實時熒光定量擴(kuò)增系統(tǒng)(qPCR)作為分子生物學(xué)領(lǐng)域的一項革命性技術(shù),自1996年由美國Applied Biosystems公司推出以來,已廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)分析、病原體檢測、遺傳變異研究等多個領(lǐng)域。該技術(shù)通過實時監(jiān)測PCR反應(yīng)過程中熒光信號的變化,實現(xiàn)了對目標(biāo)DNA或RNA序列的精確量化,為科研人員提供了前-所未有的精準(zhǔn)度與效率。
技術(shù)原理
qPCR技術(shù)是在傳統(tǒng)PCR定性技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的核酸定量技術(shù)。在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程。熒光基團(tuán)可以是SYBR Green等非特異性染料,也可以是TaqMan探針等特異性標(biāo)記。隨著PCR循環(huán)的進(jìn)行,熒光信號會隨著擴(kuò)增產(chǎn)物的增加而增強,從而允許實時監(jiān)測并定量初始模板的數(shù)量。
熒光擴(kuò)增曲線一般由基線期、指數(shù)擴(kuò)增期和平臺期組成。在基線期,擴(kuò)增的熒光信號被熒光背景信號所掩蓋,無法判斷產(chǎn)物量的變化;在指數(shù)擴(kuò)增期,熒光信號超過背景信號并到達(dá)閾值,此時循環(huán)數(shù)稱為Ct值(Cycle Threshold),Ct值與模板起始濃度的對數(shù)值成反比線性關(guān)系,因此可用于定量模板起始濃度;在平臺期,擴(kuò)增產(chǎn)物已不再呈指數(shù)級的增加,PCR的終產(chǎn)物量與起始模板量之間沒有線性關(guān)系,無法用于定量分析。
主要類型與定量方法
qPCR所使用的熒光化學(xué)材料可分為兩大類:熒光染料和熒光探針。熒光染料以SYBR Green I為主要代表,是非特異性熒光化學(xué)材料,能夠與雙鏈DNA小溝結(jié)合并發(fā)出熒光,信號強度與PCR擴(kuò)增的DNA量成正比。熒光探針包括TaqMan、分子信標(biāo)等,屬于特異性熒光材料。TaqMan探針技術(shù)通過設(shè)計特異性探針,在PCR擴(kuò)增過程中被切割釋放熒光信號,實現(xiàn)高特異性和準(zhǔn)確性的定量分析。
定量方法包括絕對定量和相對定量。絕對定量是通過繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品來計算未知樣品的起始拷貝數(shù);相對定量則是通過比較不同樣本中同一目的基因的相對表達(dá)量來分析基因表達(dá)差異。
應(yīng)用領(lǐng)域
qPCR技術(shù)已廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)等多個領(lǐng)域。在分子生物學(xué)研究中,qPCR技術(shù)可用于基因表達(dá)調(diào)控、基因組學(xué)和表觀遺傳學(xué)研究;在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,qPCR技術(shù)可用于腫瘤標(biāo)志物檢測、傳染病監(jiān)控及個性化醫(yī)療;在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域,qPCR技術(shù)可用于轉(zhuǎn)基因作物的定性檢測、品系鑒定及轉(zhuǎn)基因成分含量的檢測。
結(jié)論
實時熒光定量擴(kuò)增系統(tǒng)(qPCR)以其高靈敏度、特異性和準(zhǔn)確性,在核酸定量分析中發(fā)揮著重要作用。隨著技術(shù)的不斷進(jìn)步,qPCR系統(tǒng)的功能和性能也在不斷提升,為科研人員提供了更加高效、精準(zhǔn)的實驗工具。未來,qPCR技術(shù)有望在更多領(lǐng)域發(fā)揮重要作用,推動科學(xué)研究的深入發(fā)展。
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