實時熒光定量 PCR 的結(jié)果分析--實時熒光定量 PCR 常用名詞
校正染料 (ROX)
校正加樣誤差或孔與孔之間的誤差,提供一個穩(wěn)定的基線,極大地改進定量的精確 度,提高重復管之間的數(shù)據(jù)重現(xiàn)性。
注意:不同的儀器對 ROX 的需求不同。
基線
PCR 的最初幾個循環(huán),在 此基線上熒光信號幾乎沒有變化。
閾值
可以相信的最小熒光值。
CT 值
擴增曲線與閾值交點的橫坐標。
二、結(jié)果有效性判斷
融解曲線單峰 ( 染料法 )
擴增曲線指數(shù)擴增區(qū)域,復孔間 CT 值 STD<0.2
閾值設(shè)置合理
閾值位于指數(shù)增長期:儀器會自動計算閾值,但并非所有情況下儀器計算結(jié)果都是 合理的,必要時進行手動調(diào)整。
NTC 確認無氣溶膠污染或可以忽略
NTC = No Template Control (qPCR 反應,模板以水代替 );
若 ΔCT=NTC (CT 值 ) - 目的基因 (CT 值 ) ≥3 或 ≥5,可認為體系中氣溶膠污染不會 影響到實驗結(jié)果的準確性。
NRT 確認無基因組殘留或可以忽略
NRT=No RT Control ( 逆轉(zhuǎn)錄反應中,除逆轉(zhuǎn)錄酶組分,其余組分正常添加 );
若 ΔCT=NRT (CT 值 ) - 目的基因 (CT 值 ) ≥3 或 ≥5,可認為體系中基因組殘留不會 影響到實驗結(jié)果的準確性。
待測 CT 值于線性范圍內(nèi)
擴增效率符合近似計算標準
PCR 擴增效率 (e) 介于 90%-120% 之間
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