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Minilys:快速可重復(fù)的病毒宏基因組研究

閱讀:1044        發(fā)布時(shí)間:2020-9-10

二代測(cè)序(NGS)*改變了人類腸道微生物群落的研究,即存在于人體腸道內(nèi)的微生物群落(包括細(xì)菌、真菌和病毒)。雖然近年來(lái),我們對(duì)人類微生物群落的了解有了很大的提高,但大多數(shù)研究都集中在細(xì)菌上,忽略了病毒基因組,故此現(xiàn)在對(duì)人類病毒組(人類微生物組的病毒成分)知之甚少,同時(shí)研究人類腸道病毒組的一個(gè)主要挑戰(zhàn)是缺乏有效的高通量和可重復(fù)的病毒組分析方法。

 

科學(xué)家們利用qPCR和NGS對(duì)病毒組分析樣品制備的不同步驟的效果進(jìn)行了評(píng)估。利用一個(gè)模擬病毒組(包括9種高度多樣化的病毒,其中包含冠狀病毒)和一個(gè)細(xì)菌模擬菌群,進(jìn)行均質(zhì)、離心、過(guò)濾和隨機(jī)擴(kuò)增步驟的測(cè)試,由此建立了一種優(yōu)化的糞便樣品制備方法,即新型病毒富集技術(shù)NetoVIR。其中NetoVIR利用Minilys生物樣品研磨器(法國(guó)Bertin)及Minilys提供的優(yōu)化步驟對(duì)樣品進(jìn)行了高效、均勻地均質(zhì)化,從而保證了進(jìn)一步分析結(jié)果的可靠性和重復(fù)性。

 

下圖所示,NetoVIR可以富集到模擬病毒組樣本中存在的所有病毒。更多詳情,請(qǐng)點(diǎn)擊閱讀原文。

 

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