一、實(shí)驗(yàn)原理
植物DNA的制備與動(dòng)物DNA制備原理大致相同,為獲得高相對(duì)分子質(zhì)量DNA,應(yīng)取幼嫩組織或組織培養(yǎng)物為材料,常以液氮冷凍下研磨的方法破組織和細(xì)胞。
由于植物材料DNase水平低,蛋白含量較少,其操作要求是要克服植物次生代謝物如多酚、類黃酮和植物多糖與DNA共存對(duì)制備的影響。
二、實(shí)驗(yàn)用品
(一)器材
(1)冰凍高速離心機(jī)。
(2)液氮罐。
(3)臺(tái)式離心機(jī)。
(4)電熱恒溫水浴鍋。
(5)電熱恒溫培養(yǎng)箱。
(6)電冰箱,離心管和tip。
(二)試劑
(1)5mol/L Nacl:稱取NaCL 146.10g用蒸餾水定容至500ml。
(2)CTAB(十六烷基*基溴化銨)緩沖液。
A.2mol/L Tris.HCL緩沖液(pH8.0):24.2g Tris溶于80ml重蒸水中,用濃鹽酸調(diào)節(jié)pH至8.0,用重蒸水定容至100ml。
B.0.5mol/L EDTA緩沖液(PH8.0):取186.12g EDTA.Na2用重蒸水800ml溶解,然后用NaOH調(diào)節(jié)pH至8.0,加重蒸水至1000ml。
(3)巰基乙醇。
(4)PVP(聚乙稀吡咯烷酮)。
(5)石英砂。
(6)Trichloromethane:異戊醇(24:1),現(xiàn)用現(xiàn)配。
(7)異丙醇。
(8)75%乙醇。
(9)TE緩沖液:取5ml 2mol/L Tris-HCL和2ml0.5mol/L EDT.Na2。用重蒸水定容至1000ml。
(10)RNase A:取100mg RNase溶于10ml含有10mmol/L Tris(pH7.5)-15mmol/L Nacl 的溶液中,于100℃加熱15min,緩慢冷卻至室溫,分裝成小份保存于-20℃。
(三)材料
水稻幼苗或蠶豆幼苗和白菜嫩葉等。
二、實(shí)驗(yàn)程序
(一)操作方法
1.操作步聚
(1)在50ml離心管中加入10ml CTAB緩沖液。
(2)取1~2g新鮮葉片(去主脈)于研缽中,加入0.1gPVP或石英砂,在液氮中迅速研磨成粉末后,把粉末轉(zhuǎn)入帶CTAB緩沖液的離心管中,邊加邊攪拌使之混合均勻。
(3)于65℃水浴保溫0.5~1h。
(4)冷卻至室溫后,加入等體積10mlTrichloromethane異戊醇溶液,顛倒混勻10min。
(5)10000 r/min離心10min,去沉淀,將上清液轉(zhuǎn)入另一離心管中。
(6)在上清液中加入1/10體積的3mol/L醋酸鈉和1倍體積的異丙醇 10ml或2倍體積乙醇,輕緩顛倒混合均勻,于-20℃放置30min。
(7)10000 r/min 4℃離心10min,去上清液。
(8)用2ml75%乙醇洗滌2次去除鹽(可放置-20℃冰箱過液)。
(9)倒去75%乙醇,37℃干燥20分鐘,再溶于600µL TE緩沖液中,轉(zhuǎn)移至1.5ml EP管。
(10)加入3µL RNase A ,37℃保溫30min。
(11)用等體積Trichloromethane異戊醇溶液抽提1~3次。
(12)10000r/min,4℃離心10min,吸取上清。
(13)上清液加入1/10體積4mol/L NaCL溶液后,加入2倍體積無水乙醇,放置20min后,10000r/min,離心5min沉淀DNA。
(14)沉淀用75%乙醇乙洗滌2~3次,37℃保溫箱中干燥后溶于適量的TE緩沖液中備用。
2得率的計(jì)算
由于1OD260的DNA濃度為50µg/ml,因此DNA得率可按下公式計(jì)算:
1g新鮮組織的DNA含量=OD260×50×溶解體積/組織鮮重(µg DNA/g)。
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