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超潔凈UCF.ME® Thermostable RNase H,精準切割,實驗更高效!

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2025年03月07日 14:07  

E. coli RNase H(E. coli 核糖核酸酶 H)是一種能夠特異性降解RNA-DNA雜交鏈中RNA部分的酶,在DNA復(fù)制、修復(fù)和轉(zhuǎn)錄等過程中發(fā)揮重要作用。它通過切割RNA鏈,確保DNA模板的完整性和穩(wěn)定性,因此在分子生物學(xué)實驗中被廣泛應(yīng)用,例如cDNA合成、rRNA去除和RNA干擾研究。然而,RNase H 在使用過程中也存在一些缺陷:1)它可能對單鏈RNA或DNA產(chǎn)生非特異性切割,影響實驗結(jié)果的準確性;2)其熱穩(wěn)定性較差,難以在高溫條件下保持活性,因此不適用于高溫逆轉(zhuǎn)錄、PCR等需要高溫環(huán)境的實驗。這些局限性促使研究人員開發(fā)熱穩(wěn)定RNase H,以拓展其應(yīng)用范圍并提高實驗效率。

 


圖1.RNase H作用機理

 

源自Thermus thermophilus的Thermostable RNase H(熱穩(wěn)定核糖核酸酶H)是E. coli RNase H的同源物,在功能上表現(xiàn)出相似的核糖核酸內(nèi)切酶特性。它能夠精準識別并高效切割 RNA:DNA雜交體中的RNA鏈磷酸二酯鍵,同時確保DNA鏈的完整性。通過對蛋白結(jié)構(gòu)的深入分析發(fā)現(xiàn),盡管T. thermophilus RNase H的整體穩(wěn)定性分布與E. coli RNase H具有一定相似性,但前者在整體穩(wěn)定性以及殘基局部穩(wěn)定性方面均表現(xiàn)出顯著提升。Thermostable RNase H的最佳活性溫度在65℃以上,更高的反應(yīng)溫度能夠顯著提升反應(yīng)的特異性和效率,減少非特異性切割。這一特性使其在分子生物學(xué)實驗中展現(xiàn)出廣泛的應(yīng)用潛力,例如:

  • rRNA去除;

  • mRNA加帽率檢測;

  • 去除雜交到poly(dT)上的mRNA poly(A);

  • cDNA第二鏈合成中去除mRNA;

  • 提升高溫逆轉(zhuǎn)錄、等溫擴增、PCR實驗的擴增效率。

 

圖2.Thermostable RNase H和E. coli RNase H三維結(jié)構(gòu)圖[1]

 

Thermostable RNase H常用于病原菌檢測實驗中,如在宏基因組測序(mNGS)和病原靶向測序(tNGS)中常用于rRNA去除實驗,若分子酶中存在宿主或其他背景菌核酸殘留,可能會嚴重影響檢測結(jié)果的準確性。為此,翌圣生物基于UCF.ME®超潔凈工藝技術(shù)推出UCF.ME® Thermostable RNase H (Cat#14545),該產(chǎn)品由UCF.ME®超潔凈分子酶生產(chǎn)基地生產(chǎn),從物料篩選到環(huán)境控制,從工藝優(yōu)化到質(zhì)量檢測,每一環(huán)節(jié)均經(jīng)過嚴格把控,確保極低的背景菌gDNA殘留和核酸酶殘留,為實驗結(jié)果的準確性、可靠性和重復(fù)性提供了強有力的保障。

 

 

產(chǎn)品優(yōu)勢

 
  • 活性強、批間一致性好;

  • 極低宿主 gDNA 殘留:<0.02 Copies/U;

  • 無核酸外切酶、切口酶、RNase 酶殘留;

  • 優(yōu)異的穩(wěn)定性:在4℃處理32天、25℃處理16天和37℃處理7天后,酶活性無明顯下降。

 
 
 

 

 

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產(chǎn)品名稱

貨號

規(guī)格

目錄價

活動價

UCF.ME® Thermostable RNase H

14545ES72

250 U

759元

0元

 

活動細則:

1、活動時間:2025年3月5日-2025年3月31日;

2、活動名額有限,每位客戶限一套。

 

 

 

 

性能展示

 

翌圣UCF.ME®  Thermostable RNase H  (Cat#14545)

01

活性強、批間一致性好

使用3批次UCF.ME® Thermostable RNase H分別與RNA:DNA 底物進行孵育,并通過瓊脂糖凝膠電泳分析譜帶變化。實驗結(jié)果表明,翌圣0.05 U的UCF.ME® Thermostable RNase H能有效切割20 pmol RNA:DNA底物中的RNA,且批間一致性優(yōu)異,展現(xiàn)了產(chǎn)品的高穩(wěn)定性和可靠性。

 

圖3.UCF.ME® Thermostable RNase H活性檢測結(jié)果

注:反應(yīng)條件:50℃ 20min;RNA:DNA底物-20 pmol

 

02

宿主gDNA殘留低:<0.02 Copies/U

通過對不同批次的UCF.ME® Thermostable RNase H進行宿主(E.coli)gDNA殘留檢測,結(jié)果顯示,3批次產(chǎn)品的宿主gDNA殘留量均遠低于0.02 copies/U,確保了產(chǎn)品的高純度和實驗的可靠性。

 

圖4.UCF.ME® Thermostable RNase H宿主gDNA殘留結(jié)果

 

03

無核酸外切酶、切口酶、RNase酶殘留

將25 U UCF.ME® Thermostable RNase H分別與核酸底物孵育,并通過瓊脂糖凝膠電泳分析譜帶變化。實驗結(jié)果表明,翌圣的3個批次UCF.ME® Thermostable RNase H均未檢測到核酸外切酶、切口酶或RNase殘留,為實驗結(jié)果的準確性和可靠性提供了有力保障。

 

圖5.UCF.ME® Thermostable RNase H核酸外切酶、切口酶、RNase殘留檢測結(jié)果

 

04

穩(wěn)定性好

將UCF.ME® Thermostable RNase H分別置于4℃處理32天、25℃處理16天和37℃處理7天后,測定其酶活。結(jié)果顯示,酶活均無明顯下降,充分證明了翌圣UCF.ME® Thermostable RNase H在寬溫度范圍內(nèi)具有優(yōu)異的穩(wěn)定性,能夠滿足不同實驗條件的長期存儲和使用需求。

 

圖6.UCF.ME® Thermostable RNase H加速穩(wěn)定性結(jié)果

 

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來源

產(chǎn)品名稱

貨號

T. thermophilus

UCF.ME® Thermostable RNase H

14545ES

E. coli

RNase H

12906ES

 

參考文獻:

[1] Hollien J, Marqusee S. Structural distribution of stability in a thermophilic enzyme[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 1999, 96(24): 13674-13678.

[2] Wolf E J , Dai N , Chan S H .Selective Characterization of mRNA 5′End-Capping by DNA Probe-Directed Enrichment with Site-Specific Endoribonucleases[J].[2025-03-03].

[3] Gu H , Sun Y H , Li X Z .Novel rRNA-depletion methods for total RNA sequencing and ribosome profiling developed for avian species[J].Poultry Science, 2021, 100(7):101321. DOI:10.1016/j.psj.2021.101321.



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