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細胞內(nèi)信號通路,也稱為信號轉(zhuǎn)導級聯(lián),在感知和整合不同的外部刺激以產(chǎn)生生物反應方面發(fā)揮著關鍵作用,最終導致細胞過程(增殖、遷移、分化、營養(yǎng)代謝……)。磷酸化反應是由激酶介導的翻譯后修飾,控制參與信號轉(zhuǎn)導蛋白質(zhì)的活性。因此,它是感興趣途徑激活狀態(tài)的反映。
就磷酸化檢測而言,最佳檢測條件不僅取決于所研究的信號轉(zhuǎn)導途徑以及所研究的化合物(激活劑或抑制劑)的藥理學特征,還取決于用于檢測的特定細胞模型(貼壁或懸浮細胞、永生化細胞系或原代細胞、腫瘤、組織……)。正確優(yōu)化檢測條件對于確保獲得最佳的試劑使用和性能至關重要。
本文以HTRF®Advanced phospho-ERK1/2kit為例,為廣大研究者提供優(yōu)化磷酸化蛋白檢測的實用技巧,讓大家更深入地了解如何優(yōu)化過程中的各個步驟以獲得最佳的檢測結(jié)果。
TIP1:Optimize cell density for the best signal amplitude(優(yōu)化細胞密度)
HTRF信號與處理產(chǎn)生的磷酸化蛋白和總蛋白的量成正比,信號隨著磷酸化蛋白濃度增加而增加,如果檢測中磷酸化蛋白質(zhì)的量明顯高于孔中存在的檢測抗體的量,則信號會下降(鉤狀效應)。有必要針對每個HTRF磷酸化或總蛋白檢測試劑盒、不同的細胞模型、甚至每個實驗條件進行細胞密度優(yōu)化,以避免鉤狀效應。
TIP2:Optimize the presence of serum in the cell culture medium(血清饑餓處理)
根據(jù)要研究的信號通路,細胞饑餓處理可能有利于減少目標蛋白質(zhì)的本底水平。通常情況下,從細胞培養(yǎng)基中去除血清是使細胞饑餓的有效方法,但對于某些細胞模型來說,血清的存在對于細胞生長或增殖至關重要。在這種情況下,可以選擇將血清濃度降低至0.5% 或不高于2%,同時應優(yōu)化血清饑餓的時間。
TIP3:Distribute compounds in the presence of cell culture medium(在細胞培養(yǎng)基存在的情況下進行加藥處理)
在將化合物/藥物分配到細胞上之前,請勿從微孔板中除去細胞培養(yǎng)基。加藥步驟中去除培養(yǎng)基會對某些磷酸化蛋白檢測產(chǎn)生不良影響。在去除培養(yǎng)基加藥的情況下,高本底水平基本上掩蓋了任何誘導的藥理學劑量反應的檢測;當培養(yǎng)基存在的情況下加藥時,本底水平較低并且可以檢測到劑量反應(見圖4)。
TIP4:Optimize stimulation time(化合物刺激時間)
評估化合物刺激時間,找出產(chǎn)生最佳信號窗口的時間。
TIP5: Add lysis buffer shortly after removal of stimulation medium(藥物處理結(jié)束后盡快加入lysis buffer)
去除刺激介質(zhì)后延遲添加裂解緩沖液可能會影響化合物的劑量反應。該實驗中,在去除刺激緩沖液后延遲不同時間后加入裂解液—— 5、10或30分鐘。結(jié)果顯示當延遲添加裂解緩沖液時,會對磷酸化ERK的檢測到產(chǎn)生不利影響。
通過上述實用技巧分享希望能夠幫助大家獲得最佳的檢測結(jié)果,磷酸化檢測不僅提供HTRF方案還有Alpha方案,下期再見!
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