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Trizol法提取RNA:從樣本前處理到操作步驟

時間:2024/2/28閱讀:811
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一、實驗原理:

Trizol試劑的主要成分是苯酚,對細胞進行裂解,使細胞中的蛋白質(zhì)以及核酸物質(zhì)解聚。苯酚雖然可以有效的使蛋白質(zhì)變性,但它不能全部抑制RNA酶的活性,因此Trizol中還加入了8-羥基喹啉、異硫氰酸胍、β-巰基乙醇等來抑制內(nèi)源和外源RNase(即RNA酶)。存放在Trizol 中的樣品可以在負八十保存半年左右。


二、樣本材料及其處理方法:

貼壁培養(yǎng)細胞

1.吸出培養(yǎng)液,細胞用預(yù)冷的1×PBS清洗兩次。2. 吸出PBS洗液,然后每1×108-2×107的培養(yǎng)細胞中加入1 ml的Trizol,輕搖培養(yǎng)皿,確保溶液均勻分布于細胞表面。(可用細胞刮刀剝離細胞)


2.吸出PBS洗液,然后每1×108-2×107的培養(yǎng)細胞中加入1 ml的Trizol,輕搖培養(yǎng)皿,確保溶液均勻分布于細胞表面。(可用細胞刮刀剝離細胞)


3. 使用移液器反復(fù)吹打使細胞脫落,然后將內(nèi)含細胞的裂解液轉(zhuǎn)移至離心管中,再用移液器吹打直至裂解液中無明顯沉淀(溶液清亮)。


4. 室溫靜置5-10分鐘后,再進行后續(xù)的RNA提取操作。


懸浮培養(yǎng)細胞

1. 將懸浮細胞收集至離心管中,12000 rpm 4℃離心2分鐘,棄上清,用預(yù)冷的1×PBS清洗兩次。

2. 向1×106-2×107細胞中加入1ml的Trizol。

3. 用移液器吹打至裂解液清亮無明顯沉淀。

4. 室溫靜置5-10分鐘后,再進行后續(xù)的RNA提取操作。


動物組織、植物材料樣品

1. 將準確稱取的RNA提取樣品轉(zhuǎn)移液氮預(yù)冷的研缽中,用研杵研磨組織(研磨過程中需要不斷向研缽中補加液氮),直至研磨成粉末狀,然后向粉末中加入適量的Trizol并混勻。(針對柔軟易裂解的組織樣本,可以使用勻漿器加入適量Trizol進行勻漿裂解。)


2. 將上述混合液轉(zhuǎn)移至離心管中,用移液器反復(fù)吹打充分混勻。室溫靜置5分鐘,12,000 rpm 4℃離心5-10分鐘。


3. 小心吸取上清液,移入新的離心管中,再進行后續(xù)的RNA提取操作。


三、操作步驟:

(1)樣本前處理。

(2)向上述裂解液中加入Trizol體積量1/5氯仿,充分混合(渦旋或用槍頭混勻)。室溫靜置15分鐘。

(3)12000 rpm 4℃離心15分鐘。小心取出離心管,此時勻漿液分為三層,即:上清液(含RNA)、中間蛋白層及下層有機相。吸取上清液轉(zhuǎn)移至另新的離心管中。

注:每管大概取 200-300 μl,此步驟非常關(guān)鍵,提出的RNA質(zhì)量好純度高即可。若吸取水相時吸到有機相會導致雙峰,A260/230特別低。

(4)沉淀 RNA:向其中加入相同體積異丙醇,上下顛倒混勻。在-20℃放置10 min。12000 rpm 4℃離心10 min后棄去上清。

(5)清洗 RNA:向沉淀中加入500 μl 預(yù)冷的無水乙醇,吹散沉淀洗滌RNA,洗滌兩次,12000 rpm 4℃離心后棄去上清。

注:把沉淀彈起來,讓其懸浮在酒精中,然后放1-2min,讓酒精充分接觸沉淀,充分溶解有機試劑,然后再離心。

(6)打開離心管,室溫干燥沉淀約5分鐘。

注:不要離心干燥,否則RNA將很難溶解,如果殘留乙醇較多可延長干燥時間。

(7)向離心管中加入20 μl DPEC水溶解RNA。將溶解后的RNA放入-80℃保存。

注:如果提取的是組織樣本,溶解液可以多加點。

(8)取2 μl進行電泳。

四、注意事項:

1. 防止RNA酶污染。

  • 戴好口罩,手套。
  • 全程最好在生物安全柜操作(根據(jù)實驗條件)
  • 實驗所涉及的試劑/溶液,尤其是水,必須確保RNase-Free。耗材均需要通過DPEC處理。

2. 明確目標。

  • 提取成功標準是RNA的質(zhì)量和純度,而不是得率。

3. 測量結(jié)果:

  • A260/A280:1.8-2.2,若<1.8則表明有蛋白質(zhì)污染;

  • A260/A230:1.5-2.4,若<1.5則表明有明顯的有機物如糖、膚、苯酚的污染。

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