實(shí)時(shí)熒光定量PCR( qPCR)探針類方法具體表現(xiàn)
實(shí)時(shí)熒光定量PCR(Real-time Quantitative PCR, qPCR)的化學(xué)原理主要包括兩種類型:探針類和非探針類。其中,探針類方法具體包括:
TaqMan 探針?lè)ǎ?/span>
原理:在PCR反應(yīng)體系中,加入一對(duì)引物的同時(shí)再加入一個(gè)特異性的熒光探針。探針兩端分別標(biāo)記一個(gè)熒光報(bào)告基團(tuán)和一個(gè)淬滅基團(tuán)。探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收,PCR儀檢測(cè)不到熒光信號(hào);PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5' - 3'外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)可接收到熒光信號(hào),實(shí)現(xiàn)了熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成全同步,這是定量的基礎(chǔ)。
優(yōu)點(diǎn):具有高度特異性,重復(fù)性好,熒光信號(hào)強(qiáng),適合進(jìn)行基因拷貝數(shù)的確定,尤其是在臨床診斷中,如病毒和病原菌定量檢測(cè)。
缺點(diǎn):只適合一個(gè)特定的目標(biāo),探針價(jià)格較高。
分子信標(biāo)技術(shù):
原理:分子信標(biāo)是一種發(fā)夾結(jié)構(gòu)的熒光探針,兩端分別標(biāo)記有報(bào)告基團(tuán)和淬滅基團(tuán)。在游離狀態(tài)下,報(bào)告基團(tuán)與淬滅基團(tuán)靠近,熒光信號(hào)被淬滅。當(dāng)與目標(biāo)序列結(jié)合時(shí),發(fā)夾結(jié)構(gòu)打開(kāi),報(bào)告基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,發(fā)出熒光信號(hào)。
優(yōu)點(diǎn):具有高度特異性,能夠區(qū)分成熟microRNA分子和前體分子以及其它成熟microRNA的同源分子,適用于高通量的SNP檢測(cè)。
缺點(diǎn):設(shè)計(jì)復(fù)雜,需要特定的序列信息。
FRET(熒光共振能量轉(zhuǎn)移)技術(shù):
原理:利用兩個(gè)熒光基團(tuán)之間的能量轉(zhuǎn)移來(lái)檢測(cè)PCR產(chǎn)物。一個(gè)基團(tuán)作為供體,另一個(gè)作為受體。當(dāng)它們?cè)谝欢ň嚯x內(nèi)時(shí),供體的熒光能量可以轉(zhuǎn)移到受體,產(chǎn)生特定的熒光信號(hào)。
優(yōu)點(diǎn):可以實(shí)現(xiàn)多重反應(yīng),適用于同時(shí)檢測(cè)多個(gè)基因。
缺點(diǎn):設(shè)計(jì)和應(yīng)用相對(duì)復(fù)雜。
這些探針類方法通過(guò)特異性地結(jié)合或檢測(cè)PCR產(chǎn)物,提供了高度的特異性和準(zhǔn)確性,但通常需要設(shè)計(jì)特定的探針,且成本相對(duì)較高。
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