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探針法qPCR在支原體檢測方面的應用

閱讀:60      發(fā)布時間:2025-5-19
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實時熒光探針PCR技術,又稱為qPCR,是一種結合了PCR擴增和熒光檢測的分子生物學技術。它能夠在PCR反應進行的同時,實時監(jiān)測特定DNA序列的擴增情況。該技術主要依賴于熒光標記的探針,這些探針能夠特異性地結合到目標DNA序列上。

在PCR循環(huán)中,隨著目標DNA的指數級擴增,熒光信號也相應增強。熒光信號的強度與擴增產物的量成正比,因此可以通過熒光信號的變化來實時監(jiān)測PCR反應的進程。實時熒光探針PCR技術通常使用兩種類型的熒光探針:TaqMan探針和SYBR Green。


SYBR Green是一種DNA染料,它能夠非特異性地結合到雙鏈DNA上,具有使用簡便,價格便宜等優(yōu)點而被廣泛使用。但其最大的缺點是缺乏特異性,即染料可以與任何dsDNA結合。因此,qPCR反應中有非特異性擴增產物的出現會增加熒光值,影響定量結果的準確性,而TaqMan探針法的出現很好地解決了染料法非特異性的問題,這也讓TaqMan探針法在檢測領域大放異彩!接下來,就讓我們了解一下TaqMan探針法qPCR在支原體檢測方面的應用。

TaqMan探針是一種寡核苷酸探針,它含有一個熒光報告基團和一個淬滅基團。當探針完整時,報告基團發(fā)出的熒光被淬滅基團吸收。在PCR擴增過程中,TaqMan探針與目標DNA序列結合,Taq DNA聚合酶的5'到3'外切酶活性會切割探針,導致報告基團和淬滅基團分離,從而發(fā)出熒光信號。切割的熒光分子數與PCR產物的數量成正比,因此,通過檢測PCR反應體系中的熒光強度可以達到檢測PCR產物擴增量的目的。

古典豬瘟.png

檢測機制與定量分析?

根據檢測方式不同,PCR試劑盒分為?常規(guī)PCR?和?實時熒光定量PCR?兩類:

常規(guī)PCR檢測

擴增后通過瓊脂糖凝膠電泳分析產物大小,定性判斷目標片段是否存在。

實時熒光定量PCR(qPCR)

熒光標記?:加入熒光探針(如TaqMan探針)或DNA結合染料(如SYBR Green);

信號監(jiān)測?:每輪擴增后實時檢測熒光強度,通過?t值(熒光達到閾值所需循環(huán)數)定量起始模板量;

標準曲線法?:利用已知濃度的標準品建立Ct值與模板濃度的線性關系,計算樣品濃度

探針法qPCR在支原體檢測中的應用

引物設計

針對支原體16S rRNA序列,下載后進行序列比對,篩選支原體特異性的區(qū)段,尋找兩端特異中間保守的區(qū)段,設計引物。一般選擇多對正反向引物,和多條相對應的探針引物。

內參設計

同時為了保證實驗的有效性和穩(wěn)定性,往往還會設計一對內參引物和內參熒光探針,用于監(jiān)控每次反應過程的穩(wěn)定性。

反應模板

檢測時需取培養(yǎng)至少2~3天的細胞培養(yǎng)物,進行核酸提取后,作為模板進行qPCR反應。

目前市場上優(yōu)秀的qPCR支原體檢測試劑盒可檢測支原體種類可達到39~180種以上,檢測靈敏度可達到10cfu/mL。

1高特異性:TaqMan探針通過與目標DNA序列特異性結合,確保了檢測的高特異性。

2高靈敏度:該方法可以檢測極低濃度的核酸模板,靈敏度高。

3實時監(jiān)測:在PCR反應過程中實時監(jiān)測熒光信號,可以準確地定量分析。

4減少污染風險:由于不需要后續(xù)處理,減少了PCR產物污染的風險。

多重檢測能力:可以同時使用不同顏色的熒光標記,進行多重檢測。

5簡化操作:制作成預混液后,大大簡化操作步驟,易于標準化和自動化。TaqMan探針法qPCR應用于支原體檢測的優(yōu)點


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