NEPA21—Cas9核糖核酸蛋白在工業(yè)微藻中實現(xiàn)高效無轉(zhuǎn)基因靶向誘變
Highly efficient transgene-free targeted mutagenesis and single-stranded oligodeoxynucleotide-mediated precise knock-in in the industrial microalga Euglena gracilis using Cas9 ribonucleoproteins
利用Cas9核糖核酸蛋白在工業(yè)微藻中實現(xiàn)高效無轉(zhuǎn)基因靶向誘變和單鏈寡脫氧核苷酸介導(dǎo)的精確敲入
2019 年 5 月 26 日,在Plant Biotechnology Journal 雜志發(fā)表了一篇論文" Highly efficient transgene-free targeted mutagenesis and single-stranded oligodeoxynucleotide-mediated precise knock-in in the industrial microalga Euglena gracilis using Cas9 ribonucleoproteins ",文章中將CRISPR/ Cas9系統(tǒng)的基因編輯技術(shù)應(yīng)用于纖細(xì)裸藻中,為闡明其他微藻類的基因功能提供了一個突破。
纖細(xì)裸藻是一種單細(xì)胞光合鞭毛蟲,也是一種工業(yè)開發(fā)的微藻,它富含營養(yǎng)元素,積累大量的裸藻淀粉,具有多種生物活性功能。因此,大量培養(yǎng)的纖細(xì)裸藻是功能性食品、飼料和化妝品的商業(yè)來源。此外,在厭氧條件下,裸藻淀粉可被降解并轉(zhuǎn)化為主要由肉豆蔻酸和肉豆蔻醇組成的蠟酯。由于纖細(xì)裸藻產(chǎn)生的蠟酯很容易轉(zhuǎn)化為具有低冰點的生物燃料,因此它適合作為生物噴氣燃料的來源。
纖細(xì)裸藻(又名小眼蟲,Euglena gracils)
在文章中,研究者為了在纖細(xì)裸藻中建立了一種基于Cas9核糖核酸蛋白(RNPs)的無轉(zhuǎn)基因誘變方法,在纖細(xì)裸藻葡聚糖合成酶2(EgGSL2)基因的第二個外顯子內(nèi)設(shè)計了兩個靶序列,他們推測該基因可能參與了裸藻淀粉的生物合成。使用NEPA GENE電轉(zhuǎn)儀將Cas9核糖核酸蛋白導(dǎo)入到纖細(xì)裸藻細(xì)胞中(圖1b)。實驗結(jié)果表明,這兩種以EgGSL2為靶點的RNPs可以使纖細(xì)裸藻細(xì)胞表現(xiàn)出更少但更大的裸澡淀粉顆粒。靶1和靶2表型改變的平均頻率分別為71.3%和80.6%(圖1d),并且在電穿孔后72h檢測,插入缺失突變率分別為77.7-86.8%和88.8-90.1%(圖1g)。
纖細(xì)裸藻作為一種可再生資源具有很多優(yōu)異特性,但想要建立其有效靶向誘變一直是一個長期的挑戰(zhàn)。在這里,研究者利用CAS9 RNPS開發(fā)了一種高效的無轉(zhuǎn)基因靶向誘變和單鏈寡核苷酸介導(dǎo)的基因敲入,這將為纖細(xì)裸藻是一種可編輯基因組的有機體提供了第一個證據(jù),利用裸藻中所含的副淀粉和脂肪酸合成了生物塑料,為纖細(xì)裸藻開發(fā)應(yīng)用開拓了新方向,同時促進生物材料生產(chǎn)的可持續(xù)性發(fā)展。
文章采用的是NEPA21 電轉(zhuǎn)染儀來進行電轉(zhuǎn),采用全新的四步法電轉(zhuǎn)程序,配合多脈沖、電壓衰減(Voltage Decay)和輔助基因?qū)肽J皆O(shè)計,可在獲得高轉(zhuǎn)染效率的同時,提高細(xì)胞存活率 ,并且不需要特殊轉(zhuǎn)染試劑輔助。
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