中國(guó)科學(xué)家發(fā)表新成果,揭示新冠病毒與SARS病毒有何不同
中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院、中國(guó)疾病預(yù)防控制中心等機(jī)構(gòu)的研究人員近日對(duì)新發(fā)現(xiàn)的冠狀病毒(2019-nCoV)基因組進(jìn)行了深入注釋?zhuān)l(fā)現(xiàn)新型冠狀病毒與SARS或類(lèi)SARS冠狀病毒存在一些差異。
在這項(xiàng)發(fā)表于《Cell Host & Microbe》雜志上的新研究中,研究人員對(duì)新型冠狀病毒與SARS病毒和類(lèi)SARS病毒進(jìn)行了系統(tǒng)比較,鑒定出這些冠狀病毒之間的380個(gè)氨基酸替換,而這些替換可能引起了新型冠狀病毒的功能性和致病性差異。
冠狀病毒在遺傳上分為四個(gè)屬:α冠狀病毒,β冠狀病毒,γ冠狀病毒和δ冠狀病毒。之前已鑒定出六種人類(lèi)冠狀病毒,包括HCoV-NL63和HCoV-229E,它們屬于α冠狀病毒屬;以及HCoV-OC43、HCoV-HKU1、SARS-CoV和MERS-CoV,它們均屬于β冠狀病毒屬。
研究人員指出,冠狀病毒的基因組大約在26,000至32,000個(gè)堿基的范圍內(nèi),包括6-11個(gè)開(kāi)放閱讀框(ORF)。ORF約占整個(gè)基因組的67%,編碼16個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白,而其余的ORF則編碼輔助蛋白和結(jié)構(gòu)蛋白。四個(gè)主要的結(jié)構(gòu)蛋白是刺突糖蛋白(S)、小包膜蛋白(E)、基質(zhì)蛋白(M)和核衣殼蛋白(N)。其中,刺突蛋白在病毒與宿主細(xì)胞的結(jié)合中起著至關(guān)重要的作用,并決定了宿主的向性。SARS-CoV和MERS-CoV的刺突蛋白通過(guò)不同的受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域與不同的宿主受體結(jié)合。
在這項(xiàng)研究中,研究人員對(duì)三個(gè)測(cè)定的新型冠狀病毒基因組(HB01、HB04和HB05)進(jìn)行了深入的基因組注釋?zhuān)⑺鼈兣c相關(guān)的冠狀病毒進(jìn)行了比較,包括1,008株人SRAS冠狀病毒、338株蝙蝠類(lèi)SARS冠狀病毒和3,131株人MERS冠狀病毒。
在氨基酸水平上,研究人員發(fā)現(xiàn)新型冠狀病毒與SARS病毒非常相似,但也有一些顯著差異。例如,8a蛋白在SARS病毒中存在,但在新型冠狀病毒中卻不存在。8b蛋白在SARS病毒中有84個(gè)氨基酸,但在新型冠狀病毒中有121個(gè)氨基酸。“目前還需要進(jìn)一步的研究來(lái)鑒定這些差異如何影響新型冠狀病毒的功能性和致病性,”作者寫(xiě)道。
根據(jù)各種病毒全基因組的系統(tǒng)發(fā)育分析,研究人員發(fā)現(xiàn)新型冠狀病毒與MERS、SARS和類(lèi)SARS冠狀病毒處于同一冠狀病毒進(jìn)化枝上,但新型冠狀病毒與蝙蝠類(lèi)SARS冠狀病毒的相似度,而與MERS冠狀病毒的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。這些結(jié)果與之前發(fā)表的研究結(jié)論相似。
然而,盡管對(duì)全基因組和單個(gè)基因的系統(tǒng)發(fā)育分析明確表明新型冠狀病毒與蝙蝠類(lèi)SARS冠狀病毒的親緣關(guān)系近,但研究人員表示,他們還沒(méi)有找到蝙蝠病毒的單個(gè)毒株,其中所有蛋白質(zhì)都與新型冠狀病毒的對(duì)應(yīng)物高度相似。
“考慮到新型冠狀病毒與SARS病毒和類(lèi)SARS蝙蝠病毒之間的親緣關(guān)系,分析不同蛋白質(zhì)的氨基酸替換有望揭示新型冠狀病毒在結(jié)構(gòu)和功能上與SARS病毒有何不同,
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