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利用離子阱作為分析器的質譜儀稱為離子阱質譜儀。目前使用最多的是由高頻率電場進行離子封閉的保羅阱(Paul trap)。由一個雙曲面截面的環(huán)形電極和上下一對端電極構成。封閉在真空池內(nèi)的離子，通過高頻電壓掃描，將離子按m/z從池中引出進行檢測。離子阱質譜儀是一種低分辨時間串聯(lián)質譜儀。可以進行msn的測定(通常n=2-6)。而且價格比其它類型的串聯(lián)質譜儀便宜。目前在有機物定性方面得到了很廣泛的應用。
離子阱質譜儀種類有多種。
1、按分析目的可分：化驗室離子阱質譜儀和工業(yè)離子阱質譜儀。
2、按分辨率可分：低分辨離子阱質譜儀、中分辨離子阱質譜儀和高分辨離子阱質譜儀。
3、按聯(lián)用方式可分：離子阱氣質聯(lián)用儀、離子阱液質聯(lián)用儀和等離子體離子阱質譜儀等。
4、按分析對象的屬性可分：離子阱有機質譜儀、離子阱無機質譜儀和離子阱同位素質譜儀等。
5、按用途可分：離子阱生物質譜儀、離子阱制藥質譜儀、離子阱化工質譜儀、離子阱食品質譜儀、離子阱醫(yī)用質譜儀、離子阱菌體質譜儀、離子阱維生素質譜儀、離子阱啤酒質譜儀、離子阱淀粉質譜儀、離子阱發(fā)酵液質譜儀、離子阱礦物油質譜儀、離子阱原油質譜儀、離子阱試驗質譜儀和離子阱專用質譜儀等。
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