NCBI 竟然能批量下載基因序列!

第一步：整理排列好基因登入號，NCBI 檢索 nucleotide

第二步：調(diào)整展示界面 Display Settings

第三步：選擇文件發(fā)送內(nèi)容 Send

第四步：合適的打開方式 DNAstar 軟件

下面就給你們演示下：

第一步：每個(gè)基因都有它的 Accession number（基因登入號，好比ID一樣），這個(gè)你們已 經(jīng)拿到手了吧，首先登入 NCBI 網(wǎng)站ncbi.nlm.nih.gov/，在 All Databases 處下拉， 選擇 nucleotide，將基因的 Accession number 都排列在一起，用空格隔開，不要有回車符（怎么快速排列就不多說了，excel 就能實(shí)現(xiàn)），例如：NM_181571 NM_012319 NM_016651 NM_007678 NM_004642 NM_145918 NM_024504 NM_014847 NM_004196 NM_002295：

填好后 Search，然后會(huì)出現(xiàn)這樣一個(gè)界面：

第二步：點(diǎn)擊上面的 Display Settings 下拉標(biāo)記，在 Format 選項(xiàng)中選擇 FASTA，在 Sort by 選項(xiàng)中默認(rèn)選擇 Default order（界面展示順序會(huì)和你輸入的 Accession number 一致）：

點(diǎn)擊 Apply，就會(huì)出現(xiàn)下一個(gè)界面：

第三步：點(diǎn)擊右上角的 Send 下拉標(biāo)記，選中 Complete Record 和 File，然后在下面 Format 中選擇 FASTA，Sort by 不變（默認(rèn)），最后點(diǎn)擊 Create File 保存數(shù)據(jù)：

第四步：安裝 DNAstar 軟件（經(jīng)常用的序列分析軟件，和 Office 辦公軟件類似，有多款 用途的工具），打開其中的 Editseq 工具，將保存的文件 sequence .fasta 拖進(jìn)來，這時(shí)會(huì)彈出 一個(gè)界面：

點(diǎn)擊 Just Open，就可以直接打開所有下載的基因序列；

如果希望一個(gè)一個(gè)打開，則點(diǎn)擊 OK 先保存基因序列（自動(dòng)以基因的 Accession number 命名），再選擇性打開。

這樣就大功告成啦。可是獲得了這么多序列可以做什么呢，這個(gè)就看你的目的了，分析酶切位點(diǎn)、設(shè)計(jì)引物、比對序列、構(gòu)建多表達(dá)克隆、設(shè)計(jì)敲減靶點(diǎn)等等都可以??！