賽默飛Orbitrap Eclipse三合一超高分辨質(zhì)譜儀從根本上提高了定量蛋白質(zhì)組分析的靈敏度、速度和準(zhǔn)確性，以及全面定義蛋白質(zhì)形式和蛋白質(zhì)復(fù)合物的能力。HMRn（高質(zhì)量范圍MSn）、PTCR（質(zhì)子轉(zhuǎn)移電荷減少）和RTS（實時搜索）的加入是專門設(shè)計的功能，極大地提高了質(zhì)譜識別重要生物分子的能力，并在結(jié)構(gòu)上以*的詳細(xì)程度對它們進行研究。在保持Orbitrap Fusion Lumos三合一質(zhì)譜性能的基礎(chǔ)上，Eclipse提升了如下主要性能：
（1）HMRn（High Mass Range MSn，高質(zhì)量范圍MSn）：MSn多級質(zhì)譜的分子量范圍可達(dá)到8,000 Da，包括擴展Orbitrap的m/z 至8,000和LTQ分離母離子m/z至8,000，并具有MSn（n=1~10）能力。比如使用HMRn做NativeOmics，可以用多級質(zhì)譜鑒定膜蛋白的配體，更好理解蛋白的相互作用。
（2）PTCR（Proton Transfer Charge Reduction ，質(zhì)子轉(zhuǎn)移電荷減少）離子源：全氟菲烷(PFPP) 離子，用于隨后雙級線性離子阱中的氣相離子反應(yīng)，利用質(zhì)子轉(zhuǎn)移減少母離子或子離子的多電荷態(tài)，使多電荷譜圖的質(zhì)量提高、Top-down組學(xué)的解析更容易，可以更好地揭示蛋白隱藏的特征。
（3）RTS（Real-time search實時搜索）算法軟件：提供了強大的數(shù)據(jù)庫功能，當(dāng)已鑒定的蛋白和初始數(shù)據(jù)庫匹配*就標(biāo)記為不再進行MS3，因此可有效縮短時間，提升1倍通量。在選擇已確定的母離子進行 SPS MS3 定量時，可提高定量準(zhǔn)確性和TMT實驗的蛋白質(zhì)組覆蓋率。
（4）雙曲面QR5 分段四極桿：增長為25 cm，并擴大直徑，提升離子傳輸效率，并可有限選擇分離0.4 Da的母離子。
（5）具有50萬分辨率，擴展選項后可達(dá)到100萬分辨率。