geneticsignatures 腸道病原篩選試劑盒
Genetic Signatures成立于2001年,由Geoffrey Grigg博士(原澳大利亞聯(lián)邦科學(xué)與工業(yè)研究組織(CSIRO)分子生物學(xué)部主任)創(chuàng)立。甲基化分析中使用廣泛的方法是亞硫酸氫鹽法,由Grigg博士在英國(guó)劍橋設(shè)想,并被減少到CSIRO實(shí)驗(yàn)室的實(shí)踐中[1]。初的方法隨后得到改進(jìn),這些改進(jìn)導(dǎo)致了遺傳簽名MethylEasy™DNA亞硫酸氫鈉修飾產(chǎn)品系列的開發(fā)和發(fā)布。
由于改進(jìn)的轉(zhuǎn)化方法和用于胞嘧啶甲基化檢測(cè)的應(yīng)用,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)有趣的發(fā)現(xiàn):通過(guò)亞硫酸氫鈉處理微生物DNA能夠?qū)⑺姆N核酸堿基還原成僅三個(gè)堿基,通過(guò)將胞嘧啶轉(zhuǎn)化為胸腺嘧啶。該技術(shù)被稱為3base ™,是我們的EasyScreen ™病原體檢測(cè)試劑盒的基石。
此后,遺傳標(biāo)志開發(fā)并商業(yè)化了一套基于EasyScreen ™實(shí)時(shí)PCR的產(chǎn)品,用于常規(guī)檢測(cè)傳染病。EasyScreen ™產(chǎn)品為醫(yī)院和病理實(shí)驗(yàn)室提供了分子工具,可在快速高通量的環(huán)境中篩查各種傳染性病原體。
腸道病原篩選試劑盒
胃腸疾病可能由各種各樣的感染因素引起,包括病毒,細(xì)菌和原生動(dòng)物。因此,傳染性胃腸疾病的診斷可能具有挑戰(zhàn)性,并且涉及微生物學(xué),病毒學(xué)和寄生蟲學(xué)方面的專家。
據(jù)估計(jì),澳大利亞每年有1680萬(wàn)胃腸炎病例,導(dǎo)致醫(yī)院急診科就診25萬(wàn)人,住院15,000人,死亡80人[1]。
為了簡(jiǎn)化感染性胃腸道疾病病原體的檢測(cè),我們開發(fā)了 EasyScreen™ 實(shí)時(shí)PCR篩選檢測(cè)方法,用于所有主要胃腸炎病原體。所有的分析方法都采用通用樣品處理方法,并采用我們之前描述的 3base™ 技術(shù) [2]。
傳統(tǒng)的胃腸炎診斷在某些情況下可能需要長(zhǎng)達(dá)5天[3]才能提供明確的結(jié)果。為了減少這種情況,我們的實(shí)驗(yàn)提供了樣品,可以在3小時(shí)內(nèi)完成結(jié)果周轉(zhuǎn)時(shí)間。
遺傳特征 EasyScreen ™腸道病原體檢測(cè)試劑盒具有以下優(yōu)點(diǎn):
- 集成的自動(dòng)化樣品處理方法
提供從臨床樣品到可報(bào)告結(jié)果的完整工作流程。通過(guò)這種方式,結(jié)果也從實(shí)驗(yàn)室到實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化。 - 快速檢測(cè)
從樣本到結(jié)果3-5小時(shí),與傳統(tǒng)方法相比,少的手工操作時(shí)間 - 內(nèi)置控制
由于提取失敗和抑制控制可降低錯(cuò)誤結(jié)果的可能性,因此對(duì)結(jié)果具有高度的置信度 - 實(shí)時(shí)PCR格式
無(wú)PCR后處理,幾乎消除了污染的可能性 - 全面涵蓋常見病原體
同時(shí)檢測(cè)到一種標(biāo)本制劑導(dǎo)致的22種引起胃腸炎的病原體 - 開放式平臺(tái)
兼容大多數(shù)病理實(shí)驗(yàn)室常見的自動(dòng)化樣品制備系統(tǒng)和實(shí)時(shí)PCR儀器
該 EasyScreen™ 腸道病原體檢測(cè)試劑盒包括:
產(chǎn)品# | EasyScreen™套件 | 檢測(cè)到微生物 |
---|---|---|
EB001和EB001-HT | 腸道細(xì)菌檢測(cè) | (i)沙門氏菌屬 (ii)彎曲桿菌屬(Campylobacter spp。) (iii)痢疾桿菌/腸內(nèi)侵襲性大腸桿菌(EIEC) (iv)小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌。 (v)產(chǎn)毒的艱難梭菌和 (vi)單核細(xì)胞增生李斯特菌 |
EP001和EP001-HT | 腸道原生動(dòng)物檢測(cè) | (i)隱孢子蟲屬, (ii)腸道賈第蟲, (iii)脆弱東部阿米巴, (iv)溶組織內(nèi)阿米巴,和 (v)人芽囊原蟲(Blastocystis hominis) |
EV002和EV002-HT | 腸道病毒檢測(cè) | (i)諾如病毒GI (ii)諾如病毒GII (iii)星狀病毒 (iv)輪狀病毒A (v )沙波病毒 (vi)腸病毒 (vii)博卡 病毒(viii)腺病毒和 (ix)腺病毒(僅40 + 41) |
CDD001 | 艱難梭菌檢測(cè) | 致病性艱難梭菌(針對(duì)tcdA和tcdB) |
CDD002 | 艱難梭菌反射 | 超致病性艱難梭菌包括 (i)位置117處的tcdC基因缺失, (ii)二元毒素基因(cdtA)和 (iii)gyrA基因突變(氟喹諾酮耐藥性)的核糖體027和078 , |
對(duì)于HT(384孔格式)試劑盒,所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs。
所有 EasyScreen™ 腸道病原體檢測(cè)試劑盒可用于使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒制備的核酸 。
有關(guān)EasyScreen™ 工作流程以及與核酸提取和實(shí)時(shí)PCR平臺(tái)的兼容性的更多信息, 請(qǐng)?jiān)L問(wèn)我們的EasyScreen™ 工作流程頁(yè)面。
監(jiān)管
[1]來(lái)源:澳大利亞政府衛(wèi)生與老齡部,“澳大利亞食源性疾病的年成本”,2006年3月
[2] Baleriola C,Millar D,Melki J,Coulston N,Altman P,Rismanto N和Rawlinson W.2008。新型HPV測(cè)試與Hybrid Capture II(hcII)和參考PCR方法的比較顯示高特異性和陽(yáng)性對(duì)13例高危人乳頭瘤病毒感染的預(yù)測(cè)價(jià)值。J. Clin。病毒學(xué)雜志。42:22-6 2008
[3] Cunningham SA,Sloan LM,Nyre LM,Vetter EA,Mandrekar J和Pa R. 2010.三小時(shí)分子檢測(cè)糞便中彎曲桿菌,沙門氏菌,耶爾森氏菌和志賀菌的準(zhǔn)確性與培養(yǎng)物一樣高。J. Clin。微。48:2929-33
英文信息如下:
Product | EasyScreen™ Kit | Microorganisms Detected |
---|---|---|
EB001 & EB001-HT | Enteric Bacteria Detection | (i) Salmonella spp. (ii) Campylobacter spp. (iii) Shigella spp. /Enteroinvasive E.coli (EIEC) (iv) Yersinia enterocolitica. (v) toxigenic C. difficile and (vi) Listeria monocytogenes |
EP001 & EP001-HT | Enteric Protozoan Detection | (i) Cryptosporidium spp. (ii) Giardia intestinalis (iii) Dientamoeba fragilis (iv) Entamoeba histolytica and (v) Blastocystis hominis |
EV002 & EV002-HT | Enteric Viral Detection | (i) Norovirus GI (ii) Norovirus GII (iii) Astrovirus (iv) Rotavirus A (v) Sapovirus (vi) Enterovirus (vii) Bocavirus (viii) Adenovirus and (ix) Adenovirus (40 + 41 only) |
CDD001 | C. difficile Detection | Toxigenic C. difficile (targets both tcdA and tcdB) |
CDD002 | C. difficile Reflex | Hypervirulent C. difficile incl. ribotype 027 & 078 targeting: (i) tcdC gene deletion at position 117, (ii) binary toxin gene (cdtA) and (iii) gyrA gene mutation (fluoroquinolone resistance) |
對(duì)于HT(384孔格式)試劑盒,所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs
所有 EasyScreen™ 病原體檢測(cè)試劑盒都可用于使用EasyScreen™ 樣品處理試劑盒準(zhǔn)備的 樣品。
有關(guān)EasyScreen™ 工作流程以及與核酸提取和實(shí)時(shí)PCR平臺(tái)的兼容性的更多信息, 請(qǐng)?jiān)L問(wèn)我們的 EasyScreen™ 工作流程頁(yè)面。
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