling

riboPOOLs 可以應用于ribosome profiling樣本，更多信息，請聯(lián)系我們。

4、復合型riboPOOL可以去除混合樣本中的rRNA

復合型riboPOOL可以去除含多個物種的混合樣本中的rRNA。客戶可根據(jù)樣本的組成比例混合2-4種成品型riboPOOL使用，如病原體感染的人體組織（人源+原核通用型）、人血液樣本（人源+人血珠蛋白）。

實驗流程

實驗數(shù)據(jù)

人類樣本中，riboPOOL的去除效率是98.6%，而Comp Z的去除效率是80.6%。

小鼠樣本中，riboPOOL的去除效率是96.4%，而Comp Z的去除效率是86.1%。

2013年，siTOOLs Biotech公司由RNA領域的專家在慕尼黑和雷根斯堡成立，團隊涵蓋RNAi篩選、RNA生產(chǎn)和生物信息學等方面具有長期經(jīng)驗的科學家，產(chǎn)品在歐洲得到研究院校和制藥企業(yè)的廣泛認可，在中國的總代理是藍景科信。

siTOOLs Biotech主要產(chǎn)品線：

siPOOL—基因沉默工具（siRNA）

raPOOL—RNA捕獲工具

riboPOOL—核糖體RNA去除工具（riboPOOL適合任意物種的核糖體RNA去除方案）

實驗結果穩(wěn)定可重復，為您節(jié)約時間和成本。我們還提供先進的大數(shù)據(jù)分析工具(Phenovault)和研究服務，助力臨床前研究中的靶點發(fā)現(xiàn)和驗證。

核心技術

科學設計、集群效應，保證高效特異的作用于靶基因。

類似狼群所展示的群體智慧，我們利用集群的力量來實現(xiàn)具有挑戰(zhàn)性的目標?；诖死砟?，我們科學優(yōu)化設計siRNAs或生.物.素化探針混合物，并反復被證明可以顯著減少脫靶效應，實驗效率高，結果可靠且可重復。

核心文獻：

Hannus, M., et al.(2014) siPools: highly complex but accurately defined siRNA pools eliminate off-target effects. Nucleic Acids Res 42(12): 8049?8061.