賽默飛離子阱質(zhì)譜有全掃描和選擇離子掃描功能，同時(shí)具有離子儲存技術(shù)，可以選擇任一質(zhì)量離子進(jìn)行碰撞解離，實(shí)現(xiàn)二級或多級分析功能。但離子阱的全掃描和選擇離子掃描的靈敏度是相似的。廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)組學(xué)和藥物代謝分析。已經(jīng)出現(xiàn)了很多離子阱質(zhì)譜與其它分析儀器聯(lián)用的技術(shù)，如氣相色譜-離子阱質(zhì)譜聯(lián)用儀、FTR-ITMS聯(lián)用技術(shù)。
 

　　賽默飛離子阱質(zhì)譜的專有技術(shù)：

　　1、寬帶激發(fā)技術(shù)能夠生成更多的結(jié)構(gòu)信息數(shù)據(jù)。

　　2、脈沖Q裂解技術(shù)保證對低質(zhì)量端離子的捕獲能力。

　　3、賽默飛離子阱質(zhì)譜已獲的自動增益控制保證任何掃描方式下離子阱都充滿*的離子數(shù)量。

　　4、動態(tài)排除技術(shù)保證離子強(qiáng)度較低的各類離子也有機(jī)會進(jìn)行二級質(zhì)譜和多級質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集。

　　5、規(guī)一化碰撞能技術(shù)消除離子阱質(zhì)譜儀二級質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)中的質(zhì)量歧視效應(yīng)，使不同儀器產(chǎn)生數(shù)據(jù)具有重現(xiàn)性。

　　賽默飛離子阱質(zhì)譜的主要應(yīng)用：

　　1、應(yīng)對代謝物鑒定和確證，可自動查找到所有可能的代謝物。

　　2、應(yīng)對蛋白質(zhì)組學(xué)和生物標(biāo)記問題，ETD解離技術(shù)使賽默飛離子阱質(zhì)譜成為蛋白質(zhì)組學(xué)研究更強(qiáng)大的分析工具。

　　3、是實(shí)現(xiàn)此技術(shù)的zui儀器。ETD與CID互為補(bǔ)充，提高蛋白序列覆蓋率；保護(hù)不穩(wěn)定PTM翻譯后修飾基團(tuán)，簡化數(shù)據(jù)分析；單次進(jìn)樣自動啟動CID和ETD。

　　4、母離子智能選擇：自動數(shù)據(jù)依賴多級質(zhì)譜采集技術(shù)不僅能為用戶提供預(yù)測代謝物結(jié)構(gòu)信息，也能提供提供未預(yù)測的代謝物結(jié)構(gòu)信息。此外，使用自動固定中性丟失數(shù)據(jù)依賴性掃描觸發(fā)三級質(zhì)譜掃描能檢測某一類的代謝物。使用MetWorks和MassFrontier分析軟件增強(qiáng)復(fù)雜基質(zhì)鐘代謝物篩選和鑒別功能，使譜圖解析更加簡便。

　　5、賽默飛離子阱質(zhì)譜可配置ETD裂解源，ETD能夠?yàn)榫€性離子阱提供類似ECD的裂解碎片，在生成大量肽段碎片的同時(shí)，保護(hù)不穩(wěn)定的PTM翻譯后修飾集團(tuán)，例如磷酸化翻譯后修飾。ETD功能與賽默飛世爾線性離子阱的高離子儲存量相結(jié)合，是蛋白質(zhì)和肽類分析的新型有效工具。