Vitae 120 NGS-SA建庫儀在單細(xì)胞測(cè)序建庫中的應(yīng)用
為什么要進(jìn)行單細(xì)胞測(cè)序?
傳統(tǒng)的測(cè)序是以組織為單位進(jìn)行的測(cè)序,所得的測(cè)序結(jié)果是多個(gè)細(xì)胞的平均值,無法精確到單個(gè)細(xì)胞的遺傳信息;而實(shí)際上,細(xì)胞與細(xì)胞之間由于存在異質(zhì)性,即便在腫瘤組織中,腫瘤組織中心的細(xì)胞、周圍的細(xì)胞、以及出現(xiàn)遠(yuǎn)端轉(zhuǎn)移的細(xì)胞,在基因組和轉(zhuǎn)錄組水平上的遺傳信息也是有差異的。而單細(xì)胞測(cè)序是在單個(gè)細(xì)胞水平上對(duì)DNA或RNA進(jìn)行測(cè)序,分析單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)情況,實(shí)現(xiàn)更高分辨率的基因表達(dá)分析。
單細(xì)胞測(cè)序目前主要包括單細(xì)胞基因組測(cè)序、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、單細(xì)胞表觀組測(cè)序。
早期單細(xì)胞測(cè)序流程首先是通過稀釋、流式分選、顯微切割等方式分選出單細(xì)胞,然后進(jìn)行微量建庫,該流程操作復(fù)雜、通量低、成本高;目前主流的高通量單細(xì)胞捕獲測(cè)序是通過Barcode標(biāo)記單個(gè)細(xì)胞,將多個(gè)細(xì)胞混合建庫測(cè)序,后續(xù)數(shù)據(jù)分析的時(shí)候,將同一Barcode標(biāo)記的分子信息視為來自同一個(gè)細(xì)胞。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序流程
以下流程以尋因生物為代表的微流控?cái)?shù)字液滴+Barcoded Beads技術(shù)的高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組建庫試劑盒流程,結(jié)合??芕itae 120 NGS-SA建庫儀,實(shí)現(xiàn)8個(gè)樣本的高效細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的測(cè)序文庫構(gòu)建。
在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序流程中,文庫構(gòu)建環(huán)節(jié)可搭載睿科Vitae 120 NGS-SA建庫儀自動(dòng)化完成文庫構(gòu)建流程。
Vitae 120 NGS-SA建庫儀可以完成的建庫流程
Vitae 120 NGS-SA建庫儀
包含建庫所需要的所有功能模塊(PCR板冷槽、PCR 板加熱模塊、PCR 板振蕩模塊、PCR板磁力架、PCR儀),滿足不同建庫流程的需要;
軟件功能模塊化,無需編寫腳本,通過拖拽式編輯即可適配不同的實(shí)驗(yàn)流程;
積累多個(gè)廠家建庫流程的測(cè)試(諾唯贊、華大、KAPA、illumina、Pacbio、Nanopore),建庫結(jié)果穩(wěn)定有保證。
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