揭示RNA所起細胞作用的計算機程序

揭示RNA所起細胞作用的計算機程序
美國中佛羅里達大學助理教授Shaojie Zhang使用一種復雜的計算機程序分析RNA基序，即組成RNA的亞單元。

RNA與DNA和蛋白質是生命的三種構建單元。知道這三種構建單元如何合作和如何發(fā)生偏差將有助于理解是什么導致疾病以及如何治療它們。

多虧人類基因組計劃，人們已經發(fā)現(xiàn)很多關于DNA的信息，但是關于RNA方面的信息人們知道不太多。RNA像DNA一樣輔助編碼基因。一些病毒也使用RNA作為它們進行復制的主要遺傳來源。各種各樣的RNA參與所有過程，包括蛋白合成，控制基因表達和將身體某一部分的細胞信號傳送到另一部分。

組成RNA的基序像長的手風琴那樣進行折疊，而且結構可變。在過去，人們已鑒定出很多基序，但是直到現(xiàn)在找出一種快速自動化的方法確定不同類型基序的結構模式一直難以實現(xiàn)。

Zhang說，“我們利用我們開發(fā)的新計算方法發(fā)現(xiàn)了很多新的RNA結構基序。這一突破能夠極大地增加我們對RNA結構基序的知識。而且新發(fā)現(xiàn)的基序可能有助于我們能夠開發(fā)出治療某些疾病的方法。”

Zhang的研究結果發(fā)表在Nucleic Acids Research期刊上。

利用計算機，Zhang和他的研究小組已能夠觀察這些RNA的類似手風琴那樣的結構和它們如何在三維尺度上進行折疊。這種計算機程序能夠很快地掃描很多RNA樣品和發(fā)現(xiàn)*的形成結構模式的基序。這種信息能夠給研究人員提供關于它們功能方面的有用信息。

Zhang說，“這有助于解釋生物如何工作和為什么它有時發(fā)生錯誤，從而導致一些致命性的疾病產生。”