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蛋白定量-Label-Free非標定量實驗流程介紹
閱讀:706 發(fā)布時間:2022-8-9非標定量(Label-free)
非標記定量(label-free)蛋白質(zhì)組學按其原理主要分為兩種方法:1) Spectrum counts類的非標記定量方法:發(fā)展比較早,已經(jīng)形成多種定量算法,但主要原理都是以MS2的鑒定結果為定量基礎,各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數(shù)據(jù)上的修正。 2) 以MS1為基礎,計算每個肽段的信號強度在LC-MS色譜上的積分,Maxquant是現(xiàn)代高靈敏度質(zhì)譜(High resolution of modern spectrometers)結果的分析軟件,已經(jīng)漸漸成為蛋白質(zhì)組學領域內(nèi)的標準解決方案之一。
實驗流程
1. 蛋白提取和酶解
2. label free
3. 質(zhì)樸分析
4. 蛋白定性定量
5. 生信分析
結果展示
實驗周期及交付標準
1. 實驗周期:6周左右
2. 交付標準:蛋白定量結果、鑒定結果、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)、生信分析結果(GO分析、KEGG分析等等)
需確認的信息
1. 樣本的種屬
2. 樣本的類型(組織or細胞or血液)
3. 樣本的數(shù)量及分組
4. 分析要求