宏基因測序 服務介紹 宏基因組學研究不要求對每個微生物進行分離純化培養(yǎng)，而是直接從樣品中提取基因組DNA后進行測序分析。通過宏基因組測序，能夠解釋微生物群落多樣性、種群結構、進化關系、功能活性及環(huán)境之間的相互協作關系，大大地擴展了微生物學研究范圍。環(huán)境微生物多樣性檢測是指通過對環(huán)境中微生物16S rDNA高變區(qū)/ITS 的PCR擴增產物進行高通量測序，分析該環(huán)境下微生物群落的多樣性和分布規(guī)律。

宏基因測序 分析項目

標準分析項目

1.去除宿主污染，產出數據及質控統計；

2.組裝前，通過K-mer分析評估樣品的測序深度；

3.序列組裝；

4.基因組結構注釋（串聯重復序列注釋、短回文重復序列注釋、可變遺傳因子注釋、基因編碼區(qū)域預測、NCBI NR庫比對、致病島預測、前噬菌體預測、毒力因子預測，可選）；

5.基因功能注釋（GO功能注釋，KEGG通路注釋，Swissprot數據庫注釋、COG功能分類）；

6.比較基因組分析（基因家族分析，系統進化樹構建，物種分期時間預測）；

7.生物種類和豐度估計；

8.樣本間群落結構比較（多樣本）；

9.微生物生物分布與環(huán)境關聯分析（多樣本）。

分析項目：重要結論的獲得、聚類分析、主成分分析、通路富集分析、功能富集分析、個性化分析。