乾思 生物編輯整理:
如何選購抗體?選購時(shí)需要考慮哪些方面的問題?
1.該定制單抗還是多抗?首先應(yīng)該考慮的就是定制的抗體是應(yīng)用于什么實(shí)驗(yàn),需要的量是多少?
對(duì)于科研用戶來說1. 抗體常常應(yīng)用于WesternBlotting、IP等實(shí)驗(yàn)中,對(duì)于抗體的特異性有一定的要求,但并不是特別的強(qiáng)調(diào)2. 往往在研究很多新的蛋白時(shí),并不確定新蛋白是否很重要,是否會(huì)是將來很長(zhǎng)一段時(shí)間的研究重點(diǎn),所以抗體用量也不大所以針對(duì)科研用戶,在定制新的蛋白的抗體時(shí),我們強(qiáng)烈建議首先制備多抗用于實(shí)驗(yàn),當(dāng)?shù)玫搅死硐氲膶?shí)驗(yàn)結(jié)果并需要長(zhǎng)期的使用該抗體時(shí)再考慮制備單抗。當(dāng)然,如果您對(duì)該抗體的特異性要求特別高(多抗的特異性已無法滿足實(shí)驗(yàn)要求,比如應(yīng)用于流式細(xì)胞術(shù)等)時(shí),還是應(yīng)該定制單抗
對(duì)于工業(yè)用戶來說1. 抗體往往應(yīng)用于檢測(cè)定量實(shí)驗(yàn)或者功能性實(shí)驗(yàn),對(duì)于抗體的特異性要求非常之高2. 目標(biāo)蛋白基本上都是已知的確定有相當(dāng)商業(yè)開發(fā)價(jià)值的,而且產(chǎn)品一旦形成,用量會(huì)非常大所以針對(duì)工業(yè)用戶,基本上可以直接定制單抗
2.該選多肽還是蛋白作為抗原呢?
需要根據(jù)抗體應(yīng)用于什么實(shí)驗(yàn),以及您所能獲得的材料來決定 1. 實(shí)驗(yàn)過程中蛋白處于天然狀態(tài),這時(shí)使用的抗體識(shí)別的一般是蛋白的構(gòu)象表位和線性表位;這樣的實(shí)驗(yàn)主要有CO-IP、FACS、Neutralizing/Blocking以及Elisa法檢測(cè)天然蛋白等2. 實(shí)驗(yàn)過程中蛋白處于變性或半變性狀態(tài),這時(shí)大部分的構(gòu)象表位已被破壞,抗體識(shí)別的一般都是線性表位;這樣的實(shí)驗(yàn)主要有:Western、IHC/ICC/IF等以多肽作為抗原制備的抗體,識(shí)別的是線性表位,在使用時(shí)蛋白處于變性或半變性狀態(tài)下,結(jié)果可以令人滿意;但不能夠保證識(shí)別天然蛋白以蛋白作為抗原制備的抗體,識(shí)別蛋白的線性和構(gòu)象表位,基本上所有的實(shí)驗(yàn)都可以應(yīng)用,所以,用蛋白作為抗原應(yīng)是,但是在多肽抗原已可滿足實(shí)驗(yàn)要求而且得到蛋白有一定難度的情況下,以多肽作為抗原制備抗體更加合適。
3、什么情況應(yīng)該考慮用設(shè)計(jì)多肽做抗原?
答:如果氨基酸序列已知,但是由于基因克隆或表達(dá)等原因得不到抗原蛋白,或者僅需要得到針對(duì)抗原蛋白某幾個(gè)特定表位的抗體,就可以采用多肽合成的方式得到抗原。例如僅需要生產(chǎn)針對(duì)蛋白質(zhì)某個(gè)區(qū)域的特異抗體,比如研究蛋白質(zhì)N端的前體物,可以設(shè)計(jì)N末端的多肽抗原。如果抗體的使用目的是識(shí)別修飾的氨基酸,如磷酸化的絲氨酸、蘇氨酸或者酪氨酸,乙?;嚢彼岬龋捅仨殞?duì)多肽進(jìn)行相應(yīng)的修飾。一般情況下抗血清能夠識(shí)別用來免疫的多肽序列,但是不一定識(shí)別天然蛋白質(zhì)的折疊結(jié)構(gòu)。非連續(xù)性抗原的抗體能否識(shí)別抗原決定簇取決于用于抗體生產(chǎn)的多肽是否存在二級(jí)結(jié)構(gòu)。
4、設(shè)計(jì)多肽做抗原時(shí)的幾點(diǎn)基本原則?
答:識(shí)別區(qū)域的選擇原則一般說來的抗原性識(shí)別區(qū)域應(yīng)具備親水、位于蛋白表面和結(jié)構(gòu)上易變形性等特點(diǎn)。既要考慮其免疫原性、特異性,還需考慮其合成難度等。通常有以下幾點(diǎn)建議:1、序列長(zhǎng)度在8-20個(gè)氨基酸殘基之間(如果太短,就有多肽太特殊、所產(chǎn)生的抗體與天然蛋白之間的親和力(結(jié)合能力)不夠強(qiáng)的風(fēng)險(xiǎn),同樣,如果序列長(zhǎng)度超過20,將有可能引入二級(jí)結(jié)構(gòu),所產(chǎn)生的抗體失去特異性的可能,而且肽鏈越長(zhǎng),通常合成難度增大,不易獲得高純度的產(chǎn)品);2、盡可能是在蛋白表面;3、保證該段序列不形成α-helix;4、N,C端的肽段比中間的肽段更好;避免蛋白內(nèi)部重復(fù)或接近重復(fù)段的序列;5、避免同源性太強(qiáng)的肽段;6、交聯(lián)可以交聯(lián)在N,C兩端,選擇依據(jù)就是交聯(lián)在對(duì)產(chǎn)生抗體不太重要的一端;7、序列中不能有太多的Pro,但有一兩個(gè)Pro有好處,可以使肽鏈結(jié)構(gòu)相對(duì)穩(wěn)定一些,對(duì)產(chǎn)生特異性抗體有益。
5、原核表達(dá)含GST標(biāo)簽的蛋白制備抗體時(shí),需要切掉GST標(biāo)簽嗎?
答:如果目的蛋白很大且之后的實(shí)驗(yàn)不受GST影響的話,GST標(biāo)簽是不用切掉的。但是如果目的蛋白小于20KD的話,建議通過實(shí)驗(yàn)切除GST標(biāo)簽。
6、抗體的保存:
答:小包分批,避免多次反復(fù)凍融。短期:4度冰箱保存。長(zhǎng)期:-20度,一般需要加入甘油,BSA等。
7、關(guān)于抗原的常識(shí)
答:對(duì)抗原的要求是純度越高越好,尤其是初次免疫所用的抗原。如為細(xì)胞抗原,可取1×107個(gè)細(xì)胞作腹腔免疫??扇苄钥乖杓?福氏佐劑并經(jīng)充分乳化,如為聚丙烯酰胺電泳純化的抗原,可將抗原所在的電泳條帶切下,研磨后直接用以動(dòng)物免疫。還有一些半抗原,如多肽,在免疫之前是需要耦聯(lián)一些蛋白,如KLH,BSA等。 病毒類的抗原,可以直接用于免疫。如果是蛋白,一般來說,蛋白的純度要在90%以上,濃度在1mg/ml以上,分子量>10kd。一般融解在無毒的緩沖液中 ,建議溶解在PBS中。