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合成生物學(xué)前沿 | 代謝組結(jié)合代謝流研究高效解析糖基轉(zhuǎn)移酶生物功能
合成生物學(xué)正在引領(lǐng)第三次生物技術(shù)革命,其作為底層技術(shù)將驅(qū)動多個領(lǐng)域的創(chuàng)新發(fā)展,包括醫(yī)藥、食品、農(nóng)業(yè)、材料、環(huán)境甚至信息存儲等。合成生物學(xué)是生物學(xué)工程化高度交叉的前沿學(xué)科研究領(lǐng)域,包含幾個不同的研究層次:認(rèn)識生命、改造生命和創(chuàng)造生命;要想實現(xiàn)其終極目標(biāo),還需要在生命本質(zhì)探索及相關(guān)技術(shù)的不斷創(chuàng)新與應(yīng)用上持續(xù)深入。我們將緊跟合成生物學(xué)領(lǐng)域的前沿研究進展,為大家系列解讀該領(lǐng)域的最新科研成果。
本期分享植物酶功能研究新方法,酶功能的深入認(rèn)識將為下一步異源設(shè)計細(xì)胞工廠提供重要依據(jù)。研究成果來自中國科學(xué)院深圳先進技術(shù)研究院合成基因組學(xué)研究中心的趙喬研究員課題組在 Molecular Plant 上發(fā)表的題為“Glycosides-specific metabolomics combined with precursor isotopic labeling for characterizating plant glycosyltransferases"的研究論文[1],為大家介紹一種特異針對糖基化合物的代謝組(glycosides-specific metabolomics,GSM)和同位素標(biāo)記前體化合物示蹤(precursor isotopic labeling,PIL)相結(jié)合的方法,可以高效、準(zhǔn)確鑒定糖基轉(zhuǎn)移酶(glycosyltransferases,GTs)在植物體內(nèi)的產(chǎn)物,解析 GTs 在特定代謝通路中的作用。
該方法極大縮小了目標(biāo)化合物的范圍,在糖基化合物定性、方法可靠性方面較傳統(tǒng)生化手段或非靶向方法有較大提升,為植物糖基轉(zhuǎn)移酶的功能解析提供了新手段。
參考文獻:
[1] Jie Wu, Wentao Zhu, Xiaotong Shan, Jinyue Liu, Lingling Zhao and Qiao Zhao. Glycosides-specific metabolomics combined with precursor isotopic labeling for characterizating plant glycosyltransferases. Molecular Plant 15, 1517-1532.