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亞科因(武漢)生物技術(shù)有...

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甲醛脫氫酶(FDH)活性檢測(cè):從裂解到讀板的全程操作規(guī)程

閱讀:56      發(fā)布時(shí)間:2025-7-15
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FDH 在細(xì)胞甲醛代謝與癌癥耐藥研究中被高頻引用,實(shí)驗(yàn)成敗往往取決于操作細(xì)節(jié)而非試劑本身。下面把一份 96 孔板實(shí)驗(yàn)拆成 6 個(gè)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),每個(gè)節(jié)點(diǎn)給出可落地的動(dòng)作指令與常見(jiàn)故障排查,照著做能把板間 CV 壓到 5% 以下。


樣本制備:裂解液離子強(qiáng)度決定回收率

RIPA 高鹽配方(150 mM NaCl)會(huì)抑制 FDH 活性 20–30%,改用 50 mM Tris-HCl + 0.1% Triton X-100 可把回收率拉回 95%。細(xì)胞刮下來(lái)后先 PBS 洗兩遍,去掉培養(yǎng)基殘留的甲醛,再按 10? cells/mL 加入裂解液,冰上 15 min 后 12 000 g 離心 10 min,取上清立即上機(jī)或液氮速凍。裂解液里加 1 mM DTT 可穩(wěn)定酶活 48 h,但不要加 EDTA,它會(huì)螯合 FDH 所需的 Zn2?。


反應(yīng)體系:乙醛替代甲醛為何更穩(wěn)

試劑盒說(shuō)明書(shū)常寫(xiě)“底物甲醛終濃度 5 mM",實(shí)際操作中 37 °C 下甲醛揮發(fā)損失 10–15%,導(dǎo)致吸光度漂移。改用乙醛 2 mM 做替代底物,Km 值與甲醛接近,揮發(fā)可忽略,線性窗口從 10 min 延長(zhǎng)到 30 min。NAD? 濃度固定在 1 mM,pH 9.0 的甘氨酸-NaOH 緩沖液能把 Vmax 推高 1.4 倍,適合低表達(dá)樣本。


板布局:空白孔、標(biāo)準(zhǔn)孔、抑制孔如何排布

  • 空白孔:裂解液 + 緩沖液 + NAD?,無(wú)乙醛,用來(lái)扣背景

  • 標(biāo)準(zhǔn)孔:純化 FDH 梯度 0–0.2 U/mL,做標(biāo)曲

  • 抑制孔:樣本 + 5 mM 甲酸鈉,驗(yàn)證信號(hào)特異性

每塊板至少留出 4 個(gè)空白孔,分布在四角,避免邊緣效應(yīng)。標(biāo)準(zhǔn)孔做雙列排布,一條用于實(shí)驗(yàn)當(dāng)天,另一條封膜 4 °C 保存 24 h 內(nèi)復(fù)測(cè),驗(yàn)證板間穩(wěn)定性。


讀板參數(shù):振蕩延遲與雙波長(zhǎng)校正

酶標(biāo)儀設(shè) 340 nm 檢測(cè) NADH 生成,動(dòng)力學(xué)模式讀 5 min,間隔 15 s。加乙醛啟動(dòng)反應(yīng)后延遲 30 s 再開(kāi)始讀數(shù),讓液體表面張力穩(wěn)定。開(kāi)啟 405 nm 參比波長(zhǎng),扣除氣泡或纖維蛋白造成的散射。若使用 384 孔小體系,把振蕩幅度降到 1 mm,防止液體飛濺。


故障排查:信號(hào)漂移與負(fù)值出現(xiàn)

信號(hào)漂移 90% 由揮發(fā)或溫度不均導(dǎo)致。把板蓋換成透氣膜,37 °C 預(yù)熱 5 min 再上機(jī)。出現(xiàn)負(fù)值通常是空白孔 OD 高于樣本孔,檢查空白孔是否誤加乙醛,或裂解液里混入了細(xì)胞碎片。重新離心 5 min 可解決。


數(shù)據(jù)換算:蛋白歸一與細(xì)胞歸一并用

一張 96 孔板跑完,先用 BCA 測(cè)每孔總蛋白,把 U/mL 轉(zhuǎn)成 U/mg。再用同一孔的細(xì)胞計(jì)數(shù)儀讀數(shù),得到 U/10? cells。兩者比值可判斷樣本裂解效率:比值 <0.5 提示裂解不全,需延長(zhǎng)裂解時(shí)間或加大 Triton 濃度。


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