除了凝膠濃度，以下因素也會(huì)對(duì)核酸電泳結(jié)果產(chǎn)生影響：
核酸樣品的質(zhì)量和純度
電泳緩沖液
種類：不同的緩沖液具有不同的 pH 值和離子強(qiáng)度，會(huì)影響核酸的帶電性質(zhì)和遷移速度。例如，常用的 TAE 緩沖液（Tris - 乙酸 - EDTA）和 TBE 緩沖液（Tris - 硼酸 - EDTA），TBE 的緩沖能力較強(qiáng)，適合長(zhǎng)時(shí)間電泳，但高濃度的 TBE 會(huì)影響 DNA 的遷移率，而 TAE 則更適合用于大片段 DNA 的電泳。
濃度：緩沖液濃度過(guò)高，會(huì)使凝膠的電阻增大，產(chǎn)熱增加，導(dǎo)致核酸分子的遷移速度減慢，甚至可能使 DNA 條帶扭曲變形；濃度過(guò)低，緩沖能力不足，會(huì)使電泳過(guò)程中 pH 值發(fā)生變化，影響核酸的遷移。
使用次數(shù)：多次使用的緩沖液中離子濃度會(huì)發(fā)生變化，且可能積累了電泳過(guò)程中產(chǎn)生的雜質(zhì)，如核酸降解產(chǎn)物等，從而影響電泳效果，一般建議及時(shí)更換緩沖液。
電場(chǎng)強(qiáng)度
凝膠的制備和保存
制備過(guò)程：凝膠制備過(guò)程中若攪拌不均勻、加熱不充分或冷卻速度過(guò)快等，都可能導(dǎo)致凝膠的孔徑大小不均勻，影響核酸分子的遷移路徑，使條帶不整齊或出現(xiàn)扭曲現(xiàn)象。
保存條件：制備好的凝膠若保存不當(dāng)，如在干燥環(huán)境中放置時(shí)間過(guò)長(zhǎng)，會(huì)導(dǎo)致凝膠失水干裂；若保存溫度過(guò)低或過(guò)高，也會(huì)影響凝膠的性能，一般建議將凝膠保存在 4℃左右的濕潤(rùn)環(huán)境中，并盡快使用。
染色和成像
染色劑：選擇合適的染色劑對(duì)于清晰觀察核酸條帶至關(guān)重要。常用的染色劑如溴化乙錠（EB），其與核酸結(jié)合的量會(huì)影響條帶的熒光強(qiáng)度，如果染色時(shí)間過(guò)長(zhǎng)或染色劑濃度過(guò)高，可能會(huì)導(dǎo)致背景熒光增強(qiáng)，影響條帶的清晰度；而染色時(shí)間過(guò)短或濃度過(guò)低，則條帶熒光較弱，不易觀察。此外，不同染色劑對(duì)不同類型核酸的親和力也有所差異，例如 SYBR Green 對(duì)雙鏈 DNA 和 RNA 都有較好的染色效果，而對(duì)單鏈 DNA 的染色效果相對(duì)較弱。
成像設(shè)備：成像設(shè)備的靈敏度、分辨率以及曝光時(shí)間等參數(shù)設(shè)置也會(huì)影響核酸電泳結(jié)果的呈現(xiàn)。如果曝光時(shí)間過(guò)長(zhǎng)，條帶會(huì)過(guò)亮且可能出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象；曝光時(shí)間過(guò)短，條帶則可能顯示不出來(lái)。
中級(jí)會(huì)員·2年
