1.Marker相關(guān)問題
1.1Marker 不直,偏斜或拖尾
原因:
1.膠配制的問題,制作不均勻或有污染或瓊脂糖質(zhì)量不好;
2.電泳緩沖液過于老舊,考慮更換;
3.電壓太高,凝膠受熱導致不均勻;
4.電泳槽的電極歪斜;
1.2Maker 跑不開
原因:
1.膠濃度太大;
2.電泳時間太短;
2.PCR產(chǎn)物相關(guān)問題
2.1沒條帶
原因:
沒跑出來
2.2條帶微弱
原因:
1.DNA降解
2.上樣量過少
3.沒跑出來,產(chǎn)物濃度過低,需再次PCR
2.3非特異性擴增
原因:
1.引物設計不合理。需重新設計引物,balst檢測引物特異性;
2.試劑被污染。包括水,酶,引物等。重新更換;
3.退火溫度太高。提高退火溫度,增加退火時間,減少循環(huán)數(shù);
4.酶加入過多;
2.4 PCR產(chǎn)物彌散,拖尾或偏斜,Maker正常
原因:
1. 引物保存不當,降解。重新配制引物工作液。
2.模板降解或過量。重新檢查模板質(zhì)量,減少模板用量。
3.非特異性擴增。提高退火溫度,增加退火時間,減少循環(huán)數(shù)。
4.酶量過多或酶的質(zhì)量差。
5. 有蛋白和鹽的污染。
2.5 PCR產(chǎn)物和Maker 都彌散或拖尾
原因:
1.膠配制的問題,制作不均勻或有污染或瓊脂糖質(zhì)量不好;
2.電泳緩沖液過于老舊,考慮更換。
3.電壓太高,凝膠受熱導致不均勻。
2.6 PCR產(chǎn)物與目的大小不符合
原因:
1.引物特異性不好。需重新設計引物,balst檢測引物特異性。
2.存在新的異構(gòu)體。
3.是目的基因,但大小有差異(我遇到過)。膠回收過后再次電泳條帶變?yōu)檎4笮 S龅竭@個情況可以測序看看結(jié)果。
2.7 電泳孔亮
原因:有蛋白或者多糖的污染,這些大分子物質(zhì)影響了DNA或RNA的出孔,使其停留在孔中或者出孔很慢。導致孔以及接近孔的位置很亮。
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