1、什么是內(nèi)參?
內(nèi)參是Western Blot實驗中用于標(biāo)準(zhǔn)化和校正實驗誤差的一類蛋白質(zhì)。它們通常是在不同組織和細(xì)胞中表達(dá)相對恒定的蛋白質(zhì),由管家基因編碼,常用作檢測目的蛋白表達(dá)水平變化時的參照物。
2、內(nèi)參在WB中的作用是什么?
校正實驗誤差:內(nèi)參用于校正蛋白質(zhì)定量和上樣過程中的實驗誤差,以保證實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性。由于不同的樣品在蛋白質(zhì)提取、定量、上樣等步驟中可能存在操作誤差,使用內(nèi)參可以對這些誤差進(jìn)行校正。
半定量分析:通過比較內(nèi)參和目標(biāo)蛋白的信號強度,可以對實驗結(jié)果進(jìn)行半定量分析。如果樣品蛋白量有限,只夠進(jìn)行一次電泳轉(zhuǎn)膜實驗時,分別檢測樣品的內(nèi)參量和目的蛋白量,然后將各樣品目的蛋白量分別除以其內(nèi)參含量,得到內(nèi)參校正后的各樣品中目的蛋白相對含量,用此數(shù)值進(jìn)行樣品間的比較和分析。
作為空白對照:內(nèi)參可以作為空白對照,檢測蛋白轉(zhuǎn)膜情況是否wan全,以及整個Western Blot顯色或者發(fā)光體系是否正常。
確保實驗結(jié)果的可比性:在比較不同條件下或不同組織中目的蛋白表達(dá)量的相對多少時,內(nèi)參提供了一個參照標(biāo)準(zhǔn),確保了實驗結(jié)果的可比性。
3、常見的WB內(nèi)參有哪些?
β-Actin:β-肌動蛋白是一種細(xì)胞骨架蛋白,分子量42KDa左右,廣泛分布于各種組織中,表達(dá)量豐富且相對恒定。它通常用作總蛋白的內(nèi)參,尤其是在非肌肉組織中。然而,需要注意的是,β-Actin在某些特定組織(如心肌)中的表達(dá)量可能較低,因此并非在所有情況下都適用。此外,不同的β-Actin亞型在不同組織中的分布也有所不同,選擇抗體時需考慮這一點。
大鼠腦裂解物20μg
人結(jié)腸癌組織
Hela細(xì)胞
abs171598 Rabbit anti-β-Actin Monoclonal Antibody
GAPDH(甘油醛-3-磷酸脫氫酶):36kD左右,GAPDH是一種廣泛表達(dá)的蛋白,適用于多種細(xì)胞類型。然而,在某些條件下,如缺氧或糖尿病,GAPDH的表達(dá)可能會受到影響,因此需要根據(jù)實驗條件謹(jǐn)慎選擇。
1: HeLa whole cell lysate 20ug Lane
2: THP-1 whole cell lysate 20ug Lane
3: MCF7 whole cell lysate 20ug Lane
4: NIH/3T3 whole cell lysate 20ug Lane
5: mouse spleen lysate 20ug Lane
6: C6 whole cell lysate 20ug Lane
7: rat spleen lysate 20ug
abs132004 Rabbit anti-GAPDH Polyclonal Antibody
β-Tubulin:55kDa左右,β-Tubulin是微管蛋白的一種,參與構(gòu)成細(xì)胞骨架。由于其在細(xì)胞中的穩(wěn)定表達(dá),尤其用于檢測細(xì)胞骨架蛋白時。β-Tubulin的表達(dá)在多種細(xì)胞類型中相對恒定,但同樣需要考慮特定條件下的表達(dá)變化,如在凋亡細(xì)胞中。
Hela細(xì)胞全裂解物
大鼠腎組織
NIH3T3細(xì)胞
abs171597 Rabbit anti-β-Tubulin Monoclonal Antibody
除了以上介紹的內(nèi)參以外,還有α-Tubulin、Hsp90等等,每個內(nèi)參的分子量及適用情況不一樣,建議選擇之前做好功課。
4、如何挑選合適的內(nèi)參,需要考慮哪些因素?
目的蛋白分子量:內(nèi)參蛋白的分子量應(yīng)與目標(biāo)蛋白的分子量相差至少5kDa以上,以確保在凝膠電泳和Western Blot中能夠清晰地區(qū)分目標(biāo)蛋白和內(nèi)參的條帶。
樣本種屬來源:不同種屬的樣本可能需要選擇不同的內(nèi)參蛋白。例如,哺乳動物的組織或細(xì)胞樣本常選擇β-actin、β-tubulin、GAPDH等,而植物樣本可能選擇plant actin、Rubisco等作為內(nèi)參。
細(xì)胞定位:根據(jù)目標(biāo)蛋白的亞細(xì)胞定位選擇相應(yīng)的內(nèi)參。例如,如果是檢測全細(xì)胞或細(xì)胞質(zhì)蛋白,可以選擇β-actin、β-tubulin、GAPDH等;如果是核蛋白,則可能選擇Lamin B、Histone H3等作為內(nèi)參。
實驗環(huán)境:內(nèi)參的選擇還需要考慮實際的實驗環(huán)境和樣品的前處理。在某些特殊條件下,一些內(nèi)參蛋白的表達(dá)可能會發(fā)生變化,從而影響其作為內(nèi)參的穩(wěn)定性和可靠性。例如,在缺氧或糖尿病等條件下,GAPDH的表達(dá)可能會增加,因此可能不適合作為內(nèi)參。
組織特異性:不同的組織可能需要選擇不同的內(nèi)參。例如,肌肉組織中可能需要選擇特定的肌動蛋白亞型作為內(nèi)參,而在非肌肉組織中則可能選擇β-actin等。
5、內(nèi)參抗體和目標(biāo)抗體如何孵育?
順序孵育:在檢測完目標(biāo)蛋白后,使用strip緩沖液洗掉膜上的抗體,然后重新進(jìn)行內(nèi)參蛋白的抗體溫育和顯色檢測。這種方法需要在兩次孵育過程中使用同一張膜。
雙膜法:在蛋白轉(zhuǎn)膜后,根據(jù)預(yù)染的蛋白質(zhì)Marker的大小將膜剪成大分子量和小分子量兩部分,使內(nèi)參蛋白與目的蛋白分開。然后兩塊膜分別與內(nèi)參蛋白抗體以及目的蛋白抗體進(jìn)行孵育和顯色。
同時孵育(如果分子量相差較大):如果目的蛋白的分子量與內(nèi)參蛋白的分子量相差較大,可以在轉(zhuǎn)膜后的同一張膜上同時進(jìn)行兩種抗體的孵育。由于條帶位置的差異,可以在同一張膜上分別檢測內(nèi)參和目標(biāo)蛋白。
使用標(biāo)記內(nèi)參抗體:有些實驗室使用預(yù)先標(biāo)記有酶(如HRP)的內(nèi)參抗體,這樣可以在二抗孵育時加入這種標(biāo)記內(nèi)參抗體,按照正常操作進(jìn)行顯色。
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