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qPCR實驗結果分析基本步驟(二)

時間:2021/10/15閱讀:4828
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閾值,我們在操作軟件時上下拉動的橫線,是決定Ct值的因素之一。


閾值是熒光信號相對于基線有顯著增強的點,大多數(shù)儀器會根據(jù)基線平均信號,自動計算熒光信號的閾值水平,并設置一個比平均值高10倍的閾值。


也就是說,當基線被正確的設置了,閾值也能手動調(diào)整成正確值。

qPCR實驗結果分析基本步驟(二)

需要注意的是:


1、讀取閾值相關的分析數(shù)據(jù)時,不能隨意改變閾值的設置。只有分析不同樣本,或相同樣本不同靶基因時,才能調(diào)整閾值。


2、設置閾值線時,要在擴增曲線的指數(shù)擴增區(qū)域內(nèi)設置,不能在起始階段,也不能在熒光背景(基線)區(qū)域。


3、每次改變閾值時,要查看標準曲線的斜率和R的平方有沒有改善。沒有使用標準曲線時,也可以計算3個復孔(相同條件擴增的樣本)的標準偏差。好的閾值應該要改善Ct值的表現(xiàn)。


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