隨著對(duì)一些疾病逝行深入的研究后發(fā)現(xiàn)很多生理病理疾病的發(fā)生真實(shí)不僅僅跟蛋白本身的表達(dá)量相關(guān)，有些情況下蛋白的表達(dá)并沒(méi)有明顯的變化但是由于一些復(fù)雜的翻譯后修飾的改變從而影響了整個(gè)分子機(jī)制的改變。因此對(duì)樣本進(jìn)行蛋白翻譯后修飾的研究就顯得尤為重要。蛋白修飾內(nèi)容主要包括磷酸化、乙?；⒎核鼗?、糖基化、甲基化等。

研究難點(diǎn)

拿磷酸化修飾組學(xué)為例

在眾多的PTM類型中，磷酸化修飾（Phosphorylation modification）的蛋白占到了所有蛋白質(zhì)約三分之一，是普遍的修飾類型之一。會(huì)影響到細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞結(jié)構(gòu)、細(xì)胞增殖、凋亡、轉(zhuǎn)錄、代謝過(guò)程以及調(diào)控病原微生物的適應(yīng)能力等等，所以在不同細(xì)胞中，蛋白磷酸化水平會(huì)呈現(xiàn)不同的差異，特定位點(diǎn)的磷酸化程度可能從小于1%到大于90%。

由于磷酸化修飾組學(xué)基本都需要經(jīng)過(guò)一步富集過(guò)程，所以對(duì)于樣本量來(lái)說(shuō)是一個(gè)挑戰(zhàn)，而在質(zhì)譜整個(gè)分析過(guò)程中必須兼顧分辨率，準(zhǔn)確度，分析深度，靈敏度，重復(fù)性等多重難題。這往往導(dǎo)致在樣本珍貴情況下很難在低上樣量情況下得到高通量的數(shù)據(jù)，而隨著大隊(duì)列研究的背景下，巨量樣本的分析中，能否達(dá)到足夠分析數(shù)據(jù)的同時(shí)提升分析速度，這都是目前分析面臨的難題。

超越基因組藍(lán)圖

為了更好的面對(duì)挑戰(zhàn)，威斯康星大學(xué)Joshua J. Coon教授利用賽默飛新開(kāi)發(fā)的Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜儀開(kāi)發(fā)的DIA工作流程就非常好的解決了這個(gè)難題。

在2Th的窗口條件下，該流程利用了Astral分析器（非對(duì)稱無(wú)損質(zhì)量分析器）的200Hz快速二級(jí)掃描功能，可以在非常短梯度的達(dá)到之前很難達(dá)到的結(jié)果。Joshua J. Coon教授分別嘗試了7分鐘，15分鐘及30分鐘的Run to run上樣時(shí)間，在7分鐘的上樣時(shí)間就能輕松鑒定到超過(guò)23,000個(gè)磷酸化位點(diǎn)，而在30分鐘梯度更是提升到超過(guò)29,000個(gè)磷酸化位點(diǎn)。而RSD值同時(shí)可以控制在10.9%，在該進(jìn)一步提升上樣量到250ng時(shí)，在30分鐘上樣時(shí)間內(nèi)（包含平衡，洗脫和上樣時(shí)間），可以鑒定到超過(guò)35,000磷酸化位點(diǎn)，達(dá)到新的鑒定深度，同時(shí)也非常好的體現(xiàn)了Orbitrap Astral高分辨質(zhì)譜在高靈敏度蛋白質(zhì)組學(xué)中的強(qiáng)大性能。而當(dāng)做更多分級(jí)實(shí)驗(yàn)，在240分鐘時(shí)間，更是達(dá)到驚人的接近90,000磷酸化位點(diǎn)數(shù)據(jù)。

精彩會(huì)議預(yù)告

集近年全球蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域重大突破、前沿成果、最新的儀器設(shè)備展覽及分析技術(shù)的第十二屆中國(guó)蛋白質(zhì)組學(xué)大會(huì)將于 2023 年 9 月25 日-27 日在成都舉辦。

在本次會(huì)議上，作為賦能科技進(jìn)步全球服務(wù)商的賽默飛攜全新一代高分辨質(zhì)譜儀 Orbitrap Astral 的用戶使用數(shù)據(jù)線下亮相,為市場(chǎng)所期待。我們趕快來(lái)一探究竟!

賽默飛專題午餐會(huì)

顛覆認(rèn)知“質(zhì)”的飛躍

時(shí)間:9 月27 日     地點(diǎn):蜀風(fēng)廳 3

隨著 6 月 Obitrap Astral 高分辨質(zhì)譜儀驚艷面世和國(guó)內(nèi)外用戶的裝機(jī)與使用，第一波相關(guān)實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)陸續(xù)發(fā)布，這些數(shù)據(jù)無(wú)一不在證明此款儀器在組學(xué)領(lǐng)域的劃時(shí)代地位。Orbitrap Astral 到底是如何實(shí)現(xiàn)集高通量、高靈敏度和深度覆蓋于一體為蛋白組學(xué)研究帶來(lái)革命性技術(shù)突破? 賽默飛將在本次午餐會(huì)詳細(xì)揭曉國(guó)內(nèi)外用戶實(shí)測(cè)一手?jǐn)?shù)據(jù)。參與當(dāng)天活動(dòng)，更有機(jī)會(huì)把 Orbitrap Astral 同款積木帶回家!