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陽離子色譜柱的操作壓力，氣動(dòng)和儲(chǔ)放基本與陰離子色譜柱相似，一般陽離子色譜貯備液均采用淋洗液，但對于羧酸型陽離子色譜柱，為了避免色譜固定相產(chǎn)生酯，不能采用醇類作為流動(dòng)相成分，一般也不用堿作為流動(dòng)相成分，特別是硅膠型基質(zhì)的固定相。
對于離子色譜柱的清洗，主要可分為以下兩種情況：
（一）高價(jià)陽離子和酸溶性組分的清洗
1 配合1mol/l HCL清洗液；
2 斷開抑制器，如果系統(tǒng)含有保護(hù)住和分離柱，將保護(hù)柱接在分離柱之后；
3 設(shè)置泵的流速對4mm色譜柱為1.0ml/min；對2mm色譜柱為0.5ml/min；
4 用10mmol/l HCl沖洗色譜柱15min；
5 用清洗液通色譜柱60min；
6 用10mmol/l HCl沖洗色譜柱；
7 用淋洗液平衡色譜柱30min；
8 重新連接抑制器到色譜柱和保護(hù)柱。
（二）親脂性陽離子和有機(jī)污染
1 斷開抑制器，將色譜柱直接與泵相連；
2 設(shè)置泵的流速對4mm色譜柱為1.0ml/min；對2mm色譜柱為0.5ml/min；
3 如果對梯度泵分別設(shè)置100mmol/l HCl和90%乙腈，用梯度洗脫色譜柱，如果沒有梯度泵則分別用這兩種清洗液清洗色譜柱；
4 重新連接色譜柱，用淋洗液重新設(shè)置平衡色譜柱。
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