賽默飛QuantStudio1實時熒光定量PCR(qPCR)儀支持多種熒光檢測方法,其核心原理基于染料法(如SYBR Green)和探針法(如TaqMan),通過熒光信號的變化實時監(jiān)測PCR擴增過程,從而實現(xiàn)對目標核酸的定量分析。以下是其試劑和染料的工作原理:
一、染料法(SYBR Green)
1、原理:
SYBR Green是一種可嵌入DNA雙鏈小溝的熒光染料,在游離狀態(tài)下幾乎不發(fā)光,但一旦與雙鏈DNA(dsDNA)結(jié)合,熒光信號增強約1000倍。
2、特點:
優(yōu)點:成本低,適用于任何PCR產(chǎn)物(無需特異性探針)。
缺點:會結(jié)合所有雙鏈DNA(包括引物二聚體和非特異性產(chǎn)物),需通過熔解曲線分析(HRM)驗證擴增特異性。
3、QuantStudio1適配性:
已校準支持FAM/SYBR Green I通道(激發(fā)/發(fā)射波長:~497/520 nm)。
二、探針法(TaqMan)
1、原理:
TaqMan探針是一種寡核苷酸,5′端標記報告熒光基團(如FAM、VIC),3′端標記淬滅基團(如TAMRA)。
當探針完整時,熒光基團的信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,Taq DNA聚合酶的5′→3′外切酶活性切割探針,使熒光基團與淬滅基團分離,釋放熒光信號。
2、特點:
優(yōu)點:特異性高(僅靶序列擴增時產(chǎn)生信號),支持多重檢測(不同探針標記不同熒光基團)。
缺點:探針合成成本較高。
3、QuantStudio1適配性:
支持FAM、VIC、ROX等熒光通道,可同時檢測3種靶標(如FAM/VIC/ROX三通道檢測)。
三、被動參照染料(ROX校正)
作用:
ROX是一種不與DNA結(jié)合的熒光染料,用于校正孔間差異(如加樣誤差、耗材透光度差異)。
QuantStudio1內(nèi)置ROX校準功能,提高數(shù)據(jù)準確性。
四、熒光檢測系統(tǒng)
QuantStudio1采用:
白光LED光源(寬光譜激發(fā))和 CMOS成像系統(tǒng),實現(xiàn)96孔同步檢測,避免逐孔掃描的時間誤差。
濾光片配置:FAM、VIC、ROX三通道,覆蓋常見熒光染料需求。
五、總結(jié)
QuantStudio1通過染料法和探針法實現(xiàn)高靈敏度(可檢測1.5倍差異)和多重檢測(3通道),結(jié)合ROX校正和同步成像技術(shù),確保數(shù)據(jù)精準可靠。用戶可根據(jù)實驗需求選擇SYBR Green(經(jīng)濟通用)或TaqMan探針(高特異性多重檢測)。
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