AAV
DLS+SEC+DSC多種技術(shù)結(jié)合
助力AAV基因遞送載體的表征
部分疫苗通過引入mRNA來觸發(fā)對SARS-CoV-2冠狀病毒刺突蛋白的免疫反應(yīng)。遞送mRNA的載體之一有腺相關(guān)病毒(AAVs)。有很多生物物理的技術(shù)可以為候選疫苗的研究和開發(fā)提供新的見解。比如光散射技術(shù)可用于測量病毒衣殼的濃度,比ELISA方法更迅速;色譜技術(shù)可用于測量空殼率;完整衣殼可在微量熱技術(shù)中顯示出不同的特征。
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DLS 動態(tài)光散射技術(shù)
DLS可用于樣品關(guān)鍵生物物理參數(shù)的測量,或用于篩分優(yōu)質(zhì)、穩(wěn)定的的樣品和那些受污染、有聚體的樣品。通過Zetasizer Ultra納米分析儀的多角度動態(tài)光散射技術(shù)(MADLS),不僅可以在幾分鐘內(nèi)測量樣品的流體動力學(xué)直徑和粒徑分布(包括聚集體),還可以測量每個群體的顆粒濃度。此外,儀器新的自適應(yīng)相關(guān)算法提高了測量精度、重現(xiàn)性,以及對異物或大的聚集體的包容度。
圖1. Zetasizer Ultra納米粒度儀和DLS測量粒徑分布的案例
使用MADLS技術(shù)
進(jìn)行AAV載體大小和濃度測量
本文用Zetasizer Ultra分析了3個AAV樣品。濃度結(jié)果與基于衣殼ELISA的病毒滴度測定的結(jié)果進(jìn)行對比。
采用多角度動態(tài)光散射(MADLS)技術(shù)測量3個AAV樣品的顆粒大小分布,重復(fù)測量3次,結(jié)果如下。顯示有少量樣品團(tuán)聚。標(biāo)準(zhǔn)品(A)發(fā)生的團(tuán)聚比AAV樣品(B和C)更多一些。同時分別測得了AAV單體和團(tuán)聚體的顆粒濃度,結(jié)果見圖D-F。表1中對比了MADLS方法和衣殼ELISA法測得的濃度結(jié)果。AAV樣品的RSD<15%,ATCC AAV2參考標(biāo)準(zhǔn)品的RSD 45%。
圖2. 顆粒大小分布的3次重復(fù)測量結(jié)果:圖A-ATCC AAV2標(biāo)品,圖B-AAV樣品1,圖C-AAV樣品2。圖D-F的顆粒濃度結(jié)果一一對應(yīng)圖A-C中的樣品。
采用AAV衣殼ELISA方法進(jìn)行測量
酶聯(lián)免疫吸附試驗 (ELISA) 是病毒滴度或衣殼濃度的標(biāo)準(zhǔn)測量方法。我們將MADLS濃度數(shù)據(jù)與已有的衣殼ELISA方法測量的數(shù)據(jù)進(jìn)行比較。單分散rAAV樣品(RSD 13-15%)與ELISA方法測量的rAAV衣殼滴度幾乎沒有差異。
這些結(jié)果表明了完整 rAAV 衣殼的無標(biāo)記分析方法與其他常見滴度測定方法是互補的。發(fā)生團(tuán)聚的多分散rAAV樣品的RSD高達(dá)45%。我們認(rèn)為這是因為多分散樣品的尺寸精度較低。
表1. 衣殼ELISA測得的濃度數(shù)據(jù)和MADLS測定的顆粒濃度數(shù)據(jù),3個樣品分別是ATCC AAV2參考標(biāo)準(zhǔn)品,樣品1,樣品2。濃度數(shù)據(jù)單位是顆粒數(shù)量/ml。n表示3次重復(fù)測量中觀察到該峰的次數(shù)。n/a表示未觀察到該峰。
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SEC尺寸排阻色譜技術(shù)
多檢測器尺寸排阻色譜(SEC)可用于多種rAAV屬性的測量,如衣殼滴度、絕對分子量、聚集體、寡聚體、片段分布和空殼率。
市售rAAV5樣品(Virovek,US)含有空衣殼和完整衣殼的混合物。完整衣殼rAAV樣品Mw是4.49x106 g/mol,蛋白質(zhì)含量86%,ssDNA Mw 6.13x105 g/mol,完整衣殼AAV占比78.1%,總滴度7.48x1013(單體和聚集體)。空rAAVs Mw小一些,3.84x106 g/mol,總滴度5.91x1013(單體和聚集體)。當(dāng)空衣殼和完整衣殼以已知比例添加時,測得的空殼率與預(yù)測結(jié)果高度相關(guān),R2高達(dá)0.99。
圖3. OMNISEC系統(tǒng)和示例色譜譜。示例中樣品為空rAAV單體、二聚體、高聚體和片段的混合物。針對單體峰進(jìn)行空殼率分析。
圖4. OMNISEC空殼率分析結(jié)果。預(yù)估值(表格第三列)來自添加的空衣殼和完整衣殼比率,調(diào)整到100%?;贛w得到完整衣殼占比 78.1%。計算值(表格第四列)基于單體峰的Mw值得到。
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DSC 差示掃描量熱技術(shù)
差示掃描量熱儀(DSC)可用于測量蛋白質(zhì)、核酸和病毒衣殼的熱變性和熱穩(wěn)定性。該技術(shù)測量溶液中分子熱誘導(dǎo)的結(jié)構(gòu)變化的焓變(ΔH)和結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)變溫度(Tm)。該測量方式直接、溶液相和非標(biāo)記,不需要額外的熒光標(biāo)記或抗體捕獲。
空衣殼和完整衣殼rAAV5樣品(Virovek, US)的PEAQ-DSC結(jié)果顯示有多個轉(zhuǎn)變溫度(Tm),與衣殼分解(Tm1)和ssDNA熔融(Tm2)有關(guān)。此外,完整rAAVs在50度時顯示出弱的熱特征,而空殼rAAVs沒有,這表示熱誘導(dǎo)事件的發(fā)生可能與衣殼脫殼相關(guān)的完整rAAVs里的結(jié)構(gòu)重組有關(guān)。
圖5. MicroCal PEAQ-DSC自動系統(tǒng)和完整rAAV的DSC熱圖譜示例。圖譜顯示了明顯的熱轉(zhuǎn)變溫度(Tm)分別是89°和94°。紅星號標(biāo)注出早期的熱轉(zhuǎn)變發(fā)生在50°。
總結(jié)
1, 衣殼ELISA方法和MADLS方法測得的顆粒濃度結(jié)果的RSD≤15%。有團(tuán)聚顆粒時RSD為45%。
2, 多檢測器SEC色譜儀可用于測量空衣殼和完整rAAVs的純度、寡聚分布和空殼率。
3, 使用DSC表征衣殼分解和ssDNA熔融時空衣殼和完整rAAVs的不同熱轉(zhuǎn)變和熱穩(wěn)定性行為。
Zetasizer Ultra
Zetasizer Ultra 納米粒度及電位分析儀
Zetasizer Ultra 是快速而準(zhǔn)確地測量顆粒和分子大小、顆粒電荷以及顆粒濃度的伴侶,其擁有用于高分辨率粒度測量切角度無關(guān)的多角度動態(tài)光散射(MADLS)技術(shù)可以更深入地展現(xiàn)樣品的顆粒分布,電泳光散射(ELS)技術(shù)可用于測量顆粒和分子的Zeta電位,以顯示樣品的穩(wěn)定性和/或團(tuán)聚傾向性??梢杂糜趓AAV 顆粒的粒徑及衣殼滴度的表征。
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OMNISEC
OMNISEC 尺寸排阻色譜儀
OMNISEC是個多檢測器SEC系統(tǒng),包括示差檢測器(RI)、紫外檢測器(UV)、光散射檢測器(LS)和粘度檢測器(IV)??梢杂糜诒碚骱脱芯扛街谥|(zhì)納米顆粒顆粒遞送載體上的藥物量以及產(chǎn)品的分子量和結(jié)構(gòu)。
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MicroCal PEAQ DSC
MicroCal PEAQ DSC差示掃描量熱儀
差示掃描量熱法(DSC)是一種功能強(qiáng)大的分析技術(shù),用于表征和分析蛋白質(zhì)和其他生物分子的熱穩(wěn)定性。
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