組學(xué)社區(qū)福利！重磅回看- HUPO 2020 賽默飛用戶會(huì)

HUPO作為蛋白質(zhì)組學(xué)的盛會(huì)，每年都會(huì)成為業(yè)內(nèi)關(guān)注的焦點(diǎn)。2020 年受到新冠疫情影響，轉(zhuǎn)戰(zhàn)線上，并新命名Connect。在這場(chǎng)代表蛋白質(zhì)組學(xué)ding尖水平的盛會(huì)上，有哪些令人耳目一新的新技術(shù)，又哪些讓人眼前一亮的新應(yīng)用？許多錯(cuò)過(guò)現(xiàn)場(chǎng)精彩內(nèi)容的老師一定有所遺憾。作為組學(xué)社區(qū)的福利之一，我們將為您回放HUPO 2020之中一場(chǎng)看點(diǎn)頗多的賽默飛用戶會(huì)：Accelerating COVID-19 Proteomics Research Using Tandem Mass Tags，讓您不再錯(cuò)失精彩！

看點(diǎn)直擊

看點(diǎn)一：TMT 定量分析

TMT標(biāo)記定量助力新冠研究

TMT標(biāo)記定量方案擁有更優(yōu)的分析速度、覆蓋深度和定量質(zhì)量；并可靈活與SILAC標(biāo)記技術(shù)聯(lián)用，進(jìn)行快速蛋白差異分析。

圖1. 多重增強(qiáng)蛋白質(zhì)動(dòng)力學(xué)(multiplexed enhanced protein dynamicsme, mePROD)實(shí)驗(yàn)流程（點(diǎn)擊查看大圖）

它的價(jià)值在于提升蛋白質(zhì)組的解析深度；一次性在多個(gè)樣品中量化蛋白水平的差異，定量準(zhǔn)確性更高；適用于更復(fù)雜的大樣本實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),有效地縮短了實(shí)驗(yàn)時(shí)間,加速確證病毒致病性相關(guān)的生物途徑以及尋找潛在的藥物靶標(biāo)。

看點(diǎn)二：直擊新冠

COVID-19研究熱點(diǎn)話題與成果展示

借助TMT實(shí)驗(yàn)流程，能夠從多角度分析SARS-CoV-2蛋白組學(xué)，進(jìn)而全面了解在新冠發(fā)展進(jìn)程中，SARS-CoV-2病毒的感染機(jī)制、宿主細(xì)胞信號(hào)通路的改變、輕重癥患者免疫反應(yīng)，以及COVID-19zhi療藥物的潛在靶點(diǎn)。

圖2. SARS-CoV-2引起的免疫相關(guān)蛋白變化（點(diǎn)擊查看大圖）

看點(diǎn)三：多種冠狀病毒的橫向分析

基于親和純化質(zhì)譜技術(shù)（AP-MS）和TMT流程，比較SARS-CoV-1和SARS-CoV-2、MERS-CoV非結(jié)構(gòu)同源蛋白與宿主蛋白的相互作用，量化不同病毒間 Nsp2、Nsp4及Nsp3同源蛋白的差異并進(jìn)行富集分析。

圖3. 病毒-宿主蛋白互做關(guān)系

借助AP-MS的特異性與TMT的高通量?jī)?yōu)勢(shì)，可以目標(biāo)性地開展蛋白互作圖譜分析，幫助揭示了SARS-CoV-1、SARS-CoV-2、MERS-CoV之間共享/*的病毒-宿主依賴關(guān)系 ，非結(jié)構(gòu)蛋白驅(qū)動(dòng)的病毒復(fù)制和致病性，調(diào)節(jié)蛋白穩(wěn)態(tài)用于疾病干預(yù)zhi療。

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