前沿 | 安捷倫質(zhì)譜助力七葉樹(shù)藥效成分研究,揭示七葉皂苷和七葉素生物合成進(jìn)化機(jī)制
2023 年 10 月,陳士林團(tuán)隊(duì)在《自然-通訊》(Nature Communications) 發(fā)表“Characterization of the horse chestnut genome reveals the evolution of aescin and aesculin biosynthesis”的文章,作者采用多組學(xué)研究策略和質(zhì)譜技術(shù)揭示了天然藥物七葉皂苷和七葉素特異性合成的分子機(jī)制,并在大腸桿菌中實(shí)現(xiàn)了七葉素的綠色生物合成。
研究背景
現(xiàn)代植物化學(xué)和藥理學(xué)的研究證明,草藥中特異性積累的有效成分是其發(fā)揮藥效的物質(zhì)基礎(chǔ),七葉樹(shù)屬植物是一種溫帶北半球的多年生樹(shù)木,該屬植物由于分別含有藥用活性成分七葉皂苷和七葉素被廣泛應(yīng)用于臨床。七葉皂苷(玉蕊醇型三萜皂苷)制劑已經(jīng)在臨床中以口服、靜脈注射和局部涂抹的方式廣泛使用,用于治療慢性靜脈功能不全、水腫和痔瘡等疾病。七葉素(香豆素類(lèi)成分),也被稱(chēng)為 6,7- 二羥基香豆素 -6-O- 葡萄糖苷,與地高辛一起被廣泛用作常見(jiàn)的眼藥水七葉洋地黃雙苷滴眼液的原料,以緩解眼疲勞、眼痛和干眼等癥狀。然而,目前對(duì)于這兩種有效成分的合成、調(diào)控和轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制的分子遺傳學(xué)研究還相對(duì)薄弱。
研究結(jié)果
此次發(fā)表的研究通過(guò)空間代謝組揭示七葉皂苷在七葉樹(shù)屬植物娑羅子的子葉中特異性積累,解析了中華七葉樹(shù)高質(zhì)量基因組,并通過(guò)代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)以及合成生物學(xué)技術(shù)等方法,成功解析七葉皂苷生物合成途徑中關(guān)鍵的環(huán)化、氧化、?;推咸烟侨┧峄却呋襟E。
同時(shí),課題組通過(guò)全被子植物基因組層面共線(xiàn)性研究發(fā)現(xiàn)該類(lèi)三萜代謝基因簇的招募和進(jìn)化模式,更好地理解了玉蕊醇型三萜類(lèi)化合物在無(wú)患子目植物中的形成機(jī)制。針對(duì)七葉素的合成途徑,研究團(tuán)隊(duì)根據(jù)關(guān)鍵基因在基因組中存在的拷貝數(shù)目及表達(dá)模式,篩選和驗(yàn)證了合成過(guò)程中關(guān)鍵基因的功能,在大腸桿菌中重建了七葉素的生物合成途徑并完成了七葉素的綠色合成。
研究結(jié)論
本文以具有重要藥用價(jià)值的七葉樹(shù)為研究對(duì)象,綜合運(yùn)用基因組、轉(zhuǎn)錄組、代謝組、空間代謝組以及合成生物學(xué)等多種技術(shù)手段,揭示了七葉樹(shù)中高價(jià)值代謝物七葉皂苷和七葉素的生物合成及進(jìn)化過(guò)程。其意義在于,一方面為推動(dòng)這些活性化合物的生物合成研究進(jìn)展以促進(jìn)其生產(chǎn)應(yīng)用提供了良好的基礎(chǔ),另一方面為其他藥用樹(shù)木代謝物相關(guān)研究提供了良好的研究范式。
專(zhuān)家團(tuán)隊(duì)
此次發(fā)表的論文的共同第一作者為中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所孫偉、尹青崗、萬(wàn)會(huì)花、高冉冉,共同通訊作者是中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院/成都中醫(yī)藥大學(xué)陳士林、北京化工大學(xué)孫新曉、東北林業(yè)大學(xué)徐志超。本草基因組學(xué)團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人陳士林院士 2022 年組織發(fā)布了千種本草基因組研究計(jì)劃,在《創(chuàng)新》(The Innovation)、《自然-植物》(Nature Plants)、《分子植物》(Molecular Plant)、《自然-通訊》(Nature Communications) 等國(guó)際著名刊物發(fā)表了一系列的草藥基因組學(xué)研究成果,極大地推動(dòng)了學(xué)術(shù)界從分子遺傳學(xué)層面理解中草藥中有效成分的合成、轉(zhuǎn)運(yùn)、積累和調(diào)控,助力天然產(chǎn)物藥物的綠色生物合成以及高含量藥效成分品種的精準(zhǔn)選育。
參考文獻(xiàn):
[1] Sun W, Yin Q, Wan H, et al. Characterization of the horse chestnut genome reveals the evolution of aescin and aesculin biosynthesis[J]. Nature communications, 2023, 14(1): 6470.
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