各位讀者好,今天為大家?guī)硪黄褂?span style=";padding: 0px;color: red">加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)結(jié)合網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)篩選增生性瘢痕治療藥物的高分文章,是由中國醫(yī)
學(xué)科學(xué)院團隊2024年5月在The British journal of dermatology發(fā)表的,題為“Using network pharmacology to discover potential drugs for
hypertrophic scars"。揭示了增生性瘢痕的分子發(fā)病機制并篩選了有效治療藥物。

研究框架:
1. 提出研究問題
增生性瘢痕現(xiàn)有藥物治療效果不佳,為探索其分子發(fā)病機制并篩選有效治療藥物而開展研究。
2. 構(gòu)建研究框架
從基因模塊入手,尋找與增生性瘢痕相關(guān)的基因模塊和關(guān)鍵基因,再基于這些結(jié)果篩選化合物,通過多種實驗驗證潛在藥物的有效性。
3. 選擇研究方法
數(shù)據(jù)獲取與分析:利用NCBI Gene Expression Omnibus的增生性瘢痕轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),采用加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA),計算模塊特征基因、基因顯
著性等。
富集分析:通過Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)富集分析,明確基因功能。
蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析:選擇特定基因構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),利用Connectivity Map數(shù)據(jù)庫預(yù)測藥物。
分子對接:對篩選出的候選藥物與關(guān)鍵蛋白進行分子對接。
實驗驗證:包括細胞培養(yǎng)(人增生性瘢痕成纖維細胞)、實時聚合酶鏈反應(yīng)、傷口愈合實驗、CCK8細胞增殖實驗、蛋白質(zhì)印跡法以及小鼠實驗等。
4. 分析數(shù)據(jù)
對體外和體內(nèi)實驗數(shù)據(jù)采用方差分析和混合效應(yīng)模型進行重復(fù)測量分析。
5. 得出結(jié)論
通過上述研究發(fā)現(xiàn)ITGB1和TGF - β信號通路對增生性瘢痕形成非常重要,克唑替尼可作為潛在治療藥物。

參考文獻
[1]Zhang Y, Li X, Yu Q, et al. Using network pharmacology to discover potential drugs for hypertrophic scars[J]. Br J Dermatol, 2024,191(4):592-604.