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賽默飛色譜及質譜

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ASTRAL客戶之聲| 高通量與高深度兼得,拓展蛋白質分析的極限

閱讀:549      發(fā)布時間:2023-12-3
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原創(chuàng) 飛飛 賽默飛色譜與質譜中國

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導語:

賽默飛在2023年ASMS上發(fā)布的全新Orbitrap Astral超高分辨質譜儀,一經(jīng)問世立即引起了國內學界的廣泛關注。隨之,眾多行業(yè)精英紛紛訂購這一劃時代的革命性產(chǎn)品。隨著shou批用戶的裝機,相關實測數(shù)據(jù)陸續(xù)發(fā)布。為此我們精心匯總了shou家用戶—諾禾致源所攬獲的實測數(shù)據(jù),從細胞到血漿,從植物到動物,這款革命性的質譜儀以其無與lun比的性能,quan方位刷新了學界對質譜儀的認知。

 

 

 

01

Hela細胞--180 runs/天,

真正的高通量分析時代已經(jīng)來臨

采用Orbitrap Astral高分辨質譜儀對Hela細胞裂解液樣本進行分析,分別測試8 min、15 min、24 min 的時間梯度。結果顯示,8 min 梯度(包括上樣、平衡、洗脫、有效分析時間的總時長)下蛋白質鑒定數(shù)目可達8,000+。這意味著每天可實現(xiàn)180個樣本的分析通量,運行成千上萬樣本的大隊列分析可成為每個蛋白質組學實驗室的日常。真正的高通量分析時代已經(jīng)來臨!

 

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24 min梯度下,鑒定數(shù)目可輕松達到 10,000+,實現(xiàn)更高深度的覆蓋。該測試結果不僅相較HF-X(1μg上樣量,90分鐘梯度)的分析深度(7285個蛋白)得到了3400+新的蛋白質定性數(shù)據(jù),而且可覆蓋HF-X數(shù)據(jù)的98.5%。這意味著采用Astral分析平臺,不僅可以完美重現(xiàn)以往深度分析的鑒定結果,還使分析效率提升了3-4倍,同時獲得了更卓越的鑒定效果。Astral多快好省助力蛋白質組學高深度分析。

 

02

血漿-短梯度蛋白分析深度新突破

以往,血漿蛋白質組的復雜性限制了大規(guī)模、無偏的蛋白質組學研究。使用Orbitrap Astral高分辨質譜儀,對不同血漿蛋白質組學研究方法的性能進行了比較,得到了前suo未有的優(yōu)異結果。通過去除高豐度蛋白,顯著增加了分析的深度。僅使用500 ng血漿蛋白量,在24min梯度下鑒定數(shù)目就可以超過1,200個,血漿蛋白鑒定數(shù)目提升45%。這一發(fā)現(xiàn)使得在精簡的工作流程基礎上,實現(xiàn)血漿蛋白質組學高深度、廣覆蓋的研究成為現(xiàn)實。

 

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03

植物組織-一針上樣窮盡擬南芥蛋白定性結果成為可能

采用非數(shù)據(jù)依賴性數(shù)據(jù)采集模式(DIA), Orbitrap Astral 質譜儀實現(xiàn)了擬南芥樣本的高深度分析。其中,擬南芥葉樣本蛋白鑒定數(shù)目達到11,195,根莖樣本蛋白鑒定數(shù)目達到12,781。值得注意的是,與 2020 年Nature公開發(fā)表的擬南芥蛋白質深度分析數(shù)據(jù)相比,本次在 Astral 平臺僅通過2種擬南芥樣本,3次重復,在短短24min梯度分析中得到的蛋白分析結果,即可覆蓋30種擬南芥組織公開數(shù)據(jù)80%以上的蛋白。這表明通過 Astral 質譜儀,或可實現(xiàn)僅通過單針上樣即可基本窮盡樣本蛋白質定性結果。

 

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04

動物組織-輕松擴展蛋白質分析的邊界

使用 Orbitrap Astral 高分辨質譜儀檢測,在小鼠組織樣本可在24min梯度輕松實現(xiàn)蛋白鑒定數(shù)10,000+,肽段鑒定數(shù)目120,000+的優(yōu)異結果。其中小鼠腦組織樣本蛋白鑒定數(shù)目為11,204,小鼠睪丸組織樣本蛋白鑒定數(shù)目12,660,小鼠腎臟組織樣本蛋白鑒定數(shù)目10,544。這些測試數(shù)據(jù)進一步刷新和擴展了動物組織樣本分析的邊界,為廣大科研工作者帶來更多科技的驚喜和突破!

 

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卓越的穩(wěn)定性和定量準確性

在實現(xiàn)上述亮眼測試結果的同時,也對Astral進行了重復性和穩(wěn)定性測試。對200 ng蛋白含量的Hela細胞裂解液樣本進行3次重復進樣檢測,對所鑒定蛋白CV進行統(tǒng)計,發(fā)現(xiàn)3次進樣CV<20%的占比為92.7%,CV的中位值是3%(下圖左)。

使用Orbitrap Astral 高分辨質譜儀能夠精確測定由小鼠腦組織、大腸桿菌和擬南芥多種比例的混合物樣本中每種來源的蛋白質比例,表明數(shù)據(jù)采集具有出色的準確性。該項測試中共鑒定得到 14,153 種蛋白質,包括幾乎整個大腸桿菌蛋白質組(下圖右)。

 

(點擊查看大圖)

注:文中所有實測數(shù)據(jù)來自北京諾禾致源生物科技有限公司

諾禾致源(688315)成立12年以來,始終基于用戶需求不斷探索更多應用場景下的多組學整合解決方案。在蛋白質組和代謝組學研究方面,基于高性能質譜平臺以及樣本處理全自動化產(chǎn)線,積累了豐富的檢測及分析經(jīng)驗。此次引進賽默飛Orbitrap Astral高分辨質譜平臺,將助其繼續(xù)發(fā)揮專業(yè)優(yōu)勢,以豐富的項目經(jīng)驗、優(yōu)質高效穩(wěn)定的服務為科研工作者賦能。

 

結語

 

在諾禾致源多次測試中,Orbitrap Astral都以令人振奮的性能刷新了質譜分析的能力邊界。如下圖所示,它將久經(jīng)考驗的 Orbitrap 分析器與全新的 Astral 分析器相結合,將 Orbitrap超高分辨的優(yōu)勢發(fā)揮到ji致的同時,兼具超快的掃描速度和超高的檢測靈敏度,集高通量、高覆蓋度,及精準定量性于一體。可全方面為DIA(數(shù)據(jù)非依賴掃描)、PTM(蛋白質翻譯后修飾)、TMT18-plex標記定量、單細胞蛋白質組學、大隊列分析等領域帶來革命性的變革,讓我們共同期待中國shou批用戶后續(xù)更多維度的測試數(shù)據(jù)。

 

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