本產(chǎn)品是以探針法熒光定量 PCR 技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)的專門檢測 Cry1A(b)基因的試劑盒,它具有下列特點(diǎn): 1. 即開即用,用戶只需要提供樣品 DNA 模板。 2. 根據(jù) Cry1A(b)基因保守區(qū)域設(shè)計(jì)引物和探針,能專一性地檢測出樣品中的 Cry1A(b)基因。 3. 提供陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品。 4. 一管式閉管操作,降低了交叉污染。 5. 本產(chǎn)品只能用于科研,足夠 50 次 20μL 體系的熒光定量 PCR。
成分 編號 十孔盒包裝 2×Probe qPCR Magic Mix 190303 500 μL(本色蓋) 熒光 PCR 專用模板稀釋液 180701 1 mL(黃蓋) Cry1A(b)基因探針法 qPCR 引物混 合液 15-74110yw 100 μL(白蓋) Cry1A(b)基因 qPCR 探針 15-74110pb 50 μL(棕色管) Cry1A(b)基因探針法 qPCR 陽性對 照 (1×10E8 拷貝/μL) 60908-74110p c 50 μL(黃蓋) 使用手冊 15-74110sc 1 份
一、稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品(以 10E2-10E7 拷貝/μL 這 6 個(gè) 10 倍稀釋度為例)。 由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,千萬不能 污染樣品或本試劑盒的其他成分) 1. 標(biāo)記 6 個(gè)離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。 2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭, 下同)。 3. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震 蕩 1 分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。 4. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所 得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。 5. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所 得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。 6. 重復(fù)上面的操作直到得到 6 個(gè)稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。
二、樣品 DNA 的制備 7. 如果有 N 個(gè)樣品,最好設(shè)置 N+2 個(gè)提取,多出的一個(gè)是 PC(樣品制備陽性 對照),一個(gè)是 NC(樣品制備陰性對照)??梢杂?10μL 陽性對照的 10000 倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為 PC。另外用水作為 NC。 8. 用自選方法純化樣品的 DNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù) DNA 提取試劑盒兼 容。 三、Probe qPCR 反應(yīng)(20μL 體系,在樣品制備室進(jìn)行) 9. 如果做定量分析并且只做 1 次重復(fù),則標(biāo)記 N+9 個(gè) PCR 管,其中 N+2 個(gè) 用于上步得到的 N+2 個(gè)樣品,1 個(gè)用于 PCR 陰性對照(用水做模板),6 個(gè)用于標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果做定性分析,并且只做 1 次重復(fù),則標(biāo)記 N+4 個(gè) PCR 管,其中 N+2 個(gè)用于上步得到的 N+2 個(gè)樣品,1 個(gè)用于 PCR 陰性對照(用 水做模板),1 個(gè)用于 PCR 陽性對照(用第 4 號管的陽性對照稀釋液做模 板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。 10. 在標(biāo)記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對照設(shè) 置完畢后才設(shè)置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好 后最后加):
成分 樣品管 N+2 個(gè) PCR 陰 性對照管 標(biāo)準(zhǔn)曲線 樣品管(2-7 管) 2×Probe qPCR MagicMix 10 μL 10 μL 各 10 μL Cry1A(b)基因 qPCR 探針 1 μL 1 μL 各 1 μL Cry1A(b)基因探針法 qPCR 引物 混合液 2 μL 2 μL 各 2 μL N+2 個(gè)待測 DNA 模板 7 μL - - 超純水 - 7 μL - 第 7 步所得標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品稀釋液 (2-7 號) - - 各 7 μL(2 號樣到 2 號管,3 號樣到 3 號管…)
如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct 值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品 RNA 濃度的 log 值,再推算出其濃度。 13. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大 于或等于 35。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴(kuò)增曲線,Ct 值應(yīng)該 小于或等于 30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 35 則為陰性,如果小 于或等于 30 則為陽性。如果在 30-35 之間,則重復(fù)一次。若重復(fù)結(jié)果 Ct 值 小于 35,擴(kuò)增曲線有明顯起峰,該樣本判斷為陽性,否則為陰性。
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