揭秘貼|如何5.8天內(nèi)get靶向小分子的單B細(xì)胞來源抗體
在診斷和治療領(lǐng)域,需要能夠耐受復(fù)雜環(huán)境(如高有機(jī)溶劑、高鹽、酸或堿)的抗體。兔源單克隆抗體(RmAbs)因其高親和力和高穩(wěn)定性而備受青睞,但傳統(tǒng)針對(duì)小分子靶點(diǎn)的研發(fā)平臺(tái)效能受限。
氯霉素(CAP)是一種抗菌劑,存在于動(dòng)物源性食品中的CAP會(huì)對(duì)公共健康構(gòu)成巨大威脅。中國農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物源性食品安全檢測(cè)北京重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的王戰(zhàn)輝團(tuán)隊(duì)于2022年發(fā)表在Analyst上的文章[1],利用基于納米孔的間接競(jìng)爭(zhēng)性篩選利器(CSMN)僅20.6小時(shí)就獲得了靶向CAP的兔源單克隆抗體分泌細(xì)胞(ASC)。結(jié)合分子生物學(xué)技術(shù),該團(tuán)隊(duì)在5.8天內(nèi)獲得了一個(gè)靶向CAP的RmAb。該抗體檢測(cè)真實(shí)生物樣品中的CAP時(shí),樣本前處理更簡單,并具有更短的檢測(cè)時(shí)間、更好的重復(fù)性和更高的靈敏度。
實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
與靶點(diǎn)是蛋白的抗原不同,CAP非常小,需要與BSA耦聯(lián)后作為免疫原免疫動(dòng)物,但耦聯(lián)后除了CAP,連接子(linker)和BSA也有對(duì)應(yīng)的抗體產(chǎn)生。為了得到特異性靶向CAP的抗體,利用下圖所示的CSMN平臺(tái)篩選特異性靶向CAP的ASC。
圖1. 展示獲得靶向CAP的RmAb的整個(gè)流程
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預(yù)先用CAP-BSA包被納米孔板表面12h
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加入分離的脾細(xì)胞與PE標(biāo)記的兔二抗混合液,靜置10min使ASCs沉降到納米孔里達(dá)到分離ASCs的目的
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該納米孔板置于37度、5% 二氧化碳環(huán)境中培養(yǎng),ASCs會(huì)分泌抗體,與包被在納米孔表面的CAP-BSA結(jié)合,再與懸液中PE標(biāo)記的二抗結(jié)合產(chǎn)生熒光信號(hào)。4h后如在納米孔內(nèi)檢測(cè)到增強(qiáng)的熒光信號(hào),說明孔內(nèi)有靶向CAP-BSA的ASC
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4h時(shí)向孔內(nèi)加入CAP,會(huì)與納米孔表面CAP-BSA中的CAP競(jìng)爭(zhēng)分泌的抗體,如4-8h熒光信號(hào)顯著下降,則該納米孔內(nèi)的ASC是CAP特異性的ASC,如4h后信號(hào)仍很強(qiáng)則是靶向連接子或BSA的ASC
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最后使用CellCelector全自動(dòng)無損細(xì)胞分離系統(tǒng)結(jié)合直徑為20μm的玻璃毛細(xì)管輕柔地將該ASC挑出,裂解后分離其mRNA先反轉(zhuǎn)錄,利用特定的引物擴(kuò)增RmAb的輕、重鏈可變區(qū),測(cè)序,真核表達(dá)得到靶向CAP的RmAb
從利用納米孔板使ASCs分離為單個(gè)ASC,到連續(xù)成像追蹤抗體的分泌,最后以抗體熒光信號(hào)改變作為篩選條件,把靶向CAP的ASC挑取出來,整個(gè)流程均由CellCelector一臺(tái)設(shè)備在20.6小時(shí)內(nèi)完成,充分體現(xiàn)了CellCelector的全能和高效。
圖2. 三種不同ASCs明場(chǎng)采集的圖片及0-8h RmAbs熒光信號(hào)的圖片及對(duì)應(yīng)熒光強(qiáng)度定量結(jié)果:(圖2A)展示了納米孔中靶向CAP的單個(gè)ASC細(xì)胞明場(chǎng)圖片,在檢測(cè)的0-8h內(nèi)各時(shí)間點(diǎn)孔內(nèi)分泌的RmAbs熒光信號(hào)變化;(圖2D)4h加入的CAP前后因競(jìng)爭(zhēng)使孔內(nèi)熒光信號(hào)降低的模式圖,以及各時(shí)間點(diǎn)熒光信號(hào)強(qiáng)度的統(tǒng)計(jì)圖,先上升后下降(2E);靶向BSA的ASC分泌的RmAbs會(huì)持續(xù)增強(qiáng)(圖2B、F和G),不靶向CAP或BSA的ASC檢測(cè)不到抗體信號(hào)(圖2C、H和I)
納米孔單細(xì)胞分離條件優(yōu)化
CellCelector提供適用于不同目的的納米孔板,每個(gè)納米孔板含有十萬到數(shù)百萬個(gè)納米孔。由于兔脾細(xì)胞直徑約為8-13μm,為確保更高的單細(xì)胞率和挑取率,實(shí)驗(yàn)前測(cè)試了不同納米孔尺寸(20μm到100μm)的四種納米孔板(六邊形的H100、UFO形的U40、UFO形的U25和方形的SIEVEWELL)的單細(xì)胞率,發(fā)現(xiàn)U25的單細(xì)胞率最高(圖2A)。對(duì)于U25納米孔,每孔接種的細(xì)胞數(shù)也需要優(yōu)化,圖2C-E每孔細(xì)胞數(shù)依次為5E3、1E4和2E4,細(xì)胞數(shù)越多,空孔率越低,但每個(gè)納米孔含多個(gè)細(xì)胞的比例增加,1E4密度更合適。
目標(biāo)樣品的挑取
CellCelector提供各種直徑的挑頭,用于挑取不同大小的貼壁或者非貼壁細(xì)胞,也可以快速挑取在半固體中培養(yǎng)的菌落和類器官等樣本。
圖4. 靶向CAP的單個(gè)ASC細(xì)胞挑取前后采集的圖片
在挑取前,根據(jù)納米孔內(nèi)明場(chǎng)圖片確認(rèn)是否為單個(gè)ASC。然后,依據(jù)分泌抗體熒光信號(hào)的變化確定靶向CAP的ASC,進(jìn)而進(jìn)行挑取。挑取后,再次對(duì)該納米孔成像(紅線圈選區(qū)域),CellCelector利用其成像功能為篩選全流程的準(zhǔn)確度保駕護(hù)航。
“屢試不爽”
下圖是張老師團(tuán)隊(duì)同年發(fā)表在《Food and Chemical Toxicology》上的成果[2],同樣利用CSMN平臺(tái)篩選靶向另外一個(gè)與食品安全有關(guān)的小分子——瘦肉精(RAC),圖中A、B、C分別展示了靶向RAC、BSA以及其他靶點(diǎn)的ASC在加入RAC前后各時(shí)間點(diǎn)納米孔內(nèi)分泌的抗體熒光信號(hào)的動(dòng)態(tài)變化,最終篩選得到的RAC特異性RmAb可以在高尿素環(huán)境里檢測(cè)RAC的水平。
一年兩篇文章利用CellCelector 高效篩選到靶向兩個(gè)小分子的RmAb,是因?yàn)镃ellCelector具有以下優(yōu)勢(shì):
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一機(jī)全能,集分離、成像和挑取為一體
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Nanowell納米孔板技術(shù),每個(gè)納米板含有十萬到數(shù)百萬個(gè)納米孔,實(shí)現(xiàn)更高通量的細(xì)胞篩選
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納米孔板表面可根據(jù)檢測(cè)目的進(jìn)行各種修飾,滿足多樣化篩選需求
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支持全板掃描,每次挑取僅需20-30s,實(shí)驗(yàn)操作時(shí)間短,自動(dòng)化程度高
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用于自動(dòng)調(diào)整毛細(xì)管高度的SurePick™ 技術(shù),在挑選過程中對(duì)毛細(xì)管高度進(jìn)行動(dòng)態(tài)調(diào)整,允許從高度不同或半固體體系中進(jìn)行高效的全自動(dòng)挑選
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全流程存檔記錄及質(zhì)量控制,完全自動(dòng)化的質(zhì)量控制過程,包括揀選前后的圖像、揀選/失敗報(bào)告和數(shù)據(jù)/圖像輸出
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挑取對(duì)象廣,適用于貼壁細(xì)胞,懸浮細(xì)胞或半固體培養(yǎng)基中的細(xì)胞、菌落以3D細(xì)胞團(tuán)的挑取
《基于圖像的全自動(dòng)單細(xì)胞及克隆篩選和分離》應(yīng)用手冊(cè),了解如何使用CellCelector Flex 全自動(dòng)無損細(xì)胞分離系統(tǒng)與獨(dú)特的Nanowell 納米孔陣列相結(jié)合,快速有效地評(píng)估和驗(yàn)證您的克隆。
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