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mRNA-LNP疫苗制備流程與免疫評價(jià)實(shí)驗(yàn)方案分享

來源:邁安納(上海)儀器科技有限公司   2025年02月14日 10:15  

隨著生物技術(shù)的飛速發(fā)展,mRNA疫苗作為一種新型疫苗技術(shù),憑借其特定的優(yōu)勢在疾病預(yù)防和治療領(lǐng)域展現(xiàn)出巨大的潛力。本文將詳細(xì)介紹一種針對特定抗原序列的mRNA脂質(zhì)納米顆粒(LNP)疫苗的開發(fā)流程,以及在小鼠模型中評估其免疫效率的實(shí)驗(yàn)方案。該方案涵蓋了從mRNA序列設(shè)計(jì)、合成、LNP封裝到小鼠免疫的全過程,并包括了關(guān)鍵的質(zhì)量控制檢測和免疫反應(yīng)評估技術(shù)。


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mRNA序列設(shè)計(jì)

mRNA疫苗的核心是其序列設(shè)計(jì)。本研究中使用的mRNA序列包含5'非翻譯區(qū)(UTR)、編碼5種抗原的序列、GFP報(bào)告基因、3'UTR以及聚腺苷酸(PolyA)尾。5'和3'UTR序列對于mRNA的穩(wěn)定性和翻譯效率至關(guān)重要,通常來源于高表達(dá)基因的UTR區(qū)域,如α-珠蛋白基因。PolyA尾不僅促進(jìn)有效翻譯,還能增強(qiáng)mRNA的穩(wěn)定性,可通過DNA模板編碼或在體外轉(zhuǎn)錄后添加。此外,質(zhì)粒中還設(shè)計(jì)了特定的限制酶位點(diǎn),便于質(zhì)粒DNA的線性化,為后續(xù)的體外轉(zhuǎn)錄(IVT)做準(zhǔn)備。


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質(zhì)粒DNA準(zhǔn)備

質(zhì)粒DNA的準(zhǔn)備是mRNA合成的基礎(chǔ)。通過細(xì)菌轉(zhuǎn)化,使用STBL3大腸桿菌細(xì)胞放大編碼mRNA模板的質(zhì)粒DNA。這一過程包括將少量質(zhì)粒DNA與細(xì)菌細(xì)胞混合、熱激處理、培養(yǎng)以及篩選單個(gè)菌落進(jìn)行擴(kuò)增。最終,使用市售的無內(nèi)毒素質(zhì)粒DNA分離試劑(如Promega的PureYield Plasmid Maxiprep System)提取質(zhì)粒DNA,以確保后續(xù)實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行。


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骨髓源性樹突狀細(xì)胞(BMDCs)的生成

樹突狀細(xì)胞(DCs)是專業(yè)的抗原呈遞細(xì)胞,在啟動免疫反應(yīng)中發(fā)揮關(guān)鍵作用。本研究中,通過從6-8周齡小鼠的骨髓中分離細(xì)胞,并在GM-CSF的作用下培養(yǎng)分化成BMDCs。這一過程需要精確的細(xì)胞操作和培養(yǎng)條件控制,以確保獲得高質(zhì)量的BMDCs,用于后續(xù)的體外實(shí)驗(yàn)。


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B16F10黑色素瘤細(xì)胞的收集

B16F10黑色素瘤細(xì)胞系用于模擬腫瘤環(huán)境,評估疫苗的抗腫瘤效果。細(xì)胞在DMEM培養(yǎng)基中培養(yǎng),至少在解凍后3-7天收集,以確保細(xì)胞從解凍過程中恢復(fù),保持良好的生長狀態(tài)。收集的細(xì)胞用于后續(xù)的體內(nèi)移植實(shí)驗(yàn),以評估疫苗的保護(hù)效果。


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mRNA合成與質(zhì)量控制

mRNA的合成是疫苗制備的關(guān)鍵步驟。使用線性化的DNA模板進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄(IVT),并在反應(yīng)中加入CleanCap AG和N1-甲基偽尿苷-5'-三磷酸(m1c),以減少mRNA的免疫原性并提高翻譯效率。合成后的mRNA通過Agilent RNA 6000 Nano kit assay進(jìn)行質(zhì)量控制,確保mRNA的純度和完整性。此外,通過dot-blot分析檢測IVT RNA樣本中的雙鏈RNA(dsRNA)含量,因?yàn)閐sRNA可能具有免疫原性,影響疫苗的安全性和有效性。


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圖 1 .mRNA 純度和免疫原性的表征


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I型干擾素(IFN-I)反應(yīng)檢測

為了評估m(xù)RNA的免疫原性,使用THP-1細(xì)胞系檢測IVT mRNA封裝在脂質(zhì)體中的I型干擾素反應(yīng)。這一檢測不僅有助于評估m(xù)RNA本身的免疫原性,還能反映LNP封裝對mRNA免疫原性的影響。通過量化細(xì)胞上清中的干擾素水平,可以篩選出免疫原性較低的mRNA構(gòu)建體,為疫苗的安全性提供保障。


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mRNA-LNP的制備與表征

mRNA-LNP的制備是疫苗遞送系統(tǒng)的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。將mRNA封裝在LNP中,以保護(hù)mRNA免受降解,并促進(jìn)其通過內(nèi)吞/吞噬途徑進(jìn)入細(xì)胞。本期文章將繼續(xù)分享mRNA-LNP的制備流程,包括含、RNA的水相樣品準(zhǔn)備和微流控法包封mRNA-LNP。


7.1 LNP脂質(zhì)配制:


LNP的脂質(zhì)組分是影響其性能的關(guān)鍵因素之一。常用的LNP配方包括可電離脂質(zhì)、磷脂DSPC、膽固醇和穩(wěn)定劑,其摩爾比為50:10:37.5:2.5。這種配方經(jīng)過優(yōu)化,能夠有效地保護(hù)mRNA,促進(jìn)其在細(xì)胞內(nèi)的釋放,并減少免疫原性。

在實(shí)際應(yīng)用中,根據(jù)不同的mRNA疫苗或藥物的需求,脂質(zhì)的摩爾比例和總濃度可能會有所調(diào)整。例如,BioNTech的BNT-162b2、Moderna的mRNA-1273以及Alnylam的Onpattro等獲批用于人體的LNP配方,其脂質(zhì)組分和摩爾比例各有特點(diǎn),以適應(yīng)不同的治療目標(biāo)和遞送需求。


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7.2 mRNA樣品準(zhǔn)備:


mRNA樣品的濃度和氮磷比(N/P)是影響LNP包封效果的重要參數(shù)。N/P比是指脂質(zhì)中的氮原子與mRNA中的磷原子的摩爾比,常用的N/P比為4、6或8。N/P比的計(jì)算公式為:

N/P=脂質(zhì)含N摩爾數(shù)/mRNA含P摩爾數(shù)

磷(P):每個(gè)堿基含有一個(gè)磷酸根,1 mol的核糖核苷酸包含1 mol的磷酸基團(tuán)。RNA脫水聚合后的平均分子量均值為320.5 g/mol。

氮(N):常規(guī)的四組分LNP脂質(zhì)中,以可電離脂質(zhì)比例計(jì)算氮原子數(shù),每個(gè)可電離脂質(zhì)包含1個(gè)氮原子(D-LIN-MC3、ALC-0315、SM-102)。以可電離脂質(zhì)占比50%計(jì)算,每mol總脂質(zhì)中包含0.5 mol的氮原子。注:部分脂質(zhì)含有多個(gè)N原子,或多個(gè)組分含有N原子,計(jì)算時(shí)需注意。

在制備過程中,根據(jù)脂質(zhì)摩爾濃度和N/P比,可以計(jì)算出所需的mRNA濃度。例如,當(dāng)總脂質(zhì)摩爾濃度為12mM,N/P比為6時(shí),mRNA的濃度約為107 μg/mL。


7.3 微流控包封:


mRNA-LNP的包封具體步驟如下:

料液準(zhǔn)備:按照實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),配置水相(包含緩沖液和mRNA)和有機(jī)相(脂質(zhì)混合物)。

注射器裝載:將水相和有機(jī)相分別吸入注射器中,并排出空氣。將裝有mRNA溶液的注射器和裝有脂質(zhì)混合物的注射器插入芯片接口。

儀器設(shè)置:設(shè)置總流速(TFR)為12mL/min、總體積2mL、水相/有機(jī)相流速比(FRR)為3:1,初始排廢體積為0.35mL,結(jié)束排廢量為0.05 mL。

運(yùn)行與收集:啟動儀器,收集包封后的mRNA-LNP樣品。

后處理:通過超濾或透析將mRNA-LNP換液至特定緩沖液,以去除有機(jī)溶劑。


7.4 理化數(shù)據(jù)檢測:


制備后的mRNA-LNP通過動態(tài)光散射(DLS)和Quant-it Ribogreen測定法進(jìn)行物理化學(xué)特性表征,評估其粒徑、電位、封裝效率和穩(wěn)定性。這些參數(shù)對于確保疫苗的有效遞送和釋放至關(guān)重要。


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圖 2 .新鮮和冷凍 mRNA-LNPs 的理化及穩(wěn)定性特性的測定


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抗原呈遞的評估

在B16F10癌細(xì)胞系和BMDCs中轉(zhuǎn)染mRNA疫苗后,使用抗H2-Kb/SIINFEKL-PE偶聯(lián)抗體檢測SIINFEKL肽在H2-Kb上的呈遞。這一實(shí)驗(yàn)步驟不僅驗(yàn)證了mRNA疫苗在細(xì)胞內(nèi)的翻譯和抗原呈遞能力,還作為質(zhì)量控制的關(guān)鍵環(huán)節(jié),確保疫苗能夠有效激活免疫系統(tǒng)。


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小鼠免疫實(shí)驗(yàn)與抗原特異性T細(xì)胞反應(yīng)評估

在小鼠模型中,通過尾靜脈注射mRNA-LNP疫苗進(jìn)行免疫,評估其誘導(dǎo)的抗原特異性CD8+ T細(xì)胞反應(yīng)。使用四聚體肽-MHC-I復(fù)合物(tetramers)檢測抗原特異性T細(xì)胞,為疫苗的免疫原性提供直接證據(jù)。此外,通過腫瘤挑戰(zhàn)模型評估疫苗的抗腫瘤效果,以腫瘤生長作為指標(biāo),進(jìn)一步驗(yàn)證疫苗的實(shí)際應(yīng)用潛力。


9.1 第 1 - 5 天:給小鼠進(jìn)行免疫:


  1. 通過腹腔注射 0.1ml 20% Ketamine、10% Pentobarbital Sodium混合液(用蒸餾水稀釋)使小鼠麻醉(假設(shè)小鼠體重為 25 克,麻醉液的注射量應(yīng)根據(jù)體重和麻醉反應(yīng)進(jìn)行調(diào)整)。
  2. 每只小鼠通過眼眶后注射 125μl 1 倍 PBS 稀釋的 10μg mRNA-LNP 進(jìn)行免疫。作為陰性對照,用 1 倍 PBS 對小鼠進(jìn)行免疫(圖 4A)。注意:mRNA-LNP 疫苗可通過其他途徑給藥,如肌肉注射、皮內(nèi)注射、皮下注射或鼻內(nèi)注射。不同的給藥途徑會對免疫反應(yīng)的動態(tài)和特性產(chǎn)生不同的影響。
  3. 在第 5 天給予加強(qiáng)劑量,即 10μg mRNA-LNP 或 1 倍 PBS 作為陰性對照。


9.2 第 8 天:分離外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)和脾細(xì)胞:


  1. 在 6 孔板中加入 5ml cold RPMI 培養(yǎng)基,并準(zhǔn)備用于脾臟和血液采集的帶標(biāo)簽微量離心管。
  2. 通過吸入致死劑量的二氧化碳,隨后進(jìn)行頸椎脫臼的方式處死一只小鼠。立即開始解剖。
  3. 采血。
  4. 脾臟采集。
  5. 外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)分離。
  6. 脾細(xì)胞分離。
  7. 第 8 天及以后:使用冷凍的外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)和脾細(xì)胞進(jìn)行多聚體染色分析:注意:在此步驟中,將準(zhǔn)備好的 PBMC 和脾細(xì)胞用與 mRNA-LNP 疫苗編碼的抗原相對應(yīng)的 MHC-肽多聚體進(jìn)行染色。
    最后,每種待分析的組織類型都需要制備對照。
  8. 使用新鮮的外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)和脾細(xì)胞進(jìn)行四聚體染色分析。
  9. 去除上清液,每孔用 50μl 四聚體染色緩沖液(含 2%胎牛血清的 PBS)和 50nM 達(dá)沙替尼重懸。在 25℃ 下孵育 30 分鐘。
  10. 將四聚體儲備液在四聚體染色緩沖液中 1:10 稀釋,每孔準(zhǔn)備 5μl 稀釋后的四聚體溶液。
  11. 每孔加入 5μl 四聚體溶液(含 0.5μl 四聚體),重懸所有孔以混合。
  12. 在冰上避光孵育 30 分鐘。
  13. 向每個(gè)孔中加入 150μl 四聚體染色緩沖液,然后離心(500×g,5 分鐘,4℃)。
  14. 撒掉上清液,用 200μl 四聚體染色緩沖液重懸,再次離心(500×g,5 分鐘,4℃)。
  15. 撒掉上清液,用 100μl 表面染色混合液重懸每個(gè)孔。
  16. 在冰上避光孵育 25 分鐘。每孔準(zhǔn)備 100μl 表面染色混合液,含1:1000 的死活染料、1:800 的抗 CD8 AF647 以及 1:400 的抗 CD45 PerCP-Cy5.5、抗 CD3 BV421 和抗 CD4 BV711,均在四聚體染色緩沖液中。
  17. 向每個(gè)孔中加入 100μl 四聚體染色緩沖液,離心(500×g,5 分鐘,4℃)。
  18. 撒去上清液。
  19. 用 200μl 四聚體染色緩沖液重懸每個(gè)孔,再次離心(500×g,5 分鐘,4℃)。
  20. 撒去上清液,用 200μl 四聚體染色緩沖液重懸。
  21. 將樣本置于 4℃ 避光保存,直至準(zhǔn)備通過流式細(xì)胞術(shù)進(jìn)行分析(圖 4A - 4E)。注意:最佳熒光素的選擇取決于所使用的流式細(xì)胞儀。


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圖 4. mRNA-LNP 疫苗接種后抗原特異性 T 細(xì)胞的誘導(dǎo)及抗腫瘤免疫反應(yīng)


結(jié)論

本研究詳細(xì)介紹了mRNA脂質(zhì)納米顆粒疫苗的開發(fā)流程和小鼠免疫效率分析的實(shí)驗(yàn)方案。從mRNA序列設(shè)計(jì)到LNP封裝,再到小鼠免疫實(shí)驗(yàn),每一步都經(jīng)過精心設(shè)計(jì)和嚴(yán)格的質(zhì)量控制。通過這一方案,我們能夠開發(fā)出具有高效免疫原性和良好安全性的mRNA疫苗,為預(yù)防和治療疾病提供新的策略。盡管實(shí)驗(yàn)過程中存在一些局限性,如僅測量IFN-I反應(yīng)來評估m(xù)RNA免疫原性,以及依賴特定抗體來測量抗原呈遞,但通過不斷優(yōu)化和改進(jìn),mRNA疫苗技術(shù)有望在未來的醫(yī)學(xué)領(lǐng)域發(fā)揮更大的作用。


參考文獻(xiàn):[1] Karekar N, Reid Cahn A, Morla-Folch J, Saffon A, Ward RW, Ananthanarayanan A, Teunissen AJP, Bhardwaj N, Vabre. Protocol for the development of mRNA lipid nanoparticle vaccines and analysis of immunization efficiency in mice. STAR Protoc. 2024 Jun 21;5(2):103087. doi: 10.1016/j.xpro.2024.103087.



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