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高通量篩選技術(shù)助力新型肺靶向LNP遞送系統(tǒng)篩選

來源:邁安納(上海)儀器科技有限公司   2025年02月06日 10:52  

基因治療領(lǐng)域的發(fā)展極大地依賴于高效、安全的核酸遞送系統(tǒng)。脂質(zhì)納米顆粒(LNP)作為一種有前景的遞送載體,在mRNA疫苗和療法中展現(xiàn)了巨大潛力。然而,針對特定器官(如肺部)的有效遞送仍面臨挑戰(zhàn)。本研究旨在利用高通量篩選技術(shù),鑒定具有肺部靶向性的陽離子、可降解類脂質(zhì)材料。本文介紹了一種基于Barcode的高通量篩選系統(tǒng),用于鑒定具有肺部靶向效率的陽離子、可降解類脂質(zhì)材料。通過組合合成180種陽離子、可降解脂質(zhì),并進(jìn)行體內(nèi)外高通量篩選,我們確定了多種在肺部有效遞送mRNA的脂質(zhì)納米顆粒(LNP)。其中,LNP-CAD9在肺內(nèi)皮細(xì)胞中成功實(shí)現(xiàn)了基因編輯,顯示出抗血管生成癌癥治療的潛力。


高通量篩選技術(shù)助力新型肺靶向LNP遞送系統(tǒng)篩選

圖一、高通量LNP篩選技術(shù)促進(jìn)肺靶向新型陽離子脂質(zhì)的開發(fā)流程示意圖




01

材料與方法


1.1 脂質(zhì)合成與初步篩選:

研究團(tuán)隊(duì)組合合成了180種陽離子、可降解的脂質(zhì)(CAD脂質(zhì)),這些脂質(zhì)具有不同的化學(xué)結(jié)構(gòu)。

使用體外高通量篩選方法,初步評估這些CAD LNP遞送mRNA的潛力。


1.2 Barcode技術(shù)應(yīng)用:

從初步篩選中選出96種有潛力的CAD LNP,用于封裝Barcode DNA和螢火蟲熒光素酶(FLuc)mRNA。

將這些LNP配方合并,通過系統(tǒng)性給藥方式注入小鼠體內(nèi)。

利用深度測序技術(shù),量化不同器官(心臟、肝臟、脾臟、肺和腎臟)中Barcode DNA的遞送和積累情況。


1.3 候選LNP的進(jìn)一步評估:

根據(jù)深度測序結(jié)果,選出前4種在肺部具有最高遞送效率的LNP進(jìn)行進(jìn)一步評估。

通過在小鼠體內(nèi)遞送FLuc mRNA,評估這些LNP在肺部的mRNA遞送效率。


1.4 抗血管生成治療潛力評估:

選定最佳LNP配方(LNP-CAD9),用于遞送CRISPR-Cas9系統(tǒng)和靶向VEGFR2的sgRNA至小鼠肺部。

評估LNP-CAD9在肺腫瘤模型中誘導(dǎo)VEGFR2基因敲除和抑制腫瘤生長的能力。


02

實(shí)驗(yàn)結(jié)果


2.1 高通量篩選:

為了高效地篩選出具有肺部靶向能力的陽離子可降解脂質(zhì)類似物,研究者們設(shè)計(jì)了一個(gè)基于Barcode DNA的高通量LNP篩選系統(tǒng)。這一系統(tǒng)使得在同一個(gè)動(dòng)物體內(nèi)能夠同時(shí)評估多種納米顆粒,從而極大地提高了篩選效率。

研究者們首先合成了180種陽離子可降解脂質(zhì)(CAD脂質(zhì)),并通過體外高通量篩選初步評估了它們的遞送潛力。在這一階段,他們利用螢火蟲熒光素酶(FLuc)編碼的mRNA來研究CAD LNPs的遞送能力。

隨后,從初步篩選出的CAD LNPs中選擇了96種,用于封裝Barcode DNA和FLuc mRNA。將這些LNP制劑混合后,通過系統(tǒng)給藥的方式注入小鼠體內(nèi)。利用深度測序技術(shù),研究者們能夠量化這些LNPs在各個(gè)器官(心臟、肝臟、脾臟、肺部和腎臟)中的積累情況,從而識(shí)別出具有肺部靶向能力的CAD脂質(zhì)候選物。通過體內(nèi)篩選,發(fā)現(xiàn)了21種在體內(nèi)具有肺部遞送能力的CAD LNP,并進(jìn)一步通過富集分析確定了LNP配方(LNP-CAD3、LNP-CAD4、LNP-CAD9和LNP-CAD10),這些配方能夠高效地將核酸貨物遞送到肺部。

為了驗(yàn)證Barcode DNA積累量能否準(zhǔn)確反映CAD LNPs的mRNA遞送能力,研究者們選擇了在肝臟中表現(xiàn)最佳的LNP-CAD20進(jìn)行體內(nèi)FLuc mRNA遞送實(shí)驗(yàn)。結(jié)果表明,該LNP能夠在肝臟中特異性地表達(dá)熒光素酶,這支持了高通量Barcode篩選結(jié)果的準(zhǔn)確性。


2.2 構(gòu)效關(guān)系研究結(jié)果:

化學(xué)結(jié)構(gòu)與遞送效率的關(guān)系:

研究了CAD脂質(zhì)的化學(xué)結(jié)構(gòu)對其遞送效率的影響。通過改變脂質(zhì)的化學(xué)特性(如離子化性質(zhì)、尾部結(jié)構(gòu)等),發(fā)現(xiàn)這些變化對LNP的遞送效率有顯著影響。特定的化學(xué)結(jié)構(gòu)特征(如特定的離子化脂質(zhì)尾部結(jié)構(gòu))被發(fā)現(xiàn)能夠增強(qiáng)LNP對肺部的靶向性。


LNP的物理特性與遞送效率的關(guān)系:

研究了LNP的物理特性(如粒徑、表面電荷等)對其遞送效率的影響。通過調(diào)整這些物理特性,發(fā)現(xiàn)能夠進(jìn)一步優(yōu)化LNP的遞送效率。例如,具有均勻固體核心形態(tài)的CAD LNP在遞送mRNA時(shí)表現(xiàn)出更高的效率。

高通量篩選技術(shù)助力新型肺靶向LNP遞送系統(tǒng)篩選

圖二、不同結(jié)構(gòu)CAD脂質(zhì)與體外細(xì)胞表達(dá)的構(gòu)效關(guān)系研究



高通量篩選技術(shù)助力新型肺靶向LNP遞送系統(tǒng)篩選

圖三、Barcode標(biāo)記的96種不同陽離子LNP與體內(nèi)器官靶向分布的構(gòu)效關(guān)系研究


2.3 最佳LNP配方的確定:

體內(nèi)遞送效率:為了驗(yàn)證這4種LNP配方的mRNA肺部遞送效率,研究人員將含有螢火蟲熒光素酶(FLuc)mRNA的LNP-CAD3、LNP-CAD4、LNP-CAD9和LNP-CAD10以0.1mg/kg的劑量系統(tǒng)注射到C57BL/6J雌性小鼠體內(nèi)。通過生物發(fā)光成像技術(shù)確認(rèn),這4種CAD LNPs均能夠按預(yù)期將mRNA遞送到肺部。


與金標(biāo)準(zhǔn)系統(tǒng)的比較:為了評估LNP-CAD9的遞送潛能,研究人員還制備了一種金標(biāo)準(zhǔn)肺靶向MC3/DOTAP LNP系統(tǒng),該系統(tǒng)已被FDA批準(zhǔn)用于MC3LNP中的mRNA肺部遞送。比較結(jié)果顯示,LNP-CAD9在肺部遞送效率方面顯著優(yōu)于MC3/DOTAP系統(tǒng)


高通量篩選技術(shù)助力新型肺靶向LNP遞送系統(tǒng)篩選

圖四、小鼠肺靶向LNP的優(yōu)選分子的評價(jià)與驗(yàn)證


2.4 抗血管生成治療潛力:

除了評估CAD LNPs的遞送效率外,研究者們還探索了它們在抗血管生成癌癥治療中的潛在應(yīng)用。LNP-CAD9遞送Cas9 mRNA和靶向VEGFR2的sgRNA,在4.0 mg/kg的劑量下有效誘導(dǎo)小鼠肺內(nèi)皮細(xì)胞的VEGFR2基因敲除。在肺腫瘤模型中,LNP-CAD9表現(xiàn)出顯著的抗血管生成治療潛力,能夠抑制腫瘤生長,其療效優(yōu)于金標(biāo)準(zhǔn)的肺趨向性MC3/DOTAP LNP系統(tǒng)。

高通量篩選技術(shù)助力新型肺靶向LNP遞送系統(tǒng)篩選

圖五:CAD9 LNP敲除VEGFR2產(chǎn)生抗血管生產(chǎn)作用治療小鼠肺腫瘤的效果評價(jià)



03


討論


本研究通過高通量篩選技術(shù),成功鑒定了具有肺部靶向性的陽離子、可降解類脂質(zhì)材料。LNP-CAD9作為其中的杰出者,在抗血管生成癌癥治療中展現(xiàn)出了巨大潛力。高通量篩選技術(shù)的運(yùn)用,不僅加速了LNP的發(fā)現(xiàn)過程,還克服了基因治療應(yīng)用中肺部遞送的障礙。


高通量篩選技術(shù)在本研究中的作用主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:

1.提高了篩選效率:通過自動(dòng)化設(shè)備和先進(jìn)的檢測方法,高通量篩選技術(shù)能夠在短時(shí)間內(nèi)對大量化合物進(jìn)行快速篩選,從而極大地提高了新藥發(fā)現(xiàn)的效率。在本研究中,我們成功篩選了180種化學(xué)性質(zhì)不同的CAD LNP,并確定了多種高效遞送LNP。

2.增強(qiáng)了篩選準(zhǔn)確性:高通量篩選技術(shù)具有高度的靈敏度和特異性,能夠準(zhǔn)確識(shí)別出具有潛在生物活性的化合物。在本研究中,我們利用Barcode技術(shù),實(shí)現(xiàn)了對LNP體內(nèi)遞送效率的精確量化,從而確保了篩選結(jié)果的準(zhǔn)確性。

3.拓展了應(yīng)用范圍:高通量篩選技術(shù)不僅適用于藥物研發(fā)領(lǐng)域,還可應(yīng)用于生物學(xué)研究、器官篩查、基因工程等多個(gè)方面。在本研究中,我們成功將高通量篩選技術(shù)應(yīng)用于LNP的篩選和優(yōu)化,為基因治療領(lǐng)域的發(fā)展提供了新的思路和方法。


參考文獻(xiàn):Xue, Lulu, et al. "High-throughput barcoding of nanoparticles identifies cationic, degradable lipid-like materials for mRNA delivery to the lungs in female preclinical models." Nature Communications 15.1 (2024): 1884.



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