希伯來大學(xué)-3D水凝膠單細(xì)胞培養(yǎng)研究
這是微納立方第32篇微流控推文。
Bavli等人基于液滴微流控技術(shù),研發(fā)了一種名為“CloneSeq"的高靈敏單細(xì)胞分析平臺,可用于3D細(xì)胞培養(yǎng)的全面表征,揭示了新的癌癥特異性亞群的存在,并于2021年在Dev. Cell期刊發(fā)表論文(影響引子12.861,論文鏈接見文末)。
(科學(xué)家和他們的微流控實(shí)驗(yàn)平臺:為了實(shí)現(xiàn)穩(wěn)定又精確的微流體控制,獲取誤差最小的數(shù)據(jù),他們采購了幾十個(gè)法國Fluigent的壓力泵、流量計(jì)和旋轉(zhuǎn)閥等部件,搭建了一套通用型微流控綜合實(shí)驗(yàn)平臺)
Bavli等人的實(shí)驗(yàn)大致可分為兩步:
第1步,在3D水凝膠中完成單細(xì)胞的封裝,并進(jìn)行克隆擴(kuò)增,流速范圍為8至34μL/min,每秒生成700個(gè)水凝膠微球。
(水凝膠單細(xì)胞封裝方案示意圖)
(單細(xì)胞封裝與克隆示意圖)
第2步,進(jìn)行克隆分析,作者設(shè)計(jì)了另一種微流體方案來捕獲微滴中的克隆,并使用InDrops protocol對其進(jìn)行條碼化。
(InDrops protocol的微流體方案)
(捕捉到的圖像:Single Clone和Barcode Bead被封裝于同一微滴)
實(shí)驗(yàn)完成后,作者使用Fluigent十轉(zhuǎn)一閥門M-Switch清洗方案,自動完成實(shí)驗(yàn)儀器和管路的清洗。
論文:Bavli, D. et al. CloneSeq: A highly sensitive analysis platform for the characterization of 3D-cultured single-cell-derived clones. Dev. Cell (2021).
DOI: 10.1016/j.devcel.2021.04.026