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DNA樣品制備液滴系統(tǒng)

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產(chǎn)品型號(hào)DNAdrop

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更新時(shí)間:2022-03-02 15:32:55瀏覽次數(shù):204次

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DNA樣品制備液滴系統(tǒng)
采用*專有微流體技術(shù),跨越基因和細(xì)胞研究的下一個(gè)前沿。它的*設(shè)計(jì)能幫助研究人員對(duì)人類、
動(dòng)物、植物和微生物的細(xì)胞和基因組獲得高分辨率的信息。
可以在用戶友好型的工作流程中生成和分類雙乳液滴,不需要任何使用過熒光細(xì)胞分類器的經(jīng)驗(yàn)。

DNA樣品制備液滴系統(tǒng)

高通量單細(xì)胞單分子液滴分選與封裝系統(tǒng)


可實(shí)現(xiàn)DNA或細(xì)胞封裝和高吞吐量分選。 這使得能夠以很快的速度篩選大型復(fù)雜的基因庫(kù)。

該系統(tǒng)是一種多功能和用戶友好型皮升級(jí)液滴發(fā)生器,觸摸屏化操作,*自動(dòng)化液滴生成。用于準(zhǔn)備DNA,細(xì)胞和其他生物材料樣品,然后用于下游的高分辨率分析。 可以安全、快速地將單個(gè)分子、DNA文字片段、單個(gè)細(xì)胞或單個(gè)細(xì)胞器與生化反應(yīng)試劑一起封裝在高度穩(wěn)定的雙乳狀或單乳狀液滴中。這些液滴能在PCR、渦旋、孵育和長(zhǎng)期儲(chǔ)存過程中保持穩(wěn)定。

封裝液體藥物的系統(tǒng)

采用*專有微流體技術(shù),跨越基因和細(xì)胞研究的下一個(gè)前沿。它的*設(shè)計(jì)能幫助研究人員對(duì)人類、

動(dòng)物、植物和微生物的細(xì)胞和基因組獲得高分辨率的信息。


可以在用戶友好型的工作流程中生成和分類雙乳液滴,不需要任何使用過熒光細(xì)胞分類器的經(jīng)驗(yàn)。

工作流程從將100 kb的DNA的文字片段、小單細(xì)胞或其他生物材料捕捉在高度穩(wěn)定的液滴中開始,以用于諸如PCR和酶活性評(píng)價(jià)等測(cè)試當(dāng)中。

然后,根據(jù)內(nèi)含物的熒光對(duì)液滴進(jìn)行分類,分離得到只含有感興趣內(nèi)容物的液滴,用于下游高分辨率分析,如:


●驗(yàn)證CRISPR基因編輯沒有隱藏意外重組的PCR偏差。

●識(shí)別重排,如融合和倒置。

●*。

●識(shí)別病毒和轉(zhuǎn)基因整合位點(diǎn)。

●在單細(xì)胞水平評(píng)估酶活性。

●進(jìn)行高通量GFP篩選。綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP)是一種常用

的報(bào)告基因

提供該系統(tǒng)所需的全系列試劑,用于包裹封裝DNA、RNA、細(xì)胞器或小細(xì)胞。生成高度穩(wěn)定的微納雙乳化液滴,

這些數(shù)以百萬計(jì)的液滴分別封裝分子,細(xì)胞器,或小細(xì)胞(高達(dá)6µm直徑)。每一個(gè)液滴都相當(dāng)于一個(gè)反應(yīng)室在其內(nèi)進(jìn)行單個(gè)分子或單個(gè)細(xì)胞分辨率水平的分析。

液滴是什么樣子

基于微流體,在一個(gè)簡(jiǎn)單的工作過程中將數(shù)百萬個(gè)分子分成液滴,從而能夠高質(zhì)量地靶向富集大片段(3E100 kb),

d用于后續(xù)測(cè)序 ,允許從幾毫微克的脫氧核糖核酸開始靶向富集長(zhǎng)脫氧核糖核酸分子。該系統(tǒng)是基于分離數(shù)百萬個(gè)液滴中的長(zhǎng)DNA文字片

段,其中含有感興趣目標(biāo)序列的液滴被熒光標(biāo)記,并使用流式細(xì)胞術(shù)進(jìn)行分類。該系統(tǒng)程序的終產(chǎn)品是可以通過測(cè)序研究的長(zhǎng)脫氧核糖核酸分子的富集群體。是研究復(fù)雜基因組區(qū)域的有效富集技術(shù)。


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為什么要選擇該系統(tǒng):

它提供了從大基因文庫(kù)中準(zhǔn)備基因材料的手段以用于高分辨率的篩查分析。

幫助回答一系列的基因組學(xué)和分子生物學(xué)問題。

支持合成生物學(xué)的工作流程,如酶進(jìn)化及其路徑工程。
具有用戶友好型接口,具有將微液體技術(shù)接入各實(shí)驗(yàn)室的能力


DNA樣品制備液滴系統(tǒng)  微流體液滴包裹系統(tǒng)


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典型應(yīng)用:

與適當(dāng)?shù)囊旱畏蛛x、測(cè)序和分析技術(shù)相結(jié)合,該系統(tǒng)可應(yīng)用于以下等幾個(gè)方面:

●長(zhǎng)或短讀測(cè)序

●基因編輯分析

●無偏全基因組擴(kuò)增

●酶活性評(píng)價(jià)

近年來,液滴的質(zhì)譜分析技術(shù)、基于液滴的梯度技術(shù)、雙重液滴技術(shù)及基于液滴的基因篩選等取得了較大進(jìn)展,使液滴微流控在單細(xì)胞分析、酶動(dòng)力學(xué)、蛋白質(zhì)合成及高通量篩選等研究領(lǐng)域的潛力逐漸顯現(xiàn)出來。

實(shí)現(xiàn)單分子或單細(xì)胞分辨率

確保您為單分子或單細(xì)胞分析捕獲了正確的材料。該系統(tǒng)通過將生命的構(gòu)建模塊封裝在微微升雙乳液或單乳液液滴中,支持高分辨率的基因組學(xué)、宏基因組學(xué)和分子生物學(xué)工作流程。這種*的方法使以前未知的基因組區(qū)域可用于長(zhǎng)讀和短讀測(cè)序,提高了全基因組擴(kuò)增的分辨率,支持單細(xì)胞酶活性的評(píng)估等等。

1、基因組學(xué)應(yīng)用

提高基因組學(xué)和宏基因組學(xué)研究的分辨率。使用我們系統(tǒng)以及測(cè)序建議和生物信息學(xué)工具來執(zhí)行一系列基因組學(xué)工作流程該系統(tǒng)在人類、其他動(dòng)物、植物和微生物DNA的長(zhǎng)讀和短讀測(cè)序工作流程中證明了其性能。

聚光燈:植物基因組學(xué)

克服對(duì)植物龐大而復(fù)雜的基因組進(jìn)行測(cè)序的挑戰(zhàn)。該系統(tǒng)在支持各種植物基因組學(xué)工作方面表現(xiàn)出色,包括:

  • 特征不明顯的基因簇分析

  • 由于參考基因組和植物品種之間的低對(duì)應(yīng)性導(dǎo)致的間隙閉合

  • 植物基因組結(jié)構(gòu)重排的解析

  • 生物合成基因簇的檢查

2、基于細(xì)胞的應(yīng)用

使用該系統(tǒng)封裝單個(gè)小細(xì)胞,包括微生物和藻類,以及生物活性分子。我們高度穩(wěn)定的雙乳化液滴提供了一種方法,可以孵育單個(gè)活細(xì)胞進(jìn)行分析,并對(duì)它們進(jìn)行分類,以在基于細(xì)胞的工作流程中獲得高分辨率。Xdrop在封裝細(xì)胞核方面也有良好的表現(xiàn),其他細(xì)胞器的工作流程正在測(cè)試中。


新應(yīng)用

隨著生物分子熒光技術(shù)的發(fā)展,1992年實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR, qPCR) 應(yīng)運(yùn)而生。qPCR是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)熒光強(qiáng)度來測(cè)定每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。由于在PCR擴(kuò)增的指數(shù)時(shí)期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以Ct值也就成為定量的依據(jù)?;跓晒馓结樆蛉玖系牡诙?PCR 技術(shù)隨后逐漸發(fā)展為檢測(cè)核酸目標(biāo)片段的主流分子診斷學(xué)技術(shù)。


傳統(tǒng)的連續(xù)流微流控系統(tǒng),由于低雷諾數(shù)層流的特點(diǎn),連續(xù)流體的混合比較困難,同時(shí)也增加了其樣品的消耗量。此外,當(dāng)需要增加平行測(cè)試的數(shù)目以提高反應(yīng)或分析的通量時(shí),往往會(huì)增加芯片的尺寸和復(fù)雜性。另外,均相流體也易造成交叉污染。與之相比,液滴微流控技術(shù)由于結(jié)合了微流控以及液滴技術(shù),使其兼有兩者的特點(diǎn):

(1) 體積微小 通過微流控液滴技術(shù),產(chǎn)生的微液滴體積可在納升甚至飛升范圍內(nèi)。體積的減小增加了液滴的比表面積和傳質(zhì)性能,能與連續(xù)相之間發(fā)生高效的物質(zhì)傳遞和能量轉(zhuǎn)移,從而減少了液滴內(nèi)樣品混合及反應(yīng)的時(shí)間。Leman等在飛升(fL)水平的液滴中進(jìn)行操控并獲得顯著成效,在75 fL的液滴中它們的混合時(shí)間為45 μs,遠(yuǎn)遠(yuǎn)快于此前的報(bào)道。液滴由于反應(yīng)快速,所需樣品量消耗微少,適用于對(duì)單細(xì)胞、單分子進(jìn)行分析,尤其也適合一些珍貴樣品的篩選與分析。

(2) 生成速度快 微液滴在微流控技術(shù)下的產(chǎn)生頻率在0.1~ 2000 Hz之間,因此微液滴能為一些酶反應(yīng)和基于細(xì)胞篩選的實(shí)驗(yàn)提供高分辨率的優(yōu)質(zhì)數(shù)據(jù)支持。此外,液滴微流控這一特性可以在短時(shí)間內(nèi)產(chǎn)生大量平行重復(fù)的反應(yīng)單元,從而在高通量基因分析和藥物篩選等方面被廣泛應(yīng)用。

(3) 大小均勻,體系封閉 由于每個(gè)微液滴處在連續(xù)相中被彼此分開。每個(gè)液滴中的樣品互不影響,這樣就使得樣品濃度保持相對(duì)穩(wěn)定,且避免了樣品之間的交叉污染。另外,水相微液滴由于被油相包裹,內(nèi)部環(huán)境穩(wěn)定,外部蒸發(fā)受到抑制,反應(yīng)條件在短時(shí)間內(nèi)所受外界的影響微乎其微,這些條件在宏觀的實(shí)驗(yàn)中是很難實(shí)現(xiàn)的。此外,微液滴還可包裹單個(gè)細(xì)胞或者細(xì)胞團(tuán),甚至可對(duì)活生物體進(jìn)行培養(yǎng)來測(cè)定特定刺激下所產(chǎn)生的可溶性代謝產(chǎn)物。

(4) 單分散性良好 由于多分散性所產(chǎn)生的液滴大小不同,傳統(tǒng)的液滴方法在實(shí)際研究中很難進(jìn)行定量分析,而液滴微流控技術(shù)所產(chǎn)生的微液滴憑借其良好的單分散性,使反應(yīng)物的濃度保持相同,反應(yīng)條件保證一致,因而有助于實(shí)驗(yàn)的定量分析與研究。此外,還可將檢測(cè)裝置集成于微流控芯片上,使液滴能被直接分析,從而極大地?cái)U(kuò)展了其應(yīng)用范圍。











































































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