Rubicon PicoPLEX 全基因組擴(kuò)增用于單細(xì)胞無創(chuàng)產(chǎn)前檢測

Rubicon PicoPLEX

英文名：Rubicon PicoPLEX WGA Kit

中文名：Rubicon單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒

☆ 單細(xì)胞或6pg基因組DNA起始的全基因組DNA擴(kuò)增試劑盒。

☆ 單個(gè)反應(yīng)管、3小時(shí)，3步反應(yīng)的簡單操作流程（手動(dòng)操作時(shí)間只需要15分鐘）。

☆ 適合拷貝數(shù)變異分析（CNV）、染色體異倍性（aneuploidy）分析。

PicoPLEX WGA Kit采用技術(shù)，設(shè)計(jì)優(yōu)化用于從單細(xì)胞中擴(kuò)增全基因組DNA。起始樣本量低至單細(xì)胞或6pg基因組DNA。便捷的單管操作流程降低污染節(jié)省時(shí)間。結(jié)果穩(wěn)定性、重復(fù)性好。

應(yīng)用推薦：PGS/PGD，單細(xì)胞NIPT，循環(huán)腫瘤細(xì)胞分析

Rubicon PicoPLEX用于NIPT的文獻(xiàn)

文獻(xiàn)范圍：2014年以后發(fā)表的文獻(xiàn)

應(yīng)用概述：PicoPLEX單細(xì)胞擴(kuò)增所得文庫在下游單細(xì)胞的STR、CNV、SNP等遺傳變異檢測表現(xiàn)良好，適用于單細(xì)胞產(chǎn)前無創(chuàng)檢測。

1. 

文獻(xiàn)：Short Tandem Repeat analysis after Whole Genome Amplification of single B-lymphoblastoid cells.（B淋巴母細(xì)胞系單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增后的微衛(wèi)星分析）

Lieselot Deleye(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學(xué)藥物生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室),et al.

Scientific Reportsvolume 8, Article number: 1255 (2018)

遺傳變異檢測：短串聯(lián)重復(fù)序列，英文Short Tandem Repeat，簡稱STR。又稱微衛(wèi)星（Microsalite），簡單重復(fù)序列（英語：Simple Sequence Repeats，SSRs）。

意義：使用單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增（WGA）試劑，以用于下游的單細(xì)胞微衛(wèi)星分析?？捎糜诨趩渭?xì)胞檢測的無創(chuàng)產(chǎn)前檢測。

Rubicon PicoPLEX作用：PicoPLEX雖然沒有檢測到所有微衛(wèi)星標(biāo)記，但仍適用于臨床單細(xì)胞的遺傳學(xué)鑒別。

2.

文獻(xiàn)：STR profiling and Copy Number Variation analysis on single, preserved cells using current Whole Genome Amplification methods.(使用現(xiàn)行全基因組擴(kuò)增方法對單個(gè)保存細(xì)胞進(jìn)行STR和染色體拷貝數(shù)變異分析）

Ann-Sophie Vander Plaetsen(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學(xué)藥物生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室),et al.

Scientific Reportsvolume 7, Article number: 17189 (2017)

遺傳變異檢測

STR

CNV：英文 Copy Number Variation，染色體拷貝數(shù)變異

意義：單細(xì)胞無創(chuàng)產(chǎn)前檢測等液體活檢因?yàn)榧?xì)胞的稀有和脆弱，需要更的單細(xì)胞分析技術(shù)。PicoPLEX等單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增試劑盒可以對微量DNA進(jìn)行無偏向的WGA擴(kuò)增，以用于下游STR和CNV分析。

方法：細(xì)胞用Streck Cell-Free DNA BCT 采血管保存，使用PicoPLEX等WGA試劑盒進(jìn)行單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增后進(jìn)行STR與CNV分析。

Rubicon PicoPLEX作用：在幾種WGA試劑盒中，PicoPLEX表現(xiàn)良好，對于STR和CNV均適用。

3.

文獻(xiàn)：Performance of four modern whole genome amplification methods for copy number variant detection in single cells.（四種全基因組擴(kuò)增方法用于單細(xì)胞拷貝數(shù)變異檢測的性能表現(xiàn)）

Lieselot Deleye(Laboratory of Pharmaceutical Biotechnology, Ghent University根特大學(xué)藥物生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室),et al.

遺傳變異檢測：CNV

意義：單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增技術(shù)可用于胚胎植入前遺傳診斷，單細(xì)胞無創(chuàng)產(chǎn)前檢測和循環(huán)腫瘤細(xì)胞的液體活檢。即PGD、NIPT和CTC。

Rubicon PicoPLEX作用：PicoPLEX試劑擴(kuò)增單細(xì)胞后，適合通過低深度全基因組大規(guī)模平行測序（MPS，又名NGS）進(jìn)行CNV分析。

4.

文獻(xiàn)：Evidence for feasibility of fetal trophoblastic cell‐based noninvasive prenatal testing.(胎兒滋養(yǎng)細(xì)胞用于單細(xì)胞無創(chuàng)產(chǎn)前檢測可行性的證據(jù)）

Amy M. Breman（Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine貝勒醫(yī)學(xué)院 分子與人類遺傳學(xué)系）,et al.

PRENATAL DIAGNOSIS,First published: 12 September 2016.

遺傳變異檢測：染色體和亞染色體變異

意義：通過孕早期（10-16周期）母體血液獲得胎兒細(xì)胞，單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增后，進(jìn)行基因分型。

方法

擴(kuò)增：WGA技術(shù)

分析：array CGH 或 NGS

Rubicon PicoPLEX作用：用于單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增。

5.

文獻(xiàn)：Comparison of three whole genome amplification methods for detection of genomic

aberrations in single cells.(三種用于單細(xì)胞基因組結(jié)構(gòu)異常檢測的全基因組擴(kuò)增方法比較）

Elizabeth Normand（Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine貝勒醫(yī)學(xué)院 分子與人類遺傳學(xué)系）,et al.

PRENATAL DIAGNOSIS,First published: 02 July 2016

Keywords: Whole genome amplification, array CGH, genotyping, non-invasive prenatal

diagnosis, fetal cells

關(guān)鍵詞：全基因組擴(kuò)增，微陣列比較基因組雜交，基因分型，無創(chuàng)產(chǎn)前診斷，胎兒細(xì)胞

遺傳變異檢測：染色體拷貝數(shù)異常

意義：比較了三種商業(yè)全基因組擴(kuò)增（WGA）試劑盒從單細(xì)胞中獲得高質(zhì)量DNA的能力。結(jié)果顯示W(wǎng)GA試劑所得DNA文庫適合用于單細(xì)胞分子分型和拷貝數(shù)分析。

Rubicon PicoPLEX作用：PicoPLEX相比其他品牌試劑盒對于非固定細(xì)胞的SNP檢測較好。

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