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如何選購抗體!

來源:上海浩宏生物科技有限公司   2010年09月08日 14:38  

1.該定制單抗還是多抗?
首先應(yīng)該考慮的就是定制的抗體是應(yīng)用于什么實(shí)驗(yàn),需要的量是多少?

對于科研用戶來說
1. 抗體常常應(yīng)用于WesternBlotting、IP等實(shí)驗(yàn)中,對于抗體的特異性有一定的要求,但并不是特別的強(qiáng)調(diào)
2. 往往在研究很多新的蛋白時,并不確定新蛋白是否很重要,是否會是將來很長一段時間的研究重點(diǎn),所以抗體用量也不大所以針對科研用戶,在定制新的蛋白的抗體時,我們強(qiáng)烈建議首先制備多抗用于實(shí)驗(yàn),當(dāng)?shù)玫搅死硐氲膶?shí)驗(yàn)結(jié)果并需要長期的使用該抗體時再考慮制備單抗。當(dāng)然,如果您對該抗體的特異性要求特別高(多抗的特異性已無法滿足實(shí)驗(yàn)要求,比如應(yīng)用于流式細(xì)胞術(shù)等)時,還是應(yīng)該定制單抗

對于工業(yè)用戶來說
1. 抗體往往應(yīng)用于檢測定量實(shí)驗(yàn)或者功能性實(shí)驗(yàn),對于抗體的特異性要求非常之高
2. 目標(biāo)蛋白基本上都是已知的確定有相當(dāng)商業(yè)開發(fā)價值的,而且產(chǎn)品一旦形成,用量會非常大所以針對工業(yè)用戶,基本上可以直接定制單抗

2.該選多肽還是蛋白作為抗原呢?

需要根據(jù)抗體應(yīng)用于什么實(shí)驗(yàn),以及您所能獲得的材料來決定
 
 1. 實(shí)驗(yàn)過程中蛋白處于天然狀態(tài),這時使用的抗體識別的一般是蛋白的構(gòu)象表位和線性表位;這樣的實(shí)驗(yàn)主要有CO-IP、FACS、Neutralizing/Blocking以及Elisa法檢測天然蛋白等
2. 實(shí)驗(yàn)過程中蛋白處于變性或半變性狀態(tài),這時大部分的構(gòu)象表位已被破壞,抗體識別的一般都是線性表位;這樣的實(shí)驗(yàn)主要有:Western、IHC/ICC/IF等以多肽作為抗原制備的抗體,識別的是線性表位,在使用時蛋白處于變性或半變性狀態(tài)下,結(jié)果可以令人滿意;但不能夠保證識別天然蛋白以蛋白作為抗原制備的抗體,識別蛋白的線性和構(gòu)象表位,基本上所有的實(shí)驗(yàn)都可以應(yīng)用,所以,用蛋白作為抗原應(yīng)是,但是在多肽抗原已可滿足實(shí)驗(yàn)要求而且得到蛋白有一定難度的情況下,以多肽作為抗原制備抗體更加合適。

3、什么情況應(yīng)該考慮用設(shè)計多肽做抗原?

答:如果氨基酸序列已知,但是由于基因克隆或表達(dá)等原因得不到抗原蛋白,或者僅需要得到針對抗原蛋白某幾個特定表位的抗體,就可以采用多肽合成的方式得到抗原。例如僅需要生產(chǎn)針對蛋白質(zhì)某個區(qū)域的特異抗體,比如研究蛋白質(zhì)N端的前體物,可以設(shè)計N末端的多肽抗原。如果抗體的使用目的是識別修飾的氨基酸,如磷酸化的絲氨酸、蘇氨酸或者酪氨酸,乙酰化賴氨酸等,就必須對多肽進(jìn)行相應(yīng)的修飾。一般情況下抗血清能夠識別用來免疫的多肽序列,但是不一定識別天然蛋白質(zhì)的折疊結(jié)構(gòu)。非連續(xù)性抗原的抗體能否識別抗原決定簇取決于用于抗體生產(chǎn)的多肽是否存在二級結(jié)構(gòu)。

4、設(shè)計多肽做抗原時的幾點(diǎn)基本原則?

答:識別區(qū)域的選擇原則一般說來的抗原性識別區(qū)域應(yīng)具備親水、位于蛋白表面和結(jié)構(gòu)上易變形性等特點(diǎn)。既要考慮其免疫原性、特異性,還需考慮其合成難度等。通常有以下幾點(diǎn)建議:1、序列長度在8-20個氨基酸殘基之間(如果太短,就有多肽太特殊、所產(chǎn)生的抗體與天然蛋白之間的親和力(結(jié)合能力)不夠強(qiáng)的風(fēng)險,同樣,如果序列長度超過20,將有可能引入二級結(jié)構(gòu),所產(chǎn)生的抗體失去特異性的可能,而且肽鏈越長,通常合成難度增大,不易獲得高純度的產(chǎn)品);2、盡可能是在蛋白表面;3、保證該段序列不形成α-helix;4、N,C端的肽段比中間的肽段更好;避免蛋白內(nèi)部重復(fù)或接近重復(fù)段的序列;5、避免同源性太強(qiáng)的肽段;6、交聯(lián)可以交聯(lián)在N,C兩端,選擇依據(jù)就是交聯(lián)在對產(chǎn)生抗體不太重要的一端;7、序列中不能有太多的Pro,但有一兩個Pro有好處,可以使肽鏈結(jié)構(gòu)相對穩(wěn)定一些,對產(chǎn)生特異性抗體有益。

5、原核表達(dá)含GST標(biāo)簽的蛋白制備抗體時,需要切掉GST標(biāo)簽嗎?

答:如果目的蛋白很大且之后的實(shí)驗(yàn)不受GST影響的話,GST標(biāo)簽是不用切掉的。但是如果目的蛋白小于20KD的話,建議通過實(shí)驗(yàn)切除GST標(biāo)簽。

6、抗體的保存:

答:小包分批,避免多次反復(fù)凍融。短期:4度冰箱保存。長期:-20度,一般需要加入甘油,BSA等。

7關(guān)于抗原的常識

答:對抗原的要求是純度越高越好,尤其是初次免疫所用的抗原。如為細(xì)胞抗原,可取1×107個細(xì)胞作腹腔免疫。可溶性抗原需加*福氏佐劑并經(jīng)充分乳化,如為聚丙烯酰胺電泳純化的抗原,可將抗原所在的電泳條帶切下,研磨后直接用以動物免疫。還有一些半抗原,如多肽,在免疫之前是需要耦聯(lián)一些蛋白,如KLH,BSA等。 病毒類的抗原,可以直接用于免疫。如果是蛋白,一般來說,蛋白的純度要在90%以上,濃度在1mg/ml以上,分子量>10kd。一般融解在無毒的緩沖液中 ,建議溶解在PBS中。

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