DO MORE with LESS | 用聲波玩轉(zhuǎn)單細(xì)胞測(cè)序

單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)起始核酸材料極少，步驟比普通NGS繁雜，實(shí)驗(yàn)周期更長(zhǎng)，難度和風(fēng)險(xiǎn)也更大。重現(xiàn)性和成功率是一大考驗(yàn)。單細(xì)胞測(cè)序方法眾多，除了商品化試劑盒，許多研究人員也會(huì)針對(duì)自己關(guān)注的特征開發(fā)全新的技術(shù)。另一方面，開展腫瘤異質(zhì)性等針對(duì)細(xì)胞群體的研究越來(lái)越普遍，這需要對(duì)大批量細(xì)胞進(jìn)行逐一的測(cè)序和解析。如果按照試劑盒常量/rxn，手工完成每一個(gè)細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)，勞力和成本都難以承受。

Echo硬核的聲波移液技術(shù)技術(shù)，通過(guò)能量控制準(zhǔn)確的納升級(jí)液體轉(zhuǎn)移，噴射液滴單位可以低至2.5 nL。其非物理接觸、準(zhǔn)確小量移液、高速度的特征，決定了Echo非常適合解決單細(xì)胞測(cè)序中遇到的超高通量、技術(shù)靈活多變、反應(yīng)scale-down成本控制、交叉污染等問題。

非物理接觸

     ·  樣本完整性

     ·  無(wú)吸頭消耗

     ·  降低交叉污染風(fēng)險(xiǎn)

移液的靈活性

     ·  2.5 /25 nL 每滴

     ·  200-500 滴/秒

     ·  任意孔至任意孔移液

移液條件溫和

     ·  DNA/RNA/蛋白等生物大分子

以結(jié)合SMART-Seq cDNA文庫(kù)制備及Nextera XT 測(cè)序文庫(kù)制備的單細(xì)胞RNA-seq實(shí)驗(yàn)為例。SMART-Seq反應(yīng)體系（50 uL）可以由Echo縮小4，5，8，10，16，20至32倍，Nextera XT 試劑盒可縮小10倍（50 uL至5 ul）使用。值得注意的是，SMART-seq cDNA文庫(kù)制備中，常量反應(yīng)總體積為50 ul, 縮小32倍后反應(yīng)總體積僅僅只有1.75 uL，還不及一個(gè)常量反應(yīng)中逆轉(zhuǎn)錄酶使用量大。借助Echo，一個(gè)96 rxn的試劑盒將具備完成3072 rxn的可能。

Echo可以完成

● 微量化的單細(xì)胞基因組放大3

● 微量化的單細(xì)胞測(cè)序文庫(kù)制備

● 微量化的文庫(kù)濃度質(zhì)控

● 一步法文庫(kù)Normalization&Pooling

● Better together—— Echo plus Biomek自動(dòng)化單細(xì)胞測(cè)序方案

基于Echo的單細(xì)胞文庫(kù)制備不受待測(cè)細(xì)胞數(shù)目的限制，支持各種試

Better together—— Echo plus Biomek自動(dòng)化單細(xì)胞測(cè)序方案

基于Echo的單細(xì)胞文庫(kù)制備不受待測(cè)細(xì)胞數(shù)目的限制，支持各種試劑盒的靈活組合和NGS建庫(kù)方法學(xué)DIY。做你想做的，測(cè)你想測(cè)的，提供scale-down的微量化反應(yīng)體系和scale-up的自由度。

將Echo聲波移液工作站與Biomek i-系列自動(dòng)化工作站結(jié)合，可實(shí)現(xiàn)更高自動(dòng)化程度的單細(xì)胞測(cè)序?qū)嶒?yàn)。Echo完成文庫(kù)制備中涉及的微量化反應(yīng)體系構(gòu)建， 由Biomek自動(dòng)化工作站配合實(shí)現(xiàn)文庫(kù) Agencourt SPRIselect磁珠PCR clean-up和片段篩選。實(shí)驗(yàn)流中產(chǎn)生的數(shù)據(jù)均可查可溯，保證文庫(kù)信息安全可靠。

參考：

        1. US Patent 6938987

        2. US Patent 6938995