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qPCR實驗為什么要制作熔解曲線?

時間:2021/10/11閱讀:4514
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熒光DNA結(jié)合染料法的缺點是它們能在反應中結(jié)合所有DNA雙鏈,包括在實時熒光PCR中產(chǎn)生的引物二聚體,和其他非特異性產(chǎn)物,引起大量的背景噪聲信號。


這種噪聲會影響我們對靶基因產(chǎn)量的評估,甚至熒光強度和靶基因的起始量、全長根本沒什么關(guān)系。


因此,我們使用熒光DNA染料結(jié)合法時,需要對擴增產(chǎn)物進行熔解曲線的分析。通過對擴增反應產(chǎn)物逐漸升溫,同時監(jiān)測每一步的熒光信號來制作熔解曲線。

qPCR實驗為什么要制作熔解曲線?.png

熔解曲線的縱坐標是熒光信號值,橫坐標是溫度值。通過觀察產(chǎn)生的信號峰和對應溫度,可以判斷產(chǎn)物狀態(tài)。


理想情況下,熔解曲線應該是單峰,峰值對應溫度是特異性產(chǎn)物的退火溫度,這才能說明擴增產(chǎn)物中特異性產(chǎn)物占比大。熒光DNA結(jié)合染料法的缺點是它們能在反應中結(jié)合所有DNA雙鏈,包括在實時熒光PCR中產(chǎn)生的引物二聚體,和其他非特異性產(chǎn)物,引起大量的背景噪聲信號。

qPCR實驗為什么要制作熔解曲線?.png

這種噪聲會影響我們對靶基因產(chǎn)量的評估,甚至熒光強度和靶基因的起始量、全長根本沒什么關(guān)系。


因此,我們使用熒光DNA染料結(jié)合法時,需要對擴增產(chǎn)物進行熔解曲線的分析。通過對擴增反應產(chǎn)物逐漸升溫,同時監(jiān)測每一步的熒光信號來制作熔解曲線。


熔解曲線的縱坐標是熒光信號值,橫坐標是溫度值。通過觀察產(chǎn)生的信號峰和對應溫度,可以判斷產(chǎn)物狀態(tài)。


理想情況下,熔解曲線應該是單峰,峰值對應溫度是特異性產(chǎn)物的退火溫度,這才能說明擴增產(chǎn)物中特異性產(chǎn)物占比大。


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