一、tNGS技術(shù)原理
tNGS是一種基于超多重PCR擴增(或靶向捕獲)與高通量測序兩種技術(shù)結(jié)合的新一代測序技術(shù)。它使用大量針對特定基因序列的引物/探針對待測樣品中抽提出的核酸進行超多重PCR擴增/探針捕獲,獲得大量目標核酸片段,再對這些目標核酸片段進行高通量測序,然后對所得序列進行生物信息學分析,從而實現(xiàn)對待測樣本中的核酸進行高靈敏以及高分辨率的識別。
二、tNGS優(yōu)點
1. 針對性強:tNGS只針對特定基因序列進行測序,因此可以大大減少測序數(shù)據(jù)量,提高檢測效率和準確性。
2. 高靈敏度:由于tNGS可以對低濃度的病原微生物進行檢測,因此具有高靈敏度。
3. 高分辨率:tNGS能夠?qū)崿F(xiàn)對病原體特定基因的高分辨率識別,有助于精準診斷。
4. 成本低:與mNGS相比,tNGS的測序數(shù)據(jù)量更少,因此成本更低。
三、tNGS缺點
1. 漏檢非靶向基因:tNGS技術(shù)只能檢測預設(shè)的目標序列,無法檢測非預設(shè)的病原體。
2. 文庫制備復雜:文庫制備過程需要更多的時間和試劑,且操作較為復雜。
四、tNGS應(yīng)用場景
1. 感染性疾病診斷:tNGS技術(shù)能夠快速、準確地檢測臨床樣本中的多種病原微生物,特別是對低濃度的病原微生物及其毒力和耐藥基因的檢測具有顯著優(yōu)勢。這種方法不依賴于傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng),直接對樣本中的幾十種至幾百種已知病原微生物及其毒力和/或耐藥基因進行富集,再進行高通量測序,然后與數(shù)據(jù)庫進行比對分析,從而提供客觀的診斷依據(jù)。
2. 耐藥結(jié)核病檢測:tNGS技術(shù)在耐藥結(jié)核病檢測中表現(xiàn)出色。世界衛(wèi)生組織(WHO)發(fā)布的報告指出,tNGS技術(shù)能夠有效檢測結(jié)核分枝桿菌的耐藥性,具有較高的診斷準確性和成本效益。盡管傳統(tǒng)分子診斷技術(shù)已廣泛應(yīng)用,但tNGS技術(shù)提供了更全面的檢測范圍,解決了部分藥物檢測的盲區(qū),特別是在多耐藥結(jié)核病的判定上具有顯著優(yōu)勢。
3.呼吸道病原體檢測:tNGS技術(shù)也被應(yīng)用于呼吸道病原體的檢測。例如,精準分子醫(yī)學中心開展的呼吸道病原體靶向測序(tNGS)檢測項目,能夠覆蓋常見的呼吸道病原微生物,包括細菌、病毒、真菌等,輔助指導臨床用藥。該技術(shù)不僅提高了診斷的準確性,還提供了耐藥基因的檢測報告,有助于精準治療。
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