人們越來越擔心，科學界正在經(jīng)歷一場可重復性危機。微生物組學是目前面臨大挑戰(zhàn)的領域之一，因為在其工作流程的每一步都會引入大量的偏差[1]。這令研究人員開始使用模擬微生物菌落標準（如Zymobiomics®微生物菌落標準（Zymo Research Corp.，Irvine，CA））來質(zhì)疑和驗證他們的方法。Zymobiomics®標準包含10種特性良好的微生物（即5種革蘭氏陽性、3種革蘭氏陰性和2種酵母），它們以規(guī)定的比例混合。該標準由不同大小和細胞壁韌性的微生物組成，是評估微生物工作流程每一步的理想標準。

研究顯示，在核酸提取步驟中選擇的細胞裂解技術(shù)可顯著影響微生物組二代測序（NGS）的分析結(jié)果[2]。珠式機械裂解已成為金標準。由于其強大的3D運動，Precellys Evolution在幾秒鐘內(nèi)提供了強大的裂解功能。在這里，我們使用ZymoBIOMICS®微生物菌落標準來證明Precellys®Evolution生物樣品研磨器與Zymobiomics®DNA/RNA Miniprep試劑盒相結(jié)合能夠在不損害RNA完整性的情況下實現(xiàn)*溶解，從而實現(xiàn)準確的亞基因組和微生物組分析。此外，我們還評估了用此工作流程從本標準中提取的核酸的質(zhì)量，以及另外3個樣本，包括革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌以及人類糞便樣本。

Precellys生物樣品研磨器：

超快速: up to 10 000 rpm

超靈活: 0.5, 2, 7和 15mL研磨管

超高效: 強力3D振動

超保護: Cryolys Evolution新型冷卻技術(shù)，無需液氮和壓縮空氣

參考資料

1、Wesolowska-Andersen A, Bahl Ml, Carvalho V et al. Choice of bacterial DNA extraction method from fecal material influences community structure as evaluated by metagenomic analysis. Microbiome 2(1), 19 (2014)

2、Costea Pl. Zeller G, Sunagawa S et al. Towards standards for human fecal sample processing in metagenomic studies. Nat. Biotechnol. 35(11), 1069-1076 (2017)

3、Zymo Research is a privately-held American manufacturer of molecular biology research tools used for DNA and RNA research and analysis. Their offices are headquartered at 17062 Murphy Ave., Irvine, CA92614, Tel:949-679-1190