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關于WB實驗中的marker,你應該知道的事

來源:愛必信(上海)生物科技有限公司   2024年10月23日 11:42  

1、什么是蛋白marker?

 

蛋白Marker,也稱為蛋白質分子量標準(Protein Molecular Weight Marker),是用于蛋白質電泳分析中的一系列已知分子量的蛋白質混合物。它們通常包含多個不同分子量的蛋白質條帶,這些條帶在電泳過程中會根據(jù)分子量的大小和電荷差異遷移不同的距離,從而在凝膠上形成一系列有序的條帶。

 

2、Marker在WB中的作用?

 

分子量標定:Marker包含一系列已知分子量的蛋白質,通過與Marker上的帶狀蛋白質帶進行比較,可以精確地確定待測蛋白的分子量;

驗證電泳和轉印效果:Marker在電泳和轉印的過程中移動到膜上,可以幫助研究者驗證這些步驟的效果。通過檢查Marker的帶狀分布,可以確保電泳和轉印過程中沒有發(fā)生異常;

確定蛋白質遷移距離:通過測量Marker的遷移距離,可以估算待測蛋白質的遷移距離。這對于進一步的數(shù)據(jù)分析和結果解釋非常重要;

標定凝膠濃度:Marker還可以用于幫助研究者選擇適當?shù)哪z濃度。不同分子量的Marker在不同的凝膠濃度下會產生不同的遷移模式,因此可以根據(jù)Marker的遷移特性選擇合適的凝膠濃度。

 

3、Marker有哪些分類,各有什么特點?

 

● 天然蛋白Marker:

 

這類Marker是從自然來源提取的蛋白質,它們經(jīng)歷了天然的修飾過程,如裂解、二硫鍵形成、糖基化或磷酸化,并保持其復雜的3D結構。天然蛋白Marker更接近其在體內的自然狀態(tài),這使得它們在藥物開發(fā)和生物醫(yī)學研究中非常有用。天然蛋白Marker可以提供更準確的分子量估計,因為它們未經(jīng)過重組或合成,保持了蛋白質的自然特性。abs9919非變性蛋白Marker (66-669kDa),經(jīng)過非變性電泳后,用考馬斯亮藍染色后可以得到分布均勻、密度相近的4條帶,不適用于SDS-Page,因為在SDS存在下,含有多個亞單位的蛋白會不同程度解聚。

 

abs9919非變性蛋白Marker(66-669kDa)

 

● 變性Marker:

 

這類Marker在生產過程中經(jīng)過了變性處理,通常是通過加熱和化學物質(如SDS)的處理,以確保蛋白質wan全展開成線性結構。變性Marker的優(yōu)點在于它們提供了一致的蛋白質遷移特性,這對于精確的分子量估計和實驗重復性非常重要。由于變性處理,這類Marker的蛋白質保持一致的電荷和形狀,使得它們在電泳過程中的遷移更加可預測。

 

變性蛋白Marker一般可分為預染和非預染兩種

 

● 未預染蛋白Marker:

 

這類Marker包括寬分子量、高分子量和低分子量蛋白標準。它們是較簡單、較準確的一種,因為不附帶染料分子或標記分子,所以所示大小正好是蛋白原本的大小。缺點是在電泳過程中不可見,需要在電泳結束后經(jīng)過染色才能看到,無法實時監(jiān)控電泳過程。適合精確判斷蛋白大小,但操作相對麻煩,需要額外的染色步驟。如abs9840非預染蛋白Marker (14.4-97.4kDa),用考馬斯亮藍R-250染色可得分布均勻密度相同的六個條帶,產品含SDS, 不適合用于非變性膠。

 

abs9840非預染蛋白Marker(14.4-97.4kDa)

 

● 預染蛋白Marker:

 

這類Marker在生產時就結合了染料,因此在電泳過程中或轉膜時可以直接觀察到不同顏色的條帶。預染蛋白Marker方便實驗人員在電泳時、電泳后,以及轉膜后監(jiān)測電泳情況和估計遷移率。又分為單色預染和多色預染。單色預染Marker通常會利用其中某些條帶加倍濃度來提示其大小,而多色預染Marker用不同的顏色來區(qū)別,更易于辨認 。需要注意的是,預染蛋白Marker與染料共價耦聯(lián),所以在不同的緩沖條件下電泳時遷移特性可能會發(fā)生某些變化,可能導致一些偏差,因此不太適合精確定位蛋白。

 

abs923預染蛋白Marker(10-245kDa)

 

● 預染發(fā)光Western Marker

 

傳統(tǒng)的Western Blot試驗需要使用預染蛋白Marker來跟蹤檢測陽性抗原信號和轉膜效率,但預染蛋白Marker無法在膠片上曝光,曝光信號需要根據(jù)膜上的預染蛋白Marker來判斷。absin新品abs90004 預染發(fā)光Western Marker由9種發(fā)光蛋白和9種預染蛋白組成;9中發(fā)光蛋白分別為23、30、36、44、50、62、90、120和160KDa,這些蛋白均可與抗體結合,因此能與抗原在同一張膜上曝出信號,陽性信號可以直接通過Western Marker的位置來判斷;9種預染蛋白分別為15、25、35、40、55、70、100、130和180KDa,其中70KDa為紅色,其他為藍色,轉膜完畢后在膜上肉眼可見。

1)可與抗原同時檢測信號,使Western blot結果判斷更加簡便;

2)發(fā)光marker沒有偶聯(lián)和標記其他分子,分子量更加準確;

3)綜合發(fā)光marker和預染marker的優(yōu)勢,既能監(jiān)測轉膜又能與抗原同時檢測。

 

HRP標記的Goat anti mouse IgG二抗(一抗:mouse anti P38)ECL化學發(fā)光檢測

 

多重熒光檢測

 

按照分子量又可以將marker分為高分子量、低分子量、寬分子量等。高分子量蛋白Marker是指那些用于檢測大分子量蛋白質的標記,通常包含的蛋白質分子量范圍較高,它們提供的分子量范圍通常從幾十kDa到幾百kDa不等。低分子量蛋白Marker是指用于檢測小分子量蛋白質的標記,通常包含的蛋白質分子量范圍較低,從幾kDa到幾十kDa的分子量范圍。寬分子量蛋白Marker是指覆蓋寬廣分子量范圍的標記,通常包含從低到高多個分子量的蛋白質。

 

4、如何選擇marker?需要考慮什么因素?

 

首先看實驗類型,非變性蛋白需要非變性蛋白marker,變性蛋白則需要變性marker,兩者不可以相互替換,然后看目的蛋白大小,選擇相應的marker,在可選條件下,寬分子量蛋白marker,是不錯的選擇,另外看實驗要求,如果需要在電泳和轉印過程中檢測,需要選擇預染marker,如果需要精確的條帶分子量大小,則需要非預染marker做參考,可以同時使用預染marker和非預染marker,除了以上因素,還需要考慮marker的使用體系,absin常見marker信息如下:

 


類型

非變性蛋白marker

非預染蛋白 Marker

藍色預染蛋白 Marker

多色預染蛋白Marker

預染發(fā)光Western Marker

貨號

abs9919

abs9840

abs9511

abs9859

abs922

abs923

abs924

abs90004

分離量范圍

66-669kDa

14.4-97.4kDa

3.3-31kDa

14.4-97.4kDa

10-180kDa

10-245kDa(Tris-glycine-SDS)

10-180kDa

發(fā)光蛋白:23-160kDa

預染蛋白:15-180kDa

條帶數(shù)量

4

6

5

6

10(10和17可能因為膠濃度原因跑不開)

12

10(10和17可能因為膠濃度原因跑不開)

9

條帶分子量

66、238、440、669

14.4、22、31、43、66.2、97.4

3.3、6.5、14.4、20.1、31

14.4、20.1、31、43、66.2、97.4

10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180

11、17、20、25、35、48、63、75、100、135、180、135、180、245(Tris-glycine-SDS)

10, 17, 25, 33, 43, 55,75, 95, 130,180

發(fā)光蛋白: 23、30、36、44、50、62、90、120 、 160

預染蛋白: 15、25、35、40、55、70、100、130 、 180

顏色

單色

單色

藍色

藍色

75紅色,25k綠色,其余藍色

25綠色,75橙紅色,其余藍色

72橙色,10綠色,其余藍色,10k條帶在15%以下膠濃度時深綠色

預染蛋白70KDa為紅色,其他為藍色,

推薦凝膠體系

非變性電泳

變性電泳

Tricine SDS-PAGE

Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進口一致

Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進口一致

Tris-Glycine
Bis-Tris MOPS
Bis-Tris MES

Tris-Glycine,Bis-Tris,Tris-Acetate,藍色和綠色條帶表觀分子量無變化,橙色條帶和進口一致

Tris-Glycine,Bis-Tris等

處理

需要考馬斯亮藍染色,不能加熱

需要考馬斯亮藍染色及上樣前沸水浴

無需染色,勿加熱

無需染色、無需加熱

無需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理

無需染色、無需加熱

無需染色、直接使用,不要煮沸、稀釋和加入還原劑處理

無需染色、直接使用,不要煮沸




 

非變性蛋白電泳好物推薦


貨號

產品名稱

規(guī)格

abs9116

免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液

100mL

abs9360

Tris-Glycine電泳緩沖液(10×)

500mL

abs9618

Glass gel預制膠 Tris-Gly 15%, 10wells, 1.5mm

10片/盒

abs9954

非變性非還原性蛋白上樣緩沖液(5×)

1mL×5

abs9919

非變性蛋白 Marker(66-669kDa)

200uL

abs964

考馬斯亮藍染色試劑盒(常規(guī)型)

1kit




 

WB好物推薦


 

貨號

產品名稱

規(guī)格

樣本處理

abs9346

細胞漿、細胞核及細胞膜蛋白抽提試劑盒

50T

abs9116

免疫印跡及免疫沉淀用(WB/IP)裂解液

100mL

abs9162

廣譜型磷酸酶抑制劑混合物(100×儲液)

1mL

abs9161

廣譜型蛋白酶抑制劑混合物(不含EDTA,100×DMSO儲液)

1mL

蛋白定量

abs9232

BCA蛋白定量試劑盒

500T

配膠試劑盒,各類預制膠(參考前面表格)

上樣與電泳

abs953

上樣緩沖液(2×)

10mL

abs951

電泳液(10×)

100mL

abs923

預染蛋白Marker(10-245kDa)

500uL

轉膜

abs932

PVDF膜(0.45μm)

20張

abs960

NC膜(0.45μm)

20張

abs950

電轉液(10×)

100mL

封閉

abs9175

脫脂奶粉

500g

abs9157

牛血清白蛋白

100g

抗體稀釋與去除

abs954

WB專用一抗二抗稀釋液

100mL

abs967

Western一抗二抗去除液(強堿性)

500mL

顯色與檢測

abs920

ECL化學發(fā)光檢測試劑盒

25mL×2




 

 

Absin產品線:

爆款產品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測、殘留檢測、多因子檢測);細胞培養(yǎng)(類器官試劑盒+基質膠,胎牛血清+培養(yǎng)添加劑+細胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(抗體/多肽/蛋白/標記/檢測)...

特色產品:雞胚提取物CEE、B27、N2、霍亂毒素B亞單位CTB、牛腦垂體提取物BPE、百日咳毒素PTX、重組人胰島素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...

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