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化學(xué)蛋白組學(xué)

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    2025年07月08日
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蛋白分析,樣品制備,蛋白性質(zhì)分析,蛋白質(zhì)組學(xué)分析,糖組學(xué)分析
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北京百泰派克生物科技有限公司
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化學(xué)蛋白組學(xué)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

化學(xué)dànbáizhì組學(xué)是化學(xué)生物學(xué)研究的重要手段之一,有別于以往對(duì)dànbáizhì進(jìn)行定性或者定量鑒定的dànbáizhì組學(xué)技術(shù),化學(xué)dànbáizhì組學(xué)旨在通過(guò)一系列功能各異的化學(xué)探針,結(jié)合dànbáizhì組學(xué)技術(shù),解決復(fù)雜體系如細(xì)胞裂解液、活細(xì)胞、組織中的dànbáizhì如何與小分子藥物相互作用的問(wèn)題,目前已被廣泛應(yīng)用于小分子藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)、藥物先導(dǎo)化合物的篩選等研究中。


化學(xué)dànbáizhì組學(xué)的一般流程是將親和基質(zhì)或報(bào)告基團(tuán)的化學(xué)探針與dànbáizhì組進(jìn)行孵育,利用親和純化等方法富集與探針結(jié)合的蛋白,再通過(guò)質(zhì)譜等其他輔助技術(shù)來(lái)分析。常用的基于化學(xué)dànbáizhì組學(xué)的小分子藥物靶點(diǎn)研究方法有兩種,分別是以活性探針為基礎(chǔ)的dànbáizhì譜分析(Activity-based protein profiling, ABPP)和以化合物為中心的化學(xué)dànbáizhì組學(xué)(Compound-centric chemical proteomics, CCCP)。


圖1 ABPP和CCCP技術(shù)流程


ABPP:ABPP的原理是利用活性藥物分子進(jìn)行修飾合成探針,這些探針能夠與靶標(biāo)dànbáizhì結(jié)合并影響其活性。ABPP通過(guò)合成帶有反應(yīng)基團(tuán)和標(biāo)記物的探針,利用這些探針與dànbáizhì發(fā)生相互作用,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)dànbáizhì功能的研究。ABPP的優(yōu)勢(shì)在于它標(biāo)記的是酶的活性形式,而不是非活性形式,因此特別適用于分析不同細(xì)胞類(lèi)型和組織的酶活性,以及檢測(cè)正常狀態(tài)和疾病狀態(tài)之間的差異。此外,還經(jīng)常用于藥物靶點(diǎn)的篩選。


CCCP:CCCP的原理是將藥物分子進(jìn)行修飾后引入標(biāo)簽分子,然后固定到基質(zhì)上(如瓊脂糖凝珠或其他樹(shù)脂),富集可以與藥物分子結(jié)合的dànbáizhì,然后通過(guò)質(zhì)譜技術(shù)進(jìn)行鑒定。與ABPP相比,CCCP不需要提供dànbáizhì的活性狀態(tài)的直接信息,并且作為一種更加沒(méi)有導(dǎo)向性的方法,CCCP可以鑒定出意料之外的生物分子,包括不具有酶功能的dànbáizhì,故可用于探索wánquán未知的新奇藥物靶點(diǎn)。同時(shí),CCCP具有高通量特性,能夠同時(shí)分析多個(gè)化合物與細(xì)胞提取物或活細(xì)胞中的dànbáizhì相互作用。


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